atf2 (atf2)


Basic Information

Item Value
gene id atf2
gene name atf2
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 49962467 ~ 49978892 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

symbol description
atf2 Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and cAMP response element binding activity. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to act upstream of or within regulation of transcription, DNA-templated. Predicted to be located in nucleus. Orthologous to human ATF2 (activating transcription factor 2).

NR:

description
cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2 isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K04450 ATF2, CREBP1; cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021597198.2 True 4028 mRNA 0.44 12 49962467 49978892

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110520121 LOC106581751 coding downstream 60892 49895327 ~ 49901575 (-)
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Expression


Co-expression Network