LOC110519945 (LOC105007140)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110519945
gene name LOC105007140
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 38263798 ~ 38401288 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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Function


NR:

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Transposable element Tcb1 transposase

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LOC110519947 LOC106586044 coding upstream 375650 38776852 ~ 38778156 (-)
LOC110519948 mycbp2 coding upstream 394405 38795693 ~ 39140087 (-)
LOC110519952 snx25 coding upstream 830594 39231882 ~ 39252150 (-)
LOC110519953 LOC106586054 coding upstream 857503 39258791 ~ 39269466 (-)
LOC118954848 NA coding upstream 881221 39282509 ~ 39288215 (-)
G254009 NA non-coding downstream 56990 38206590 ~ 38206808 (-)
G253972 NA non-coding downstream 84555 38178992 ~ 38179243 (-)
G253963 NA non-coding downstream 89083 38174507 ~ 38174715 (-)
G253949 NA non-coding downstream 98833 38164644 ~ 38164965 (-)
G253916 NA non-coding downstream 118573 38145016 ~ 38145225 (-)
G254326 NA non-coding upstream 36255 38437543 ~ 38437876 (-)
G254335 NA non-coding upstream 52293 38453581 ~ 38453908 (-)
G254553 NA non-coding upstream 198794 38600082 ~ 38600376 (-)
G254554 NA non-coding upstream 199862 38601150 ~ 38601415 (-)
G254556 NA non-coding upstream 202383 38603671 ~ 38603983 (-)
gpatch3 gpatch3 other downstream 1530358 36731832 ~ 36754332 (-)
G251681 NA other downstream 1905827 36357325 ~ 36357971 (-)
G251462 LOC106584332 other downstream 2119226 36140112 ~ 36144572 (-)
G249990 NA other downstream 3367502 34895958 ~ 34896296 (-)
G249978 NA other downstream 3373844 34889506 ~ 34889954 (-)
LOC110519955 LOC106586057 other upstream 997973 39399261 ~ 39508811 (-)
G255911 NA other upstream 1243283 39644571 ~ 39645743 (-)
G256016 LOC106581772 other upstream 1417360 39818648 ~ 39818980 (-)
G256616 NA other upstream 1921218 40322506 ~ 40322898 (-)
G256632 NA other upstream 1933922 40335210 ~ 40335440 (-)
G254275 NA non-coding upstream 70257 38339469 ~ 38339726 (-)

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