G215409


Basic Information

Item Value
gene id G215409
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 1010917 ~ 1014062 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU245167
tgtattccctgggacaatatgctgatgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtactgtattccatgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtactgtattccatgggacaatatgctgatgtgttgtacagtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccatgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtgctgtattccatgggacaatatgctGATGTGTTGTactttattccatgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatttgttgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgtgacaatatgctgatgtgttgtactgtattccatgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccatgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgtgacaatatgctgatgtgttgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccatgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgtgacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgtgacaatatgctgatgtgatgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattcccttggacaatatgctggacaatatgctgatgtgttgtaatgtattccatgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactttattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccatgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccctgggacaatatgctgatgtgttgtactgtattccatgggacaatatgctgatgtgttg

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106594577 isoform X16

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU245167 True 1479 lncRNA 0.43 3 1010917 1014062

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
irx1a LOC106593994 coding upstream 66086 940563 ~ 944831 (+)
LOC118964344 NA coding upstream 794514 213740 ~ 216403 (+)
LOC118964343 NA coding upstream 814401 195431 ~ 196516 (+)
LOC118944464 NA coding downstream 111255 1125317 ~ 1130309 (+)
LOC118944732 NA coding downstream 292945 1307007 ~ 1309337 (+)
LOC118944733 plekha8 coding downstream 521817 1535879 ~ 1538143 (+)
LOC118964346 LOC106597212 coding downstream 531195 1545257 ~ 1567659 (+)
LOC118944738 LOC100136727 coding downstream 595642 1609704 ~ 1611504 (+)
G215413 NA non-coding upstream 6346 1003699 ~ 1004571 (+)
G215356 NA non-coding upstream 85322 924501 ~ 925595 (+)
G215348 NA non-coding upstream 96045 914550 ~ 914872 (+)
G215333 NA non-coding upstream 106601 901063 ~ 904316 (+)
G215331 NA non-coding upstream 111580 899058 ~ 899337 (+)
G215410 NA non-coding downstream 204 1014266 ~ 1014868 (+)
G215427 NA non-coding downstream 5936 1019998 ~ 1020270 (+)
G215428 NA non-coding downstream 6986 1021048 ~ 1021389 (+)
G215436 NA non-coding downstream 19859 1033921 ~ 1458208 (+)
G215444 NA non-coding downstream 41819 1055881 ~ 1057198 (+)
G215012 NA other upstream 492730 516360 ~ 518187 (+)
G215455 NA other downstream 70380 1084442 ~ 1086530 (+)
G215792 NA other downstream 509207 1489352 ~ 1577030 (+)
G215820 LOC100136727 other downstream 595576 1609638 ~ 1616379 (+)
LOC118944469 LOC100136727 other downstream 621536 1635598 ~ 1680107 (+)
G215830 NA other downstream 656349 1670411 ~ 1747282 (+)

Expression


Co-expression Network