LOC118964339


Basic Information

Item Value
gene id LOC118964339
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 84904338 ~ 84907876 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036975373.1
AACCTCTTGACTGGCCTCACAGGAAACAGGACCAATAGAAACAGAACCTCTTGACATCAGACTCTACTGACGTCAGACCAGTCATCTGACACGGCTCCCAATTTAGACACAGTGACAATAGGAAATCACTGTACCAACAGTAATACTGCTGTTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCGTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCAAGATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCAAGATACTGTTATGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCAACATGCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTATATGCTGTTCTGTTCCAATATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTAATGTTTCTACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCGTACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTATTCCAACATGCTGTTCGTACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTATTCTGCTCTAACATGCTGTTCTATTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTATTCCAACATGCTGTTCTATTCCAACATACTGTTCTCCTCCAACATGCTGTTCTGTTCCAACATGCTGTTCTGTTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTATTCCAACATGCTGTTCGTACATACTGTTCTCCTCCAACATGCTGTTCTGTTCCAACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTATTCTTGCTTCAACATGCTGTTCCTGCATACTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGCTCCTACATGCTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGCTCCTACATGCTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATGCTGTTCCAACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATGCTGTTCCAACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATAGACTGTACTATGGACCTCTTACATTTAGAATTTTAGCTTCCAGGCAACACTGTTTAAAGATGTTCCATGTTACCTTGTTATTCCATCAGAAGAATAGTGTCTCTATGTGAAGCTGTGAATGTGTTGAATTCTCCTTGTTCCCTTGTTATTCCATCAGAAGAATAGTGTCTATGTGAAGCTGTGAATGTGTTGAATTCTCCTGGCTTGTGGTGAGGACACAAGAGGTTCTAACGCTCTCTACCTGAACATAATATCTGCCTCCTTGTTCGTCCTCACTGGTGTCTCAGCATTGTGGAGTTGAGGCAGACCTGAACCCTGACCCTGCTAACTCTAACCTTACAGAGTGGAGCCAGGGTAGGAACCATAGACCTGAACTCTGACAGACAGAACTAGGACCAGCTAACCAGGTGGTGGAGTGGCAGGTGAATATGGAACACGCTGAGGTAGAACAGAATGGTAGTGAACAACAGACAGATCCCACAACACTGGGTCATTGCTACCATAGTGACAGGCggtataagtagtgcactatatagggaatagaggacCAGGGTTCAGCCCTGCCTCAACTCCACCATGCTGAGACACCAGTGAGGACGAACAAGGTGGTTTCGCTCCGACAAGGTTTcgcacagacagactcactacaATACAATCACAACACTGTATATCTGGATGTGGTGTGGCTGATGACTGTTGGCTGCATTGTGTTTTAGTTGGTTTGgagcttctctgtctgtctcagtagctTGGTTCTGATTCTCTCTGTAGCTTGGTTCTGATTCTGTGTGTAGCTTGGTTCTGATTCTGTGTGTAGcttggttctgattctgtttgtagcttggttctgattctgtgtgtctctgtagctTGGTTCTGATTCTGTCTGTAGCTTGGTTCTGATTCTTCATGTTATTGTGACCCTGTAGAGCTGCTCTATACTCTTAACAGCCACAAAGACACAAAAGGgttttgagtcccaaatggcaccctattccctctatagtgtactacttttgaccagggcccatagggaagaaGGACACTATGTAGGTAATATGGTGCACTTTGGGATGTTCCCACAGTCTTCCCTGTTGCGGTCAAACTCCTCGTCTCCTTTACCAGACGATTTCCTTATAGAAAATTATACATCTGTCATCAGTTGATGCTGTATTGGCCGGTTTTCAGTTGACTAGTCTTTTCACTTTTAAGGACAGAAGTGATATTTGTTCTGCTGTATTACTGATGTGTGATGTAAGGCCTGTTGATGGTGCTGCATTGACTGGACTGTACCATCATTACCAACCCCTCTAGTTCACAGCTCTTGATAAAGATCACCAATAATGACTGTAGAAAATAAATCCTTCAATACTCTTTTAGTTTAGTATTTGgttccatattcctagcacgcaataaCTACATCAAGCTGTCACTCTACAAcctgtttcagattattttttcCCAATAGTAATGAATTGGGAAATAATAtaatgtgtcattttggagtcacttttattgtaaataagaatataatatgtttctaaacacttctacattaatgtaaTGAATcgggaataatgatgagtgacaaagttacagagggtcaaagatcataat
>XM_036975374.1
AACCTCTTGACTGGCCTCACAGGAAACAGGACCAATAGAAACAGAACCTCTTGACATCAGACTCTACTGACGTCAGACCAGTCATCTGACACGGCTCCCAATTTAGACACAGTGACAATAGGAAATCACTGTACCAACAGTAATACTGCTGTTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCGTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCAAGATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCAAGATACTGTTATGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCAACATGCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTATATGCTGTTCTGTTCCAATATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTAATGTTTCTACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCGTACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTATTCCAACATGCTGTTCGTACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTATTCTGCTCTAACATGCTGTTCTATTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTATTCCAACATGCTGTTCTATTCCAACATACTGTTCTCCTCCAACATGCTGTTCTGTTCCAACATGCTGTTCTGTTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTATTCCAACATGCTGTTCGTACATACTGTTCTCCTCCAACATGCTGTTCTGTTCCAACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTATTCTTGCTTCAACATGCTGTTCCTGCATACTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGCTCCTACATGCTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGCTCCTACATGCTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATGCTGTTCCAACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTACCTACATGCTGTTCCAACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATAGACTGTACTATGGACCTCTTACATTTAGAATTTTAGCTTCCAGGCAACACTGTTTAAAGATGTTCCATGTTACCTTGTTATTCCATCAGAAGAATAGTGTCTCTATGTGAAGCTGTGAATGTGTTGAATTCTCCTTGTTCCCTTGTTATTCCATCAGAAGAATAGTGTCTATGTGAAGCTGTGAATGTGTTGAATTCTCCTGGCTTGTGGTGAGGACACAAGAGGTTCTAACGCTCTCTACCTGAACATAATATCTGCCTCCTTGTTCGTCCTCACTGGTGTCTCAGCATTGTGGAGTTGAGGCAGACCTGAACCCTGACCCTGCTAACTCTAACCTTACAGAGTGGAGCCAGGGTAGGAACCATAGACCTGAACTCTGACAGACAGAACTAGGACCAGCTAACCAGGTGGTGGAGTGGCAGGTGAATATGGAACACGCTGAGGTAGAACAGAATGGTAGTGAACAACAGACAGATCCCACAACACTGGGTCATTGCTACCATAGTGACAGGCggtataagtagtgcactatatagggaatagaggacCAGGGTTCAGCCCTGCCTCAACTCCACCATGCTGAGACACCAGTGAGGACGAACAAGGTGGTTTCGCTCCGACAAGGTTTcgcacagacagactcactacaATACAATCACAACACTGTATATCTGGATGTGGTGTGGCTGATGACTGTTGGCTGCATTGTGTTTTAGTTGGTTTGgagcttctctgtctgtctcagtagctTGGTTCTGATTCTCTCTGTAGCTTGGTTCTGATTCTGTGTGTAGCTTGGTTCTGATTCTGTGTGTAGcttggttctgattctgtttgtagcttggttctgattctgtgtgtctctgtagctTGGTTCTGATTCTGTCTGTAGCTTGGTTCTGATTCTTCATGTTATTGTGACCCTGTAGAGCTGCTCTATACTCTTAACAGCCACAAAGACACAAAAGGgttttgagtcccaaatggcaccctattccctctatagtgtactacttttgaccagggcccatagggaagaaGGACACTATGTAGGTAATATGGTGCACTTTGGGATGTTCCCACAGTCTTCCCTGTTGCGGTCAAACTCCTCGTCTCCTTTACCAGACGATTTCCTTATAGAAAATTATACATCTGTCATCAGTTGATGCTGTATTGGCCGGTTTTCAGTTGACTAGTCTTTTCACTTTTAAGGACAGAAGTGATATTTGTTCTGCTGTATTACTGATGTGTGATGTAAGGCCTGTTGATGGTGCTGCATTGACTGGACTGTACCATCATTACCAACCCCTCTAGTTCACAGCTCTTGATAAAGATCACCAATAATGACTGTAGAAAATAAATCCTTCAATACTCTTTTAGTTTAGTATTTGgttccatattcctagcacgcaataaCTACATCAAGCTGTCACTCTACAAcctgtttcagattattttttcCCAATAGTAATGAATTGGGAAATAATAtaatgtgtcattttggagtcacttttattgtaaataagaatataatatgtttctaaacacttctacattaatgtaaTGAATcgggaataatgatgagtgacaaagttacagagggtcaaagatcataat
>XM_036975375.1
AACCTCTTGACTGGCCTCACAGGAAACAGGACCAATAGAAACAGAACCTCTTGACATCAGACTCTACTGACGTCAGACCAGTCATCTGACACGGCTCCCAATTTAGACACAGTGACAATAGGAAATCACTGTACCAACAGTAATACTGCTGTTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCGTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCAAGATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCAAGATACTGTTATGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCAACATGCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTATATGCTGTTCTGTTCCAATATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTAATGTTTCTACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCGTACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTATTCCAACATGCTGTTCGTACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTATTCTGCTCTAACATGCTGTTCTATTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTATTCCAACATGCTGTTCTATTCCAACATACTGTTCTCCTCCAACATGCTGTTCTGTTCCAACATGCTGTTCTGTTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTGCTCCAACATGCTGTTCTATTCCAACATGCTGTTCGTACATACTGTTCTCCTCCAACATGCTGTTCTGTTCCAACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTATTCTTGCTTCAACATGCTGTTCCTGCATACTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGCTCCTACATGCTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGCTCCTACATGCTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATGCTGTTCCAACATGCTGTTCCAACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTACCTACATGCTGTTCCAACATGCTGTTCTGTTCCTACATACTGTTCCTACATACTGTTCTGCTCCTACATACTGTTCCTACATAGACTGTACTATGGACCTCTTACATTTAGAATTTTAGCTTCCAGGCAACACTGTTTAAAGATGTTCCATGTTACCTTGTTATTCCATCAGAAGAATAGTGTCTCTATGTGAAGCTGTGAATGTGTTGAATTCTCCTTGTTCCCTTGTTATTCCATCAGAAGAATAGTGTCTATGTGAAGCTGTGAATGTGTTGAATTCTCCTGGCTTGTGGTGAGGACACAAGAGGTTCTAACGCTCTCTACCTGAACATAATATCTGCCTCCTTGTTCGTCCTCACTGGTGTCTCAGCATTGTGGAGTTGAGGCAGACCTGAACCCTGACCCTGCTAACTCTAACCTTACAGAGTGGAGCCAGGGTAGGAACCATAGACCTGAACTCTGACAGACAGAACTAGGACCAGCTAACCAGGTGGTGGAGTGGCAGGTGAATATGGAACACGCTGAGGTAGAACAGAATGGTAGTGAACAACAGACAGATCCCACAACACTGGGTCATTGCTACCATAGTGACAGGCggtataagtagtgcactatatagggaatagaggacCAGGGTTCAGCCCTGCCTCAACTCCACCATGCTGAGACACCAGTGAGGACGAACAAGGTGGTTTCGCTCCGACAAGGTTTcgcacagacagactcactacaATACAATCACAACACTGTATATCTGGATGTGGTGTGGCTGATGACTGTTGGCTGCATTGTGTTTTAGTTGGTTTGgagcttctctgtctgtctcagtagctTGGTTCTGATTCTCTCTGTAGCTTGGTTCTGATTCTGTGTGTAGCTTGGTTCTGATTCTGTGTGTAGcttggttctgattctgtttgtagcttggttctgattctgtgtgtctctgtagctTGGTTCTGATTCTGTCTGTAGCTTGGTTCTGATTCTTCATGTTATTGTGACCCTGTAGAGCTGCTCTATACTCTTAACAGCCACAAAGACACAAAAGGgttttgagtcccaaatggcaccctattccctctatagtgtactacttttgaccagggcccatagggaagaaGGACACTATGTAGGTAATATGGTGCACTTTGGGATGTTCCCACAGTCTTCCCTGTTGCGGTCAAACTCCTCGTCTCCTTTACCAGACGATTTCCTTATAGAAAATTATACATCTGTCATCAGTTGATGCTGTATTGGCCGGTTTTCAGTTGACTAGTCTTTTCACTTTTAAGGACAGAAGTGATATTTGTTCTGCTGTATTACTGATGTGTGATGTAAGGCCTGTTGATGGTGCTGCATTGACTGGACTGTACCATCATTACCAACCCCTCTAGTTCACAGCTCTTGATAAAGATCACCAATAATGACTGTAGAAAATAAATCCTTCAATACTCTTTTAGTTTAGTATTTGgttccatattcctagcacgcaataaCTACATCAAGCTGTCACTCTACAAcctgtttcagattattttttcCCAATAGTAATGAATTGGGAAATAATAtaatgtgtcattttggagtcacttttattgtaaataagaatataatatgtttctaaacacttctacattaatgtaaTGAATcgggaataatgatgagtgacaaagttacagagggtcaaagatcataat

