LOC110516475


Basic Information

Item Value
gene id LOC110516475
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 26928593 ~ 26978577 (-)
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KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021594912.2 False 2265 mRNA 0.43 6 26970398 26978570
XM_036973683.1 False 2142 mRNA 0.43 7 26970398 26978570
XM_036973684.1 False 2139 mRNA 0.43 7 26970398 26978570
XM_036973685.1 False 2262 mRNA 0.43 6 26970398 26978570
XR_002472386.2 False 2168 mRNA 0.43 7 26970398 26978570
TU274912 False 6184 lncRNA 0.35 5 26928593 26978577
TU274913 True 1552 lncRNA 0.35 2 26928593 26966977

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110516494 NA coding downstream 30823 26933378 ~ 26939575 (-)
LOC110516351 LOC106605237 coding downstream 89356 26831176 ~ 26881042 (-)
LOC110516341 LOC106582531 coding downstream 152469 26812466 ~ 26817929 (-)
LOC110505184 LOC106582443 coding downstream 233929 26729074 ~ 26736469 (-)
LOC110516285 LOC106582421 coding downstream 254934 26691738 ~ 26715464 (-)
LOC110516606 LOC106605168 coding upstream 71422 27049992 ~ 27064472 (-)
LOC110516631 LOC106582601 coding upstream 92344 27070914 ~ 27097259 (-)
LOC110516644 LOC106582613 coding upstream 119970 27098540 ~ 27103054 (-)
LOC110516667 LOC106582624 coding upstream 132514 27111084 ~ 27127488 (-)
LOC110516655 LOC106582635 coding upstream 149529 27128099 ~ 27151658 (-)
G240545 NA non-coding downstream 4685 26911484 ~ 26965713 (-)
G240615 NA non-coding downstream 12300 26920762 ~ 26958098 (-)
G240546 LOC105031101 non-coding downstream 64306 26905117 ~ 26906092 (-)
G240601 NA non-coding downstream 79226 26889876 ~ 26891172 (-)
G240590 NA non-coding downstream 92382 26877236 ~ 26878016 (-)
G240630 NA non-coding upstream 2840 26981410 ~ 26981767 (-)
G240557 LOC106582493 non-coding upstream 13897 26992467 ~ 26994270 (-)
G240632 NA non-coding upstream 18490 26997060 ~ 26997405 (-)
G240559 NA non-coding upstream 22499 27001069 ~ 27001515 (-)
G240464 NA other downstream 295365 26674592 ~ 26675033 (-)
G240409 NA other downstream 400876 26569101 ~ 26569522 (-)
LOC110515750 LOC106582146 other downstream 1145641 25822812 ~ 25825108 (-)
LOC110515384 LOC106582009 other downstream 1734031 25171287 ~ 25236536 (-)
LOC110515208 LOC106581894 other downstream 2004190 24936516 ~ 25052970 (-)
LOC110516678 LOC106605187 other upstream 176998 27154680 ~ 27159987 (-)
G240906 NA other upstream 206090 27184660 ~ 27185105 (-)
G242021 LOC106582922 other upstream 1276587 28205275 ~ 28256509 (-)
LOC110516273 NA coding downstream 278603 26647025 ~ 26649990 (-)
G240588 NA non-coding downstream 53945 26874125 ~ 26874648 (-)
G240579 NA non-coding downstream 66626 26861762 ~ 26861967 (-)

Expression


Co-expression Network