zdhhc18a (zdhhc18)



Basic Information


Item Value
gene id zdhhc18a
gene name zdhhc18
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 36611815 ~ 36629130 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_021596793.2
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Function


symbol description
zdhhc18 Enables palmitoyltransferase activity. Involved in peptidyl-L-cysteine S-palmitoylation. Located in Golgi apparatus.

NR:

description
palmitoyltransferase ZDHHC18-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
tent5ba fam46b coding downstream 43262 36544170 ~ 36568553 (-)
LOC110504056 NA coding downstream 106476 36486875 ~ 36505339 (-)
LOC110519907 oprd1 coding downstream 174061 36436381 ~ 36437754 (-)
stmn1b LOC106584327 coding downstream 494271 36112187 ~ 36117544 (-)
LOC110519653 LOC106584320 coding downstream 502626 36102843 ~ 36109194 (-)
LOC110519930 LOC106584694 coding upstream 7199 36636329 ~ 36643205 (-)
LOC110519931 pigv coding upstream 30094 36659224 ~ 36664245 (-)
LOC110519933 NA coding upstream 35599 36664729 ~ 36686126 (-)
LOC110519934 gpn2 coding upstream 65905 36695035 ~ 36710909 (-)
gpatch3 gpatch3 coding upstream 102702 36731832 ~ 36754332 (-)
G252136 NA non-coding downstream 6161 36604263 ~ 36605654 (-)
G252260 NA non-coding downstream 19736 36591640 ~ 36592079 (-)
G252255 NA non-coding downstream 26343 36585238 ~ 36585472 (-)
G252251 NA non-coding downstream 28158 36583441 ~ 36583657 (-)
G252248 NA non-coding downstream 30167 36581391 ~ 36581648 (-)
G252237 NA non-coding upstream 29546 36658676 ~ 36659052 (-)
G252284 NA non-coding upstream 115910 36745040 ~ 36782278 (-)
G252299 NA non-coding upstream 138283 36767413 ~ 36821166 (-)
LOC110504063 serpind1 non-coding upstream 263403 36882314 ~ 36906191 (-)
G251681 NA other downstream 253844 36357325 ~ 36357971 (-)
G251462 LOC106584332 other downstream 467243 36140112 ~ 36144572 (-)
G249990 NA other downstream 1715519 34895958 ~ 34896296 (-)
G249978 NA other downstream 1721861 34889506 ~ 34889954 (-)
G249485 LOC106584080 other downstream 2252364 34357275 ~ 34359451 (-)
LOC110519955 LOC106586057 other upstream 2770131 39399261 ~ 39508811 (-)
G255911 NA other upstream 3015441 39644571 ~ 39645743 (-)
G256016 LOC106581772 other upstream 3189518 39818648 ~ 39818980 (-)
G256616 NA other upstream 3693376 40322506 ~ 40322898 (-)

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