G220229 (LOC100135938)


Basic Information

Item Value
gene id G220229
gene name LOC100135938
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 7019976 ~ 7061831 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU251256
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>TU251257
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>TU251268
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Function

NR:

description
extracellular matrix protein 1 isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU251256 False 3661 lncRNA 0.44 5 7019976 7061831
TU251257 False 12047 TUCP 0.46 5 7019976 7061831
TU251259 False 13891 TUCP 0.43 4 7019976 7061831
TU251262 False 13555 TUCP 0.44 6 7019976 7061831
TU251265 False 2816 lncRNA 0.44 4 7019976 7061831
TU251255 False 15009 TUCP 0.45 4 7046693 7061831
TU251268 True 4849 lncRNA 0.43 4 7046693 7061831

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110508339 NA coding downstream 26131 6988898 ~ 6993845 (-)
zgc:174935 LOC106605997 coding downstream 40787 6976163 ~ 6979189 (-)
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Expression


Co-expression Network