G214549


Basic Information

Item Value
gene id G214549
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 29481 ~ 35087 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU243992
agatctactgtctattataatatgacagaccagctagatctactttctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagcttgatctactgtctcttttaacttatgacagaccagctagatctactttctctattatattatgacacaccagctagatctactgtctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattacattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctatattatattgacagatcagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgcctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagacctgctagatctactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatgactgaccagctagatctactatctctattataatatgacagaccagctagatctactgtcactattatattatgacacaccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgcctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattctgacagaccagctagatctactgtctctattacattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctatattatattgacagatcagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgcctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagacctgctagatctactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatgactgaccagctagatctactatctctattataatatgacagaccagctagatctactgtcactattatattatgacacaccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgcctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattctgacagaccagctacatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctaccgtctctattatattatgacataccagctagatctactgtctctatattatgattgaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctaggtctactgtctctattatattctgacagaccagatagatcgattgtctctatcataatatgacagaccagcttgatctactgtctctattatattctgacagaccagctacatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatatactgtctattatattatgactgaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctccattatattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaagagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctactatattatgacagaccagctagttctactgtctctattataatatgaaagaccagctagatctactgtctctaatatattatgactgaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattataacatgacagacctgctagatctactgtctctattatattgtgacataccagctagatctactgtctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctacattctctattgtattatgactgaccagctagatctactatctcttatataatatgacagaccagctagatcagctgtctctattataaaatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgaca

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU243992 True 2481 lncRNA 0.36 2 29481 35087

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118964342 NA coding upstream 28829 63916 ~ 74553 (-)
irx4a LOC105016487 coding upstream 112653 147740 ~ 155571 (-)
LOC118944729 NA coding upstream 213951 247153 ~ 252277 (-)
irx2a irx2 coding upstream 475880 510967 ~ 515209 (-)
LOC118964345 NA coding upstream 843913 879000 ~ 881031 (-)
G214545 NA non-coding upstream 6567 41654 ~ 52028 (-)
G214597 NA non-coding upstream 72934 108021 ~ 108619 (-)
G214599 NA non-coding upstream 74267 109354 ~ 110345 (-)
G214609 NA non-coding upstream 89018 124105 ~ 125144 (-)
G214614 NA non-coding upstream 90242 125329 ~ 125719 (-)
G214663 NA other upstream 142636 177723 ~ 179591 (-)
G214982 NA other upstream 445960 481047 ~ 481609 (-)
G215354 NA other upstream 880872 915959 ~ 919673 (-)
G215950 NA other upstream 1565139 1600226 ~ 1618140 (-)

Expression


Co-expression Network