G212674


Basic Information

Item Value
gene id G212674
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 101509760 ~ 101516104 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU241453
CAGGAAACTCCAGTTCTGAATCAGATGCACCAAATAGTTAATCACTCTGTTAATATGACTGTCTATTTAGTCCACGAGATTCTGCACACACTTCCCTGATGGCTGTGTCCTGGtgtgtcctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggctatgtccctggttatgtcctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggctatgtcctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctgttgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggtgtatcctggctatgtcctggtgtatcctggctatgtcctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggctatgtcctggtgtatcctggctatgtcctggtgtatcctggctatgtcctggtgtatcctggctatgtccctggtatatcctggctatgtccctggtgtatcctggctatgtcctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggtgtatcctggctatgtccctagtgtatcctggctatgtcctggtgtatcctggctatgtcctggtgtatcctggctctctccctggtgtatcctggcgaTGCCCTGGtatatcctggctatgtcctggtgtatcctggctatgtccc
>TU241455
CAGGAAACTCCAGTTCTGAATCAGATGCACCAAATAGTTAATCACTCTGTTAATATGACTGTCTATTTAGTCCACGAGATTCTGCACACACTTCCCTGATGGCTGTGTCCTGGtgtgtcctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggctatgtcctggtgtatcctggctatgccctggtgTATCCTGGCTAtgccctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggctatgtccctggctacgtcctggtgtatcctggctatgtcctggtgtatcctggctatgtcctggtgtatcctggctatgtccctggtgtatcctggctatgtcctggtgtatcctggctatgt

Function

NR:

description
zinc finger E-box-binding homeobox 2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU241453 False 830 TUCP 0.52 2 101509760 101510842
TU241455 True 364 TUCP 0.51 2 101509760 101516104

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
best1 LOC102229874 coding upstream 138586 101345285 ~ 101371174 (+)
LOC110501031 LOC106592222 coding upstream 544974 100929368 ~ 100964786 (+)
LOC118936893 NA coding upstream 650498 100848174 ~ 100860603 (+)
LOC110502612 LOC106584763 coding upstream 661419 100785531 ~ 100848341 (+)
sigirr sigirr coding upstream 854154 100638574 ~ 100655606 (+)
LOC110516669 LOC106590745 coding downstream 118526 101634630 ~ 101695484 (+)
LOC110502669 LOC107698134 coding downstream 521934 102038038 ~ 102167821 (+)
LOC110501421 LOC106561865 coding downstream 668255 102184359 ~ 102238260 (+)
LOC110501429 LOC106561864 coding downstream 746013 102262117 ~ 102278883 (+)
LOC110501451 LOC106561861 coding downstream 791393 102307497 ~ 102314434 (+)
G212659 NA non-coding upstream 16726 101491762 ~ 101493034 (+)
G212660 NA non-coding upstream 17129 101491887 ~ 101492631 (+)
G212656 NA non-coding upstream 22964 101482181 ~ 101486796 (+)
G212654 NA non-coding upstream 32010 101477538 ~ 101477750 (+)
G212652 NA non-coding upstream 34800 101474756 ~ 101474960 (+)
G212668 NA non-coding downstream 28054 101544158 ~ 101579963 (+)
G212690 NA non-coding downstream 38320 101554385 ~ 101561158 (+)
G212693 NA non-coding downstream 49066 101565170 ~ 101566409 (+)
G212699 pnpla2 non-coding downstream 62557 101578661 ~ 101579068 (+)
G212705 NA non-coding downstream 69076 101585180 ~ 101589863 (+)
G211809 LOC107574289 other upstream 1041603 100467678 ~ 100468157 (+)
G211779 NA other upstream 1047779 100459657 ~ 100461981 (+)
LOC110500919 LOC106584740 other upstream 1609883 99896619 ~ 99899881 (+)
LOC110502581 LOC106561777 other upstream 1695385 99777695 ~ 99818794 (+)
G212863 NA other downstream 226795 101742899 ~ 101745974 (+)
G213051 NA other downstream 661305 102177409 ~ 102177918 (+)
G213055 NA other downstream 722199 102238303 ~ 102239540 (+)
G213185 NA other downstream 998103 102514207 ~ 102516302 (+)

Expression


Co-expression Network