LOC110520734 (LOC106605972)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110520734
gene name LOC106605972
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 3494116 ~ 3507117 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036965926.1
ctcttgaatgagtagatgttataaaacgtttgaccggtagtgtatgtttaTTAATTTAGTGACTAAGGGCCCTAGAGACATGTCTCTGTGaatgcagaggagaggagacgtgggGACGTGGGAAGGGTTGACGACAACAGCTGCCTCCcacatggcatcctattccctatatagctcaCTTTTTGAccagcactatatagggagtagggttccaTTTTTGGGACGCACACAACGTCTCTAATTATTCACATTAGTGATTACCCTGCAGCTGTCTGACGCCAAGCCTCAGCGGCTGGCTGCTAAATCATATTTGGCACCGTCGTTATCAGTTGTTTAGGGAAGTGGAGCGAGACAGGAGATTGTAATCCCTGATTGCAATGAACTGAAGTTTGGAGTCAGTTTGTGTCTTCTCTCAAGAAGAACGGTGGGGAGATGGAGATTTACGTCTACAGTAcccgtgtctgtgtgtggtgtgtgaaaTATACGCCAAATTAACATtatatacagtaggcctatattaagACCTTGTTCTATAACTCTGTGCTATTCAGAGGTGATGCCTGTGTTCCACCTTGTTCTGTTACTCAGTCTTTTCAGAGATGATGCCTGTGTTCCACCTTGTTCTGTTACTCAGTCTATTCAGAAATGATGACTGTGTTCAACCTGGTTCTGTTACTCAGTCTATTCAGAGACGATGGCTGTGTGTTCAACCTTGTTCTGTTACTCAGTCTATTCAGAGATGATGGCTGTGTTCAACCTTGTTCTGTGACTCAGTCTATTCAGAAAAGATGGCTGTGATCAACCTTGTTCTGTTTCTCAGTCTATTCAGAGATGATGGCTGTGTTCAACCTTGTTCTGTTTCTCAGTCTATTCAGAGATGATGGCTGTGTTCAAACCTTGTTCTGTTTCTCAGTCTATTCAGAGATGATGGCTGTGTTCAACCTTGTTCTGTTACTCAGTCTATTCAGAAATGATGGCTGTGTTCAACCTTGTTCTGTTACTCAGTCTATTCAGAAATGATGGCTGTGTTCAACCTTGTTCTGTTTCTCAGTCTATTCAGAAATTATGGTTGTGTTCAACCTTGTTCTGTTTCTCAGTCTATTCAGAGATGATGGCTGTGTTCAACCTTGTTCTGTTACTCAGTCTATTCAGAGATGATGGCTGTGTTCAACCTTGTTCTGTTACTCAGTCTATTCAGAGATGATGGCTGTGTTCAACCTTGTTCTGTTACCTAGTCTATTCAGAGATGATGGCTGTGATCAACCTTGAATATTTGCCAACTTTAGCCTACAACACCAACATCCCCCTTACTTAATCCCTGGCAAATGAAACAGACCCCCTTTAGACAAGCTGTTAGAAAGGTCCTGATAACATCCTGAAGCTCCTCAGACTTTAATTTTCCTCTCCCATTCAGCAGCACCAGAAATCATCTGTCCTGTATATCATATGGTTCCCATTGGTTCAGCTGGAGGGTattgttccaaatggcaccctattccctatgtagtgcactaaatttgaccagagccctatgggtagtggtcaaatgtagtgcactatatacagtagggagtaTGGTGTCagagtactacagtatatagggattgggtgccatttgggagtagCTCTAATGTGTGTGAGTAATGCAGGGGAGGTGTGTTTACTTACATTACTGTCATCTTTTGTGTTTTAATTCACTCACTTCCTCTGCACGGCGCACACAGCAGCCTGGAGGAGAATATCCACACGCATTTCAAAGTTGTCTTTGCAGCCTGTAGCTTTTACAGCATCGCtcttagggttgcaaaattctggtaacgAAGAATAAATTCCCAGATTGTCCAGAATACCTAGTTGGAAGATTCTGAATTTCTTGATTCCCTCCTGATTTCAGAAATCCTCTAACTGGGTTTttgggaaaaccagggaatttattgattattccctcctgatttcaGAAATCCTCTAACTGGGTTTttgggaaaaccagggaatttattgattattccctcctgatttcaGAAATCCTCTAACTGGGTTTtcgggaaaaccagggaatttattgattattccctcctgatttcaGAAATCCTCTAACTGggttttctggaaaaccagggaatttattgaaagttcccagaattttGCAACTCTAGCTCTGACAGAAAGCAGAACCCTCCGACTGGGTCTGAACTGACATAGGCAGAAGAAGAAGATGGAGTATTTTTccattgtcatttttttgtgcaattggttcaatgggATGATACCCAGTTGTCCTTCATCTTTTCACATGGTTTTCTATAACAGGACGTTTCCATTGAGTGAAAGTCCCTCCTGGTTTCAAGTGGGTTAATGACTGAGATGATTAATGACATGTGGAAATTGTCTCTACCCCCTTAGTTCATATAAATGCCAAAATTACATATTTATTTTCTGACCTCAACCAGTTTCACAACTGTTCAGTTAACCATGACACTTGTTGTCTAATGTTAAGGTATTGCTTCTAGGGCCCTTGGGGTTCATTTTGATCCAGCACCAGAAGATACAACTGCCTCCATACTCGCCCTACAGCCCAACAGTCTGTCTCACTGGTGTGGTATGAGATGTTTAATGTACGAGTTTGTTTTACCGTTCTCCCATCACTTACTTAGTTTATTGAAAGATCACAGGAGCCTACATGAATATGAAGTCATCCTGCAGCGAAGGGTCTGTCTAAACAACACTTAGAATGTCCTCAAACGTTCAATTCATGATGTCCAGTCCGAACCACTTGGACTGGAATGAAACAAACATTCAACCAGCGTCTCTTGGACATTGCAGGCAACAGAGTTCTAATTCCATGTCAGAAGTAGAGTTGCCTGCTTTAGATCCAGTCCAGTATATACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATATACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATATACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATATACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATATACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATATACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATGTATACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATATACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATGTACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATGTACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATGTATACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATGTATACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATATACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATGTACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATGTATACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATGTATACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATGTATACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATATACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATATACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATGTATACCTTAACTCAGGTCTATAGATCCAGTCCAGTATATACACCTTAACTCAGGTCTGTAGATCCAGTCCAGTATGTACACCTTAACTCAGGTCCAGCAGAGTAGGGGTCCTTTTTTGGTAGTGGGGGGCGATGTGCTGTGTTTGGTTCCTGCTCATTTTCAGGAGGGACCATTCAATGAAACACAGCTCCCTGGGCTTTGTCATGGTGACACAATGTTTAGGGGGCTGGGACGAGAAGAGTTGACTAGGACTGTATTAGGCTGGTGATCTCCAATGCCCAGAGACAGTTCATAGTAAACACCCTGGGAAGATAGGTAACACTTGTGTTGCTATTTTACCTGTGTAATAACACTGTAATTAAACCAGTAACAGACTTGTATTAGCATGTTGTTACATAATACTTTAGTAAATACATTATTTTGACCGTTTCAATAATGCAACTGGTTTGATACCTCAAAATGAGTCAGCACAGCTCACAGCAATAGACTTTTCAGCTCATTCTGCTGAACATCAATACTTTTTGTGTGATAACAGAGTACTGACAGTGCAAGAGAAATGAGGTCCCTAAcaggaaatgtggaaaaagttgagacTCATTCTGGAAGATGAATGTGTCTAGAAGAGGTTCACTCATGGGTCATTACTTAGCTGGTACCAGAGACAGACTGGCCATAGGACAgttctggcaaatgccagatgggtcGTCCATCTTTAGCCCGGTGGGCCTGTCTGAATTGGGCTTTTTCTGGTGTTCCCCAGTCTGTCCCTGAGTGGTACTGTACTGAAATGATGTTTTCCAGTCTAGAAGTGTCAAGTGGAATCATCAAACTAACTTCTCACTTCAAATGATCTTTGTTATGATTCACTTTGGTTTTCCTTGCTAACTTAATGTTTGTATTGATGTAAATAATGGAATGTGTGTTTTAAAGAGATCCCAGATCTTGAGTTGAAATGTAGTCATATGTGCCTCATGGCTGTTATAGGAGGATGCCACTTGATTTTTCTCATTTGTATGAAACCTCTGAAATCAGCTTTTGTGAAAAAGACTTACCAATTTCCAGTTACTTTTTTTCAGTCTCACAGGAATAAATTCCGGGATATTCCACAAGACTGTATtcgcttcccaaatggcaccctattccctttatagcacACTATAGTgccccctggtcaaaagtagcgcactataaagggaacagggtgccatttaggaaacAGTCTGTGGTACAGAGAGTCCTTGTTTAGTGATGTCACAGTTCATGTAAACTTAGGAAGACTTCCTCTCTAAGTATCCTCAGCTAAAAGACCGGGGACCGGATTAGTTAGTGTGATGCTGAGCGGAAGAGCAGACAGGGAGGCtaaggcacagagagacagaactgtGGGGTTTCC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Function

