LOC110520784 (LOC106575322)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110520784
gene name LOC106575322
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 7016691 ~ 7045216 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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>TU251163
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Function


NR:

description
nuclear receptor ROR-gamma-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU251163 True 1369 lncRNA 0.43 2 7041016 7044360

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110508323 LOC106575347 coding upstream 28924 6979131 ~ 6988449 (+)
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LOC110507732 LOC106576036 coding upstream 205397 6794547 ~ 6811294 (+)
LOC100135938 LOC106575366 coding downstream 1519 7046735 ~ 7061832 (+)
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LOC110508390 LOC100194679 coding downstream 35234 7080450 ~ 7084314 (+)
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LOC110508400 NA coding downstream 64766 7109982 ~ 7113781 (+)
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G220189 NA non-coding downstream 62749 7107965 ~ 7108182 (+)
G218971 NA other upstream 297528 6717628 ~ 6719163 (+)
LOC110507851 acbd7 other upstream 385090 6624575 ~ 6631601 (+)
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G220435 NA other downstream 314452 7359668 ~ 7365285 (+)
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LOC110520790 LOC106606111 other downstream 1125491 8170634 ~ 8178058 (+)

Expression



Co-expression Network