LOC110513449 (LOC106580288)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110513449
gene name LOC106580288
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 21587450 ~ 21609130 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021593285.2
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>TU268652
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>TU268653
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>TU268651
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021593285.2 False 5400 mRNA 0.49 14 21588941 21609130
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TU268653 False 1123 lncRNA 0.48 1 21587450 21588572
TU268651 True 2113 lncRNA 0.38 1 21588714 21590826

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110513430 LOC106580258 coding downstream 1621 21551418 ~ 21587320 (-)
LOC110503882 LOC106580249 coding downstream 49754 21514538 ~ 21539187 (-)
LOC110503879 LOC106605450 coding downstream 119714 21457830 ~ 21469227 (-)
LOC110513321 LOC106580205 coding downstream 132969 21438546 ~ 21455972 (-)
LOC118946634 NA coding downstream 168663 21416211 ~ 21420278 (-)
LOC110513497 NA coding upstream 3024 21612154 ~ 21619661 (-)
LOC118944502 LOC106580547 coding upstream 107723 21716853 ~ 21718331 (-)
LOC118946878 NA coding upstream 135295 21744425 ~ 21755710 (-)
LOC110513558 LOC106580365 coding upstream 147527 21756657 ~ 21760819 (-)
pmvk pmvk coding upstream 275651 21884781 ~ 21891946 (-)
G234623 NA non-coding downstream 88010 21500650 ~ 21500931 (-)
G234620 NA non-coding downstream 91177 21497468 ~ 21497764 (-)
G234619 gnrh-r non-coding downstream 91802 21496830 ~ 21497139 (-)
G234617 gnrh-r non-coding downstream 95156 21493224 ~ 21493785 (-)
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G235145 NA non-coding upstream 178917 21788047 ~ 21789380 (-)
G235165 NA non-coding upstream 196400 21805530 ~ 21805751 (-)
G235157 NA non-coding upstream 274109 21883239 ~ 21919236 (-)
G234621 NA other downstream 90109 21498408 ~ 21498832 (-)
G234600 NA other downstream 118996 21469661 ~ 21469945 (-)
G234224 LOC106605437 other downstream 408259 21178597 ~ 21180682 (-)
glipr2l LOC106605424 other downstream 937245 20648378 ~ 20652052 (-)
G235092 LOC100194668 other upstream 129715 21738845 ~ 21743411 (-)
G235881 NA other upstream 964703 22573833 ~ 22574989 (-)
G237047 NA other upstream 1547979 23157109 ~ 23189031 (-)
LOC110514600 ensa other upstream 2162394 23771511 ~ 23780158 (-)

Expression


Co-expression Network