G214545


Basic Information

Item Value
gene id G214545
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 41654 ~ 52028 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU243979
ctaggtctactgtctctattatattctgacagaccatatagatctattgtctctattataatatgacagaccagcttgatctactgtctctattatattctgacagaccagctacatctactttctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgtctattatattatgacagaccagctagaactactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatatcatgacataccagctagatctactgcctctatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactgacaagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactaaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctactatattatgacagaccagctagttctactgtctctattataatatgaaagaccagctagatctactgtctctaatatattatgactgaccagctagatctactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgcctctatgatattatgacagactagctagatctactgtctctattataatctgacagaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctactatattatgacagaccagctagttctactgtctctatgtctatattatattatgacagaccagctagatcaactgtttctattataatctgacagaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctactatattatgacagaccagctagttctactgtctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatttaatgtctctatgtctatgttatattatgacagaccagctagatcaactgtttctattataatctgactgaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagctagagctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctactatattatgactgaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatatactttctctattatattatgacagaccagctagttctactgtctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatttaatgtctctatgtctatattatattatgatagaccagctagatcaactgtttctattataatatgacagaccagctagatctactgtcactattatattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtttctattgtaatctgacagaccagctagatctactgtctctagtatattttgacagaccagcttgatctactgtctcttttaacttatgacagaccagctagatctactttctctattatattatgacacaccagctagatctactgtctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctatattatattgacagatcagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgcctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagacctgctagatctactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatgactgaccagctagatctactatctctattataatatgacagaccagctagatctactgtcactattatattatgacacaccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattctgacagaccagctacatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctaccgtctctattatattatgacataccagctagatctactgtctctatattatgattgaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctaggtctactgtctctattatattctgaaagaccagatagatctattgtctctatcatattatgacagaccagcttgatctactgtctctattatattctgacagaccagctacatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgactgaccagctagatatactgtctctatgtctatattatattatgacagaccagctagatcaactgtttctattataatctgacagaccagctagatctactgcctctatgtctctattacattgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgagagaccagctagttttactgtctctatgtctatattatattatgacagaccagctagatcaactgtttctattataatctgacagaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgaccgaccagctatatctactgtctctactatattatgacagaccagctagttctactgtctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatttaatgtctctatgtctatattatattatgatagaccagctagatcaactgtttctattataatatgacagaccagctagatctactgtcactattatattatgacataccagctagatctactgcctctatgtctctattatattgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtttctattataatctgacagaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctactatattatgactgaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatcaactgtttctattataatctgacagaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctactatattatgactgaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattttattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattgacagaccagctagatctactggctctattatgttatgacagaccagcttgatctactgtctctattctaatatgacagaccagctagatcagctgtctctattataaaatgac
>TU243988
tgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatttaatgtctctatgtctatattatattatgacagaccagctagatcaactgtttctattataatctgacagaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctactatattatgactgaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctttattatattatgacagaccagctagatctactgtctctataatatgacagaccagctagatctactttctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagcttgatctactgtctctatgtctcttttaacttatgacagaccagctagatctactttctctattatattacgacacaccagctagatctactgtctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgtgacagaccagcttgatctactgtctctatgtcacttttaacttatgacagaccagctagatctaatgtctctattataatatgacagaccagctagatctaatgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctacggtctctattatattgacagaccagctagatctactggctctattatgttatgacagaccagcttgatctgctgtctctatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattttattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattgacagaccagctagatctactggctctattatgttatgacagaccagcttgatctactgtctctattctaatatgacagaccagct

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU243979 False 4135 lncRNA 0.35 2 41654 50384
TU243988 True 1082 lncRNA 0.36 2 46388 52028

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118964342 NA coding upstream 11888 63916 ~ 74553 (-)
irx4a LOC105016487 coding upstream 95712 147740 ~ 155571 (-)
LOC118944729 NA coding upstream 197010 247153 ~ 252277 (-)
irx2a irx2 coding upstream 458939 510967 ~ 515209 (-)
LOC118964345 NA coding upstream 826972 879000 ~ 881031 (-)
G214549 NA non-coding downstream 6567 29481 ~ 35087 (-)
G214597 NA non-coding upstream 55993 108021 ~ 108619 (-)
G214599 NA non-coding upstream 57326 109354 ~ 110345 (-)
G214609 NA non-coding upstream 72077 124105 ~ 125144 (-)
G214614 NA non-coding upstream 73301 125329 ~ 125719 (-)
G214615 NA non-coding upstream 73820 125848 ~ 129206 (-)
G214663 NA other upstream 125695 177723 ~ 179591 (-)
G214982 NA other upstream 429019 481047 ~ 481609 (-)
G215354 NA other upstream 863931 915959 ~ 919673 (-)
G215950 NA other upstream 1548198 1600226 ~ 1618140 (-)

Expression


Co-expression Network