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106513387 isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036975373.1 False 3482 mRNA 0.43 2 84904338 84907876
XM_036975374.1 False 3482 mRNA 0.43 2 84904338 84907876
XM_036975375.1 True 3446 mRNA 0.43 2 84904338 84907876

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
xrcc5 LOC106586961 coding downstream 36031 84836875 ~ 84868307 (-)
LOC110516739 LOC100708085 coding downstream 280069 84312715 ~ 84624269 (-)
LOC110520676 LOC106562996 coding downstream 595898 84305303 ~ 84308440 (-)
si:dkey-230p4.1 LOC106591428 coding downstream 602981 84232727 ~ 84301357 (-)
LOC110504983 LOC106586944 coding downstream 684076 84072966 ~ 84220262 (-)
LOC110520668 LOC106586955 coding upstream 4676 84912552 ~ 85062818 (-)
G305744 NA non-coding downstream 27305 84876705 ~ 84877033 (-)
G305736 NA non-coding downstream 49879 84854042 ~ 84854459 (-)
G305734 NA non-coding downstream 55653 84848164 ~ 84848685 (-)
G305716 NA non-coding downstream 69234 84834422 ~ 84835104 (-)
G305593 NA non-coding downstream 76734 84827339 ~ 84827604 (-)
G305760 NA non-coding upstream 10910 84918786 ~ 84919190 (-)
G305754 NA non-coding upstream 29185 84937061 ~ 84944444 (-)
G305727 NA non-coding upstream 52521 84960397 ~ 84964857 (-)
G305779 NA non-coding upstream 68395 84976271 ~ 84976799 (-)
G305833 NA non-coding upstream 171144 85079020 ~ 85079264 (-)
G305585 NA other downstream 145563 84757942 ~ 84758775 (-)
G305570 NA other downstream 173480 84729605 ~ 84731089 (-)

Expression


Co-expression Network