G206284 (LOC106561640)


Basic Information

Item Value
gene id G206284
gene name LOC106561640
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 93934433 ~ 93940323 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU233420
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>TU233423
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>TU233426
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Function

NR:

description
neuronal cell adhesion molecule-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU233420 False 2460 lncRNA 0.36 2 93934433 93936920
TU233423 False 5420 lncRNA 0.43 3 93934519 93940323
TU233426 True 5255 lncRNA 0.37 2 93934519 93940323

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118936881 NA coding upstream 212671 93716089 ~ 93721762 (+)
LOC118936880 NA coding upstream 310348 93623033 ~ 93624085 (+)
LOC110502396 LOC105018284 coding upstream 557528 93373307 ~ 93376905 (+)
LOC110499974 LOC106561627 coding upstream 598915 93270955 ~ 93335518 (+)
ric8a ric8a coding upstream 849548 93068836 ~ 93084885 (+)
LOC110500011 LOC106561648 coding downstream 205340 94145663 ~ 94149467 (+)
dnm1l LOC106561645 coding downstream 210108 94150431 ~ 94172796 (+)
LOC110500081 NA coding downstream 323686 94264009 ~ 94268751 (+)
zgc:136858 LOC106561644 coding downstream 330237 94270560 ~ 94300044 (+)
LOC110500101 LOC106561643 coding downstream 359846 94300169 ~ 94317655 (+)
G206276 NA non-coding upstream 5729 93928316 ~ 93928704 (+)
G205722 NA non-coding upstream 9263 93856661 ~ 93925170 (+)
G205748 NA non-coding upstream 34906 93899218 ~ 93899527 (+)
G205728 NA non-coding upstream 57570 93870862 ~ 93876863 (+)
G205706 LOC106561641 non-coding upstream 98593 93833515 ~ 93835840 (+)
G206325 NA non-coding downstream 49120 93989443 ~ 93990119 (+)
G206377 NA non-coding downstream 143431 94083754 ~ 94084199 (+)
G206388 NA non-coding downstream 157922 94098245 ~ 94100411 (+)
G206418 NA non-coding downstream 203261 94143584 ~ 94143821 (+)
G206419 NA non-coding downstream 204136 94144459 ~ 94144932 (+)
G205688 NA other upstream 122264 93810360 ~ 93812169 (+)
G205683 LOC106573085 other upstream 135497 93796082 ~ 93798936 (+)
G205482 NA other upstream 532199 93401617 ~ 93402234 (+)
G205404 NA other upstream 545883 93371393 ~ 93388550 (+)
LOC110499942 LOC106561637 other upstream 1096306 92837196 ~ 92839440 (+)
G206285 NA other downstream 163 93940486 ~ 93941471 (+)
G206389 LOC106561642 other downstream 160656 94100979 ~ 94101872 (+)
LOC110500139 LOC106561672 other downstream 462268 94391364 ~ 94437682 (+)
G206850 NA other downstream 616846 94557169 ~ 94562224 (+)
G206908 NA other downstream 691506 94631829 ~ 94632267 (+)

Expression


Co-expression Network