znf148 (znf148)


Basic Information

Item Value
gene id znf148
gene name znf148
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 60593527 ~ 60600106 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021597521.2
TAGTTaacttaaatgttttgtttttttgttaacgAGGACGTTTAATACGATAGCATTTCTTATTTTTAAGTGTTTGTTGGACGAATGAAACTTCATGTTTGGTGAACAAGTAGCTCGTAGCATAGTCTTGATTTTCTTCTGTCATCATGTTCTAATCCAGTGTGAGCTCAGAAGAGATGCAGAATAAGGGTTGCAAAGCAGAACACACATACATAGTGCTTCACTACAGGTGAGCCGCAGAGCTATCACAAAGCCGAACAACTACGGTACAGTCCCCATGCGCTGCAGTTGGGCCAGATGCGGTGATGTTTATTTTCTGTCGTGGCGTATATCACACAGCGGATACACTTTTCCCAGATAAACCATGACTGTTGAACGACCTTATTAGACCATAAAGTAGGTAAGCAGGCTAACGTTACGTAAGTTAGCTAGGCTAGCCAACTAATGCTAATAGCTGGCTAACGTTATGTCAGTTGTGAACAGTTTGGTCTGCTGTGCTTTTAAGCTAACGTAAACTATGTCTCGATTTGACTTGTCTTGAGCGAAGCTAAATCTTGATTTGAGGTATTGTAGCTAGCTATCTTAGTTCTGGTTGTTGTTGGTTCTGATCAGGcataactagctaactagcttacGTTTGCcattcacagctagctagctaattatatACTGCAaactacgttagctagctaacgcttgTCCACACTACCGGTAGttttctagctagctaacgcAGTTGTTACTTGTTTAGCTAACTAGCGAAAGTTGTCTAACGAAAGTTGTCTAGCTAACTAAAGTTACCTATAATAACACCTAGTTACATATTTAGGTAGTTCAAGTACGTTAATCTAGTTGGTTAACTAGCTAATTTATCCAGTTGACCACTAGCGACAGATGATGAAAtattaacgttagctaactatagTATGGTCAAAAAGCCTAGTTTTATTGCTGACGTTAATTTTTGGGCAGGTCGACGTGCTATTATGAGTAAACGGGTTTGTGTTGGCTAACGTTATTAGGTTGGTTGATCATCTTTAGGTAGCTAACTACGTTATCAGCTAAACCTCAGATTACTCAATGATGGCCCCACTAAATTGTAGCTAGCAAGCATTTGTAGTGATTTATTATTAACGTTAGCCTATTGCTACCAAAGCTAAATACTGGTGTTTTGTTTGTCTTTACCTAACTAATACTTCTGCCCTCTCTTAACAACACAGACACCTAGCTAGCTAGGTCTCTAGTAAAGATGAACATTGATGACAAGCTGGAGGGGATGCTGCTAAAGTGTAGTGGGGTAGTGGATGAGAGGGTGGGGATAGGGGGAGGGGGTCTGGTCGTCATGACCCTGGGCGAGAGGGGGTTAGCCCACCACCCCCTGttagctgatgatgatgatgatgatgaagaggatgaTGACCTGACAGGGGTTTCAGTAGTGTCTCATGACTTGATTGCAACTGATGAACTGATGGTACATGAGGAGACTGTGAAGAATGACCGGGAAGAGGGAATGATGCAGAGACTCGCACACAAGCTTCCATGCACGCTCCACATGCCTGTGAGCATCAAACAAGAGTTGAAGCTGTCTTCGGATCCACTGATgctgggaaagaaagagagaaaacagcCCAGGGACCTCACAACAGAGTGTCACAAGAAGAAGAGAAAACAGCGCTCTCCTGCCAAGATTCTCACCATCAATGAGGATGGATCATTGGGTCTCCAGAGTCCAAAGTGTCATGTATGTGGGCACTGCAATGCAGCCTTCCGAACAAACTACCATCTACAAAGACACGTCTTCATCCACACTGGTGAGAAGCCATTTCAGTGCAGCCAGTGTGATATGCGCTTCATACAGAAATACCTTCTCCAGAGACATGAGAAGATCCACACTGGTGAGAAGCCCTTCCGCTGTGAGGAGTGTGGCATGAGGTTCATTCAGAAATACCACATGGAGAGGCACAGAAGGACCCACAGTGGAGAGAAGCCCTATCAATGTGACTACTGCCACCAGTACTTCTCCAGAACAGACCGGGTTCTAAAGCACAGGCGTATGTGCCGTGAGAGGAAAGCCCACAAGACAGCAGCAGCGGGGAAAGATGGAGGACTCCTGAGCGACACGGAATCTCTGGGCTTCTCCTTCCCTGCCAAGGAGTGCTCACTGCCCAAGAAGAAACGCCTGAAGACCTCAGACAAGTCTCAATGTGCTCTCTCAGCTGCTGCCACTGAAAACGTTGCCACAGTCGCTTCTCTTGGCGACATGGATAGGGAGGTGGAGCAAAGACCGAGCAAAATTGAATGTCTACCTCTCTATGTGGTTACCTCCAAGGTGGTTAAAGACGAGTATGTGATGGCAGATTATTCTGTGGCACTTCCTGACACATCAAGTGGGCGGCAGTTGGGGCTGGGTGGGGAGAATCTCTCCTCTGAGGAGATTTATCCTCCCAAGCTGGTCCTCAAGAAGGTCCCCAAGAGGAGTCTGAAGCAACCAACTGAACCTGAACCACCTGAGAGTTTATGCCCTTTGTCCTCTTTCGAAGACTGCAAAGTCACCAGGTACACGTTTGAGATTGTTGACAAACAAGGTCTTCTGGACGTGGATGTGGCTAACtctgacctggagccagtagacGCTCTCCCAGGAGGGCAGACGAAACCAGCATCCAGCAGCACACACTACGACGATGCCATGCAGTTCCTGAAGAAGAAGAGGTATCTCCAGCAGGTCGCTATGGCCAACAACGACAACCGAGATTACGCTGTTAATGTAAGCAGCATCGCGTCCCAGCCTTCTGCTACACAAGTCGCAGTGGCCAGCGTCATAGACGAAACTGTTCCCGCCACCATCTTGGAACCCCAGCCGTTGAGCGTCGAGCTCAAGTCCAATCACGACAAGAACGTGCTCCCGGATGAGGTTCTCCAGACTCTCCTGGACCACTACTCAAACAAGGCCAACGTGCAGCCAGATATCTCCTTCAGTGTGGCTGACACTGAGGTGACATCCAGCATCTCCATCAACTCCTCCGATGTGTCTGAGGGCAGCCCGGTAGAAAGCTTGGGAGGTAACTCTCAAGCCCCATCAGCAGAGAAATCTAGCCTCCTGCACGAGTACTCCAAGTTCCTCCAGCAAGCACTGGAGAGGACCAGCCAGAACGATAGCTACCTGAGCAGCCAGAGTCTTACCTTTGTCACCGAGAGCCCCAGCCTTTCCAACCAGCCTCTGTTCTCTACAGAGAAGCAGTACCCTTCCCCCAGTAGGTTTACCGCTGGTACTGGTAAGTCAGGGATGAACTCCCCACTAAGGTCTACCTTGGAGAAACCCCATTTTGGACTCCTTGTAGGGGACTCCCAGCACTCTTTCTCATTTTCGGGGGATGAAACCACTACCTCGGCCGTGTCGCCAACCGAAGATTTTCTGGAGGGAGTTGCGTCCTCGAAAAAGACTGATGCTCAAGGGTTGCATCAGACTTATCAAATCAGCACCTTCGATCAGAACTTCCCATCGCAGTTCCAGACCTCACGTTCTGGAATCACCTCCCAATTTACTATTGCCAATGGACAAGTCAGTCTGCGAAGTCACGGAACAGACTTCTCTGAATTCCCCATTGAGACGAGGTCTCAATTGAACTCTTCCCCTGATGCTACAAGCAGTCAAACGTTTGGTTGAGGATAATATTTACATTATTCTACAATCATTTTAAAAGGCACTTTATACCCATATCCTCTGTCCTGCCAAAATAGGTTACACTGCAAAGGTGGGTGTTGCTCAAAGCATTTaatgatttaaaaatatataatttctgTTAGATTAAAGTGGTCAATTTTACGAAttgtgaaaaataaataaataataatgtataTGAAGCAAAACATAAAATTGGCTTTTTGGGGAGGAAACTACAGCCCGACctatgttttttgggggtatggttctgattttttggggggggggggtctaaaacTTAGTTTTAGATCTACCGATTTACTGTTTTACAGCGTGGAAATTGTCATTTTCCCACACTGAATTCTCAAATTGCCACCCAAAAAGGCAATTGTCCAATAACTATGCTTCAAATGTTGTTTTCATACATTGTGATAATGACACATCATGAAAATGGACACAAGTGTTCAGATCAGCCCAGTAGTGAAATGGATTTGATTGCATAGTCACTCTATTTTTGTCTCCAATTTCATTTTCTGCTTGACTTCAATCATGTTTCTTCCACCTTTTTATTGCTTTAACTCTAACTAGGtatctgtgcctgtatttataaagtgtctcagagtaataGGAAAGATTTGAACTAACCCAAGATGGACCAGAGCCTGTAGTTTCCAATGGGCAcaaattaatcatagtgggcagaacaagcaaggaggtgggcagagccagcacaagctagtgagatcctattggcctgttctagcatttatttgcatatttccgttcgGGAACGCCTACACTGAAGTacgcgtgtgcaataactcaattcgcccttGCACTCCTAACAAacgtatttaaaaaatgtaaaattctTTGGCGAAGGGTGACGTCTACAAAACGCAGTCTATTCTGTTGgagattctagttttggaaacagagctgtatggagatcaaatgtctcgctccatcttttcccactgccggccactgagCTTCCTAACATCCCCATAGTGAGTGGAAatgccaaccggatgcttcacaatGATTTATATATCTGGCTCATTGTTTTAACTGTGGTAATGGTGCTGGTCTAGGGTCAGTTTTGCCTTTTCGATCATAATGTATGGACAGAGGGGGCTGGTCCTAGATCTGAGACCATATGAAGGGACCCTGTTACCATGTGACGTGTCGGCATAACAGTCCTGCTATATAACTGCTGAATGTAGAGTTGTCCACTTGTTGATTATGTATAGTTGCTTGCTAGACTCCTGTTTTCAAGTTGACACCATGGTAAGAGTGGGTATCCTCATGGTGTATAGCCTGAAATATATAG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>XM_036974814.1
AACTAGTTaacttaaatgttttgtttttttgttaacgAGGACGTTTAATACGATAGCATTTCTTATTTTTAAGTGTTTGTTGGACGAATGAAACTTCATGTTTGGTGAACAAGTAGCTCGTAGCATAGTCTTGATTTTCTTCTGTCATCATGTTCTAATCCAGTGTGAGCTCAGAAGAGATGCAGAATAAGGGTTGCAAAGCAGAACACACATACATAGTGCTTCACTACAGGTGAGCCGCAGAGCTATCACAAAGCCGAACAACTACGGTACAGTCCCCATGCGCTGCAGTTGGGCCAGATGCGGTGATGTTTATTTTCTGTCGTGGCGTATATCACACAGCGGATACACTTTTCCCAGATAAACCATGACTGTTGAACGACCTTATTAGACCATAAAGTAGGTAAGCAGGCTAACGTTACGTAAGTTAGCTAGGCTAGCCAACTAATGCTAATAGCTGGCTAACGTTATGTCAGTTGTGAACAGTTTGGTCTGCTGTGCTTTTAAGCTAACGTAAACTATGTCTCGATTTGACTTGTCTTGAGCGAAGCTAAATCTTGATTTGAGGTATTGTAGCTAGCTATCTTAGTTCTGGTTGTTGTTGGTTCTGATCAGGcataactagctaactagcttacGTTTGCcattcacagctagctagctaattatatACTGCAaactacgttagctagctaacgcttgTCCACACTACCGGTAGttttctagctagctaacgcAGTTGTTACTTGTTTAGCTAACTAGCGAAAGTTGTCTAACGAAAGTTGTCTAGCTAACTAAAGTTACCTATAATAACACCTAGTTACATATTTAGGTAGTTCAAGTACGTTAATCTAGTTGGTTAACTAGCTAATTTATCCAGTTGACCACTAGCGACAGATGATGAAAtattaacgttagctaactatagTATGGTCAAAAAGCCTAGTTTTATTGCTGACGTTAATTTTTGGGCAGGTCGACGTGCTATTATGAGTAAACGGGTTTGTGTTGGCTAACGTTATTAGGTTGGTTGATCATCTTTAGGTAGCTAACTACGTTATCAGCTAAACCTCAGATTACTCAATGATGGCCCCACTAAATTGTAGCTAGCAAGCATTTGTAGTGATTTATTATTAACGTTAGCCTATTGCTACCAAAGCTAAATACTGGTGTTTTGTTTGTCTTTACCTAACTAATACTTCTGCCCTCTCTTAACAACACAGACACCTAGCTAGCTAGGTCTCTAGTAAAGATGAACATTGATGACAAGCTGGAGGGGATGCTGCTAAAGTGTAGTGGGGTAGTGGATGAGAGGGTGGGGATAGGGGGAGGGGGTCTGGTCGTCATGACCCTGGGCGAGAGGGGGTTAGCCCACCACCCCCTGttagctgatgatgatgatgatgatgaagaggatgaTGACCTGACAGGGGTTTCAGTAGTGTCTCATGACTTGATTGCAACTGATGAACTGATGGTACATGAGGAGACTGTGAAGAATGACCGGGAAGAGGGAATGATGCAGAGACTCGCACACAAGCTTCCATGCACGCTCCACATGCCTGTGAGCATCAAACAAGAGTTGAAGCTGTCTTCGGATCCACTGATgctgggaaagaaagagagaaaacagcCCAGGGACCTCACAACAGAGTGTCACAAGAAGAAGAGAAAACAGCGCTCTCCTGCCAAGATTCTCACCATCAATGAGGATGGATCATTGGGTCTCCAGAGTCCAAAGTGTCATGTATGTGGGCACTGCAATGCAGCCTTCCGAACAAACTACCATCTACAAAGACACGTCTTCATCCACACTGGTGAGAAGCCCTTCCGCTGTGAGGAGTGTGGCATGAGGTTCATTCAGAAATACCACATGGAGAGGCACAGAAGGACCCACAGTGGAGAGAAGCCCTATCAATGTGACTACTGCCACCAGTACTTCTCCAGAACAGACCGGGTTCTAAAGCACAGGCGTATGTGCCGTGAGAGGAAAGCCCACAAGACAGCAGCAGCGGGGAAAGATGGAGGACTCCTGAGCGACACGGAATCTCTGGGCTTCTCCTTCCCTGCCAAGGAGTGCTCACTGCCCAAGAAGAAACGCCTGAAGACCTCAGACAAGTCTCAATGTGCTCTCTCAGCTGCTGCCACTGAAAACGTTGCCACAGTCGCTTCTCTTGGCGACATGGATAGGGAGGTGGAGCAAAGACCGAGCAAAATTGAATGTCTACCTCTCTATGTGGTTACCTCCAAGGTGGTTAAAGACGAGTATGTGATGGCAGATTATTCTGTGGCACTTCCTGACACATCAAGTGGGCGGCAGTTGGGGCTGGGTGGGGAGAATCTCTCCTCTGAGGAGATTTATCCTCCCAAGCTGGTCCTCAAGAAGGTCCCCAAGAGGAGTCTGAAGCAACCAACTGAACCTGAACCACCTGAGAGTTTATGCCCTTTGTCCTCTTTCGAAGACTGCAAAGTCACCAGGTACACGTTTGAGATTGTTGACAAACAAGGTCTTCTGGACGTGGATGTGGCTAACtctgacctggagccagtagacGCTCTCCCAGGAGGGCAGACGAAACCAGCATCCAGCAGCACACACTACGACGATGCCATGCAGTTCCTGAAGAAGAAGAGGTATCTCCAGCAGGTCGCTATGGCCAACAACGACAACCGAGATTACGCTGTTAATGTAAGCAGCATCGCGTCCCAGCCTTCTGCTACACAAGTCGCAGTGGCCAGCGTCATAGACGAAACTGTTCCCGCCACCATCTTGGAACCCCAGCCGTTGAGCGTCGAGCTCAAGTCCAATCACGACAAGAACGTGCTCCCGGATGAGGTTCTCCAGACTCTCCTGGACCACTACTCAAACAAGGCCAACGTGCAGCCAGATATCTCCTTCAGTGTGGCTGACACTGAGGTGACATCCAGCATCTCCATCAACTCCTCCGATGTGTCTGAGGGCAGCCCGGTAGAAAGCTTGGGAGGTAACTCTCAAGCCCCATCAGCAGAGAAATCTAGCCTCCTGCACGAGTACTCCAAGTTCCTCCAGCAAGCACTGGAGAGGACCAGCCAGAACGATAGCTACCTGAGCAGCCAGAGTCTTACCTTTGTCACCGAGAGCCCCAGCCTTTCCAACCAGCCTCTGTTCTCTACAGAGAAGCAGTACCCTTCCCCCAGTAGGTTTACCGCTGGTACTGGTAAGTCAGGGATGAACTCCCCACTAAGGTCTACCTTGGAGAAACCCCATTTTGGACTCCTTGTAGGGGACTCCCAGCACTCTTTCTCATTTTCGGGGGATGAAACCACTACCTCGGCCGTGTCGCCAACCGAAGATTTTCTGGAGGGAGTTGCGTCCTCGAAAAAGACTGATGCTCAAGGGTTGCATCAGACTTATCAAATCAGCACCTTCGATCAGAACTTCCCATCGCAGTTCCAGACCTCACGTTCTGGAATCACCTCCCAATTTACTATTGCCAATGGACAAGTCAGTCTGCGAAGTCACGGAACAGACTTCTCTGAATTCCCCATTGAGACGAGGTCTCAATTGAACTCTTCCCCTGATGCTACAAGCAGTCAAACGTTTGGTTGAGGATAATATTTACATTATTCTACAATCATTTTAAAAGGCACTTTATACCCATATCCTCTGTCCTGCCAAAATAGGTTACACTGCAAAGGTGGGTGTTGCTCAAAGCATTTaatgatttaaaaatatataatttctgTTAGATTAAAGTGGTCAATTTTACGAAttgtgaaaaataaataaataataatgtataTGAAGCAAAACATAAAATTGGCTTTTTGGGGAGGAAACTACAGCCCGACctatgttttttgggggtatggttctgattttttggggggggggggtctaaaacTTAGTTTTAGATCTACCGATTTACTGTTTTACAGCGTGGAAATTGTCATTTTCCCACACTGAATTCTCAAATTGCCACCCAAAAAGGCAATTGTCCAATAACTATGCTTCAAATGTTGTTTTCATACATTGTGATAATGACACATCATGAAAATGGACACAAGTGTTCAGATCAGCCCAGTAGTGAAATGGATTTGATTGCATAGTCACTCTATTTTTGTCTCCAATTTCATTTTCTGCTTGACTTCAATCATGTTTCTTCCACCTTTTTATTGCTTTAACTCTAACTAGGtatctgtgcctgtatttataaagtgtctcagagtaataGGAAAGATTTGAACTAACCCAAGATGGACCAGAGCCTGTAGTTTCCAATGGGCAcaaattaatcatagtgggcagaacaagcaaggaggtgggcagagccagcacaagctagtgagatcctattggcctgttctagcatttatttgcatatttccgttcgGGAACGCCTACACTGAAGTacgcgtgtgcaataactcaattcgcccttGCACTCCTAACAAacgtatttaaaaaatgtaaaattctTTGGCGAAGGGTGACGTCTACAAAACGCAGTCTATTCTGTTGgagattctagttttggaaacagagctgtatggagatcaaatgtctcgctccatcttttcccactgccggccactgagCTTCCTAACATCCCCATAGTGAGTGGAAatgccaaccggatgcttcacaatGATTTATATATCTGGCTCATTGTTTTAACTGTGGTAATGGTGCTGGTCTAGGGTCAGTTTTGCCTTTTCGATCATAATGTATGGACAGAGGGGGCTGGTCCTAGATCTGAGACCATATGAAGGGACCCTGTTACCATGTGACGTGTCGGCATAACAGTCCTGCTATATAACTGCTGAATGTAGAGTTGTCCACTTGTTGATTATGTATAGTTGCTTGCTAGACTCCTGTTTTCAAGTTGACACCATGGTAAGAGTGGGTATCCTCATGGTGTATAGCCTGAAATATATAGTTTTGATTTGATCATATGATGATCACAAGATTTTGATTTGATCAATCTTAATTTGAAGTCAAGTTATTCAAAGCTCTCCCC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Function

symbol description
