LOC110520378 (LOC106586545)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110520378
gene name LOC106586545
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 63867161 ~ 63875738 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021597657.2
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>XM_021597658.2
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>TU323638
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021597658.2 False 5073 mRNA 0.46 9 63867161 63875738
TU323638 True 1411 lncRNA 0.40 2 63867183 63868625

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110520377 LOC106586531 coding downstream 44566 63780997 ~ 63822595 (-)
LOC110520376 LOC106582183 coding downstream 87594 63742998 ~ 63779567 (-)
LOC110520375 LOC106586530 coding downstream 124551 63720994 ~ 63742610 (-)
LOC118964357 NA coding downstream 155524 63711439 ~ 63711637 (-)
LOC118964310 LOC106586530 coding downstream 156673 63706568 ~ 63710488 (-)
LOC110505387 LOC106586543 coding upstream 6119 63881857 ~ 63886501 (-)
LOC110505395 LOC106586542 coding upstream 25730 63901468 ~ 63904218 (-)
LOC110520380 LOC106586540 coding upstream 36261 63911999 ~ 64174276 (-)
LOC110520379 NA coding upstream 610051 64485789 ~ 64641565 (-)
LOC110520388 cssa25h3orf38 coding upstream 976765 64852503 ~ 64855851 (-)
G285338 NA non-coding downstream 206739 63648216 ~ 63660422 (-)
G285277 NA non-coding downstream 345144 63521727 ~ 63522017 (-)
G284861 NA non-coding downstream 359367 63507586 ~ 63507794 (-)
G284855 NA non-coding downstream 367591 63499271 ~ 63499570 (-)
G284848 NA non-coding downstream 372664 63494070 ~ 63494497 (-)
G285444 NA non-coding upstream 75719 63951457 ~ 63953643 (-)
G285445 NA non-coding upstream 79672 63955410 ~ 63955880 (-)
G285466 NA non-coding upstream 116376 63992114 ~ 63992941 (-)
G285582 NA non-coding upstream 299149 64174887 ~ 64175108 (-)
G285624 NA non-coding upstream 335348 64211086 ~ 64211389 (-)
G284018 NA other downstream 1151984 62714575 ~ 62715177 (-)
G277749 LOC106586429 other downstream 6277978 57584386 ~ 57589183 (-)
G277673 LOC106586423 other downstream 6463586 57402984 ~ 57403575 (-)
si:dkey-91i10.3 LOC106586420 other downstream 6569399 57270782 ~ 57297762 (-)
G275250 NA other downstream 8455674 55410143 ~ 55411487 (-)
G286522 NA other upstream 1093811 64969549 ~ 64970755 (-)
G286580 marco other upstream 1138521 65014259 ~ 65029736 (-)
G286638 NA other upstream 1178962 65054700 ~ 65075985 (-)
G286953 LOC107579696 other upstream 1359442 65235180 ~ 65235908 (-)
G286985 LOC106586592 other upstream 1422469 65298207 ~ 65300417 (-)

Expression


Co-expression Network