LOC110520215 (LOC106586297)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110520215
gene name LOC106586297
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 54646623 ~ 54659681 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021597378.2
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>XM_036974605.1
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Function

NR:

description
putative methyltransferase DDB_G0268948

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021597378.2 False 6615 mRNA 0.42 8 54646623 54659681
XM_036974605.1 True 6654 mRNA 0.42 8 54646623 54659681

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110520214 LOC106586297 coding downstream 281 54639230 ~ 54646342 (-)
LOC110520218 NA coding downstream 10145 54633738 ~ 54636478 (-)
LOC110520216 LOC106586300 coding downstream 22079 54617528 ~ 54624544 (-)
LOC110520213 ube2f coding downstream 52543 54504064 ~ 54594080 (-)
LOC110520212 NA coding downstream 217409 54425558 ~ 54429214 (-)
LOC110520226 LOC106582378 coding upstream 387837 55047518 ~ 55050859 (-)
LOC110520227 plekhm3 coding upstream 412112 55068639 ~ 55122013 (-)
idh1 LOC106586335 coding upstream 471713 55131394 ~ 55146388 (-)
armc8 armc8 coding upstream 697686 55357367 ~ 55371667 (-)
LOC110520232 LOC106586350 coding upstream 716234 55375915 ~ 55382161 (-)
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G274198 NA non-coding downstream 357352 54281582 ~ 54289271 (-)
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G274536 NA non-coding upstream 154621 54814302 ~ 54814543 (-)
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G274552 NA non-coding upstream 170924 54830605 ~ 54831374 (-)
G272713 LOC106586324 other downstream 1395539 53249926 ~ 53251084 (-)
LOC110520182 NA other downstream 1937807 52693956 ~ 52708816 (-)
il1rl1 il1rl1 other downstream 3046393 51596933 ~ 51619476 (-)
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LOC110520160 LOC106586095 other downstream 3517313 51126600 ~ 51130404 (-)
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G275250 NA other upstream 750462 55410143 ~ 55411487 (-)
si:dkey-91i10.3 LOC106586420 other upstream 2611101 57270782 ~ 57297762 (-)
G277673 LOC106586423 other upstream 2743303 57402984 ~ 57403575 (-)

Expression


Co-expression Network