znf148 Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Acts upstream of or within hemopoiesis. Predicted to be located in nucleus. Is expressed in anterior lateral plate mesoderm; brain; intermediate cell mass of mesoderm; and posterior lateral plate mesoderm. Orthologous to human ZNF148 (zinc finger protein 148).

NR:

description
zinc finger protein 148-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021597521.2 False 5720 mRNA 0.44 6 60593527 60600103
XM_036974814.1 True 5639 mRNA 0.44 5 60593527 60600106

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
slc12a8 slc12a8 coding downstream 4188 60560430 ~ 60589339 (-)
heg1 LOC106586449 coding downstream 33231 60545104 ~ 60560296 (-)
LOC118944680 tas2r8 coding downstream 70335 60497574 ~ 60523192 (-)
kansl1l NA coding downstream 130096 60421641 ~ 60463431 (-)
map2 LOC106586448 coding downstream 177224 60292403 ~ 60416303 (-)
LOC110520303 LOC106586453 coding upstream 7004 60607110 ~ 60615212 (-)
snx4 snx4 coding upstream 20380 60620486 ~ 60633884 (-)
LOC110520306 LOC106586457 coding upstream 59140 60659246 ~ 60682924 (-)
LOC118944682 NA coding upstream 86348 60686454 ~ 60689464 (-)
LOC110520307 LOC106586456 coding upstream 109848 60709954 ~ 60888262 (-)
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G281393 NA non-coding downstream 185171 60408064 ~ 60408356 (-)
G281392 NA non-coding downstream 185588 60407197 ~ 60407939 (-)
G281390 NA non-coding downstream 187467 60405795 ~ 60406060 (-)
G281376 NA non-coding downstream 212342 60380979 ~ 60381185 (-)
G281872 NA non-coding upstream 16080 60616186 ~ 60616431 (-)
LOC110520309 LOC106586458 non-coding upstream 291737 60891843 ~ 60941193 (-)
G282125 NA non-coding upstream 430280 61030386 ~ 61030761 (-)
G282179 NA non-coding upstream 509022 61109128 ~ 61110355 (-)
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si:dkey-91i10.3 LOC106586420 other downstream 3295765 57270782 ~ 57297762 (-)
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G286522 NA other upstream 4369443 64969549 ~ 64970755 (-)
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G286953 LOC107579696 other upstream 4635074 65235180 ~ 65235908 (-)

Expression


Co-expression Network