G210408


Basic Information

Item Value
gene id G210408
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 98697168 ~ 98700392 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU238408
TGTAAGCAAAAACGATCCTGAATCAGATGCTTGATGCTTTAGTTTCTTATCTTGGCATTACCAATTAAAAAAAGTCTAACTTACCAGTGTGCTCAGTTTGTGTTCCTCTGACGAAGGTTCTTGTCTTTGTGATTGTTGGTGGAATTAGTTTTCATTGGTCCAGCTGGTTCGTCATCTGATGCACAAAGGGAAAACATAGAGAAATGAAGACAAATGAACAAAATGGTGCACGCTGATGGTGAAATGGCAATTTGTTATGGTAGAAAGTACGTCTAAAAATAAGCAATGTGTTACGGTGGTAATGCGACTGTAACATCTTGCCTGGTTGGAGGCTCGGTCGAACGATGTTCAAAGACAGTTCTGCGTGTTCCAATAGTTCCATCATTTTGGAATTGAACTTAGTTCCATAAGTGGAATTAAAAGGGCAATTTCACATATTCATAATCTCCCGCATCACTCCAACATTAACATGCAGTGTGTGAAAATGGAGCGTCTTTATGTTTTGtagtagtaaaaaaataaagaaaggaAGATTAgttgtttccaatgacatcagtGTACATATTTTGATTTTAAACAATTATGAATATGCATCGATTACTAATTAAAAAATACTCATTGTCTACTAATTGTCCACTAAATGTCTACATATTGGTTAATGATGTCATTCAAAACACTTAtcttgattatggcagcccccgggcccccccaacctcacctctctgactcagaggggttgggttaaatgtggtagacacatttcagttgaaggccttcagttgtacaactgactaggtatccccctctccctttccctctctctttttaactacaaaaacatagaaacacgccattttcacatatgttgatgttggggtggtgctggagatgatgaatatgaagttgaaacatTTTCTATATGTCCCTTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATATGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATATGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATATGTGGAATTCAGTTAAATTCCATATGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATATGTGGAATTCAGTTAAATTCCATATGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTAAAATTCCATATGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATATGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGTAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATGTGTGGAATTCAGTTAAATTCCATAAGTGGAAT

Function

NR:

description
uncharacterized protein LOC111610030 isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU238408 True 2003 TUCP 0.38 3 98697168 98700392

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110500756 pk coding upstream 64060 98613750 ~ 98633108 (+)
LOC110500731 LOC106561719 coding upstream 124404 98540412 ~ 98572764 (+)
gp137 gp137 coding upstream 243202 98437885 ~ 98453966 (+)
LOC118943874 tspan18 coding upstream 427725 98161662 ~ 98269443 (+)
LOC118936883 NA coding upstream 604656 98091289 ~ 98092512 (+)
LOC118936885 NA coding downstream 98340 98798732 ~ 98799869 (+)
LOC110500657 parp16 coding downstream 154293 98854685 ~ 98868361 (+)
LOC110510476 LOC106561728 coding downstream 198103 98897524 ~ 98944948 (+)
LOC118944192 NA coding downstream 207050 98907442 ~ 98907622 (+)
LOC118944193 NA coding downstream 229965 98930357 ~ 98930537 (+)
G210387 LOC106561724 non-coding upstream 53164 98643690 ~ 98644004 (+)
G210385 NA non-coding upstream 55878 98641076 ~ 98641290 (+)
G210384 NA non-coding upstream 56211 98640577 ~ 98640957 (+)
G210383 NA non-coding upstream 56611 98639999 ~ 98640557 (+)
G210376 NA non-coding upstream 91551 98605411 ~ 98605617 (+)
G210406 LOC106584712 non-coding downstream 6423 98706815 ~ 98714503 (+)
G210449 NA non-coding downstream 83930 98784322 ~ 98785541 (+)
G210450 NA non-coding downstream 85486 98785878 ~ 98786332 (+)
G210452 NA non-coding downstream 87053 98787445 ~ 98788982 (+)
G210453 NA non-coding downstream 88699 98789091 ~ 98789314 (+)
G209759 NA other upstream 739332 97957244 ~ 97958896 (+)
G209636 NA other upstream 924403 97740061 ~ 97772765 (+)
LOC110500822 LOC106561728 other upstream 997392 97695939 ~ 97711108 (+)
G209591 NA other upstream 1078079 97618617 ~ 97619089 (+)
G209586 NA other upstream 1210396 97486476 ~ 97486772 (+)
G210484 NA other downstream 202396 98902788 ~ 98926406 (+)
G210823 LOC106561768 other downstream 536986 99237378 ~ 99238258 (+)
G210983 LOC106561766 other downstream 1019787 99720179 ~ 99721983 (+)
LOC110502581 LOC106561777 other downstream 1104776 99777695 ~ 99818794 (+)

Expression


Co-expression Network