NR:

description
G-protein coupled receptor 20 isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K04317 GPR20; G protein-coupled receptor 20

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036965926.1 True 7132 mRNA 0.44 3 3494116 3507117

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110520733 LOC106605973 coding upstream 2148 3459132 ~ 3491968 (+)
LOC118944810 NA coding upstream 3630 3487998 ~ 3490683 (+)
LOC110506902 LOC106573706 coding upstream 180644 3310514 ~ 3313472 (+)
LOC110506857 mroh1 coding upstream 251905 3202424 ~ 3242211 (+)
LOC110506827 LOC106573691 coding upstream 364059 3125511 ~ 3130057 (+)
LOC118936611 LOC106573422 coding downstream 491 3507608 ~ 3533097 (+)
LOC110520752 LOC106606080 coding downstream 27402 3534519 ~ 3556267 (+)
LOC110520760 LOC106606028 coding downstream 51163 3558280 ~ 3707777 (+)
LOC110507370 LOC106606027 coding downstream 218837 3725954 ~ 3733696 (+)
LOC110493965 LOC106573899 coding downstream 231218 3738335 ~ 3754296 (+)
G217081 NA non-coding upstream 125219 3368331 ~ 3368897 (+)
G217079 NA non-coding upstream 127903 3365829 ~ 3366213 (+)
G217074 NA non-coding upstream 132926 3360859 ~ 3361190 (+)
G217072 NA non-coding upstream 134614 3359030 ~ 3359502 (+)
G217220 NA non-coding downstream 179479 3686596 ~ 3688096 (+)
G217223 NA non-coding downstream 203680 3710797 ~ 3711204 (+)
G217244 NA non-coding downstream 292804 3799921 ~ 3802530 (+)
G217146 NA other upstream 12580 3480316 ~ 3481536 (+)
G216673 NA other upstream 385883 3106354 ~ 3108233 (+)
G216640 LOC106606088 other upstream 452599 3039986 ~ 3041517 (+)
LOC110506718 LOC102207154 other upstream 474282 3017105 ~ 3022686 (+)
G216438 NA other upstream 919217 2572395 ~ 2574899 (+)
G217809 LOC106593792 other downstream 635526 4142643 ~ 4143089 (+)
G217870 NA other downstream 790439 4297556 ~ 4302856 (+)
G217896 NA other downstream 944637 4451754 ~ 4452556 (+)

Expression


Co-expression Network