XLOC_021628



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_021628
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 20345310 ~ 20361426 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00044813
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Function


GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00044813 True 16117 lncRNA 0.34 1 20345310 20361426

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_021627 AL953864.1 coding upstream 157571 20187625 ~ 20187739 (+)
XLOC_021626 tnnc1b coding upstream 232714 20110086 ~ 20112596 (+)
XLOC_021625 cfap126 coding upstream 363497 19977120 ~ 19981813 (+)
XLOC_021624 emd coding upstream 523087 19813677 ~ 19822223 (+)
XLOC_021623 flna coding upstream 536283 19759128 ~ 19809027 (+)
XLOC_021629 TNNC2 coding downstream 46801 20408227 ~ 20420243 (+)
XLOC_021630 tnnc2 coding downstream 61235 20422661 ~ 20427299 (+)
XLOC_021631 slc35c2 coding downstream 69714 20431140 ~ 20511954 (+)
XLOC_021632 CR352228.2 coding downstream 110329 20471755 ~ 20471870 (+)
XLOC_021633 dpm1 coding downstream 151678 20513104 ~ 20517692 (+)
XLOC_021614 NA non-coding upstream 869159 19473396 ~ 19476151 (+)
XLOC_021613 CR388168.1 non-coding upstream 1126370 19217528 ~ 19218940 (+)
XLOC_021608 CR388168.2 non-coding upstream 1162922 19177891 ~ 19182388 (+)
XLOC_021607 NA non-coding upstream 1225867 19105546 ~ 19119443 (+)
XLOC_021651 NA non-coding downstream 1111676 21473102 ~ 21474482 (+)
XLOC_021656 CR847529.1 non-coding downstream 1262309 21623735 ~ 21623849 (+)
XLOC_021659 CR548634.2 non-coding downstream 1420151 21781577 ~ 21783450 (+)
XLOC_021660 NA non-coding downstream 1544627 21906053 ~ 21914926 (+)

Expression



Co-expression Network