G221896


Basic Information

Item Value
gene id G221896
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 8567672 ~ 8570629 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU253318
gtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatatgaacatactgttagaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatatgaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtaccc
>TU253319
gtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatatgaacatactgttagaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatatgaacatactgttagaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgttagaatgtacccagtgtttccctaacaaggtctgatattaacatactgaatgtacccagtgtttctctaacaaggtctgatattaacat

Function

NR:

description
PREDICTED: phosphofurin acidic cluster sorting protein 2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU253318 False 2402 lncRNA 0.49 3 8567672 8570629
TU253319 True 1392 lncRNA 0.35 3 8568576 8570629

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110520844 LOC106605887 coding downstream 72282 8466936 ~ 8495390 (-)
LOC110520794 LOC105024462 coding downstream 323929 8214332 ~ 8243743 (-)
si:dkey-246i14.3 LOC106570832 coding downstream 727197 7744358 ~ 7840475 (-)
LOC110520788 LOC106593005 coding downstream 950479 7577008 ~ 7617193 (-)
LOC110508498 NA coding downstream 992058 7573853 ~ 7575614 (-)
LOC110520892 LOC106605923 coding upstream 128406 8699031 ~ 8703263 (-)
LOC118964373 NA coding upstream 130834 8701463 ~ 8701598 (-)
LOC118964372 NA coding upstream 131254 8701883 ~ 8702017 (-)
LOC110520835 ash1l coding upstream 234022 8804651 ~ 8839679 (-)
LOC110516769 LOC100136250 coding upstream 283186 8853815 ~ 8862231 (-)
G221863 NA non-coding downstream 89846 8477456 ~ 8477826 (-)
G221855 NA non-coding downstream 103126 8461540 ~ 8464546 (-)
G221852 NA non-coding downstream 110191 8454161 ~ 8457481 (-)
G221835 NA non-coding downstream 141555 8425678 ~ 8426117 (-)
G221825 NA non-coding downstream 153642 8413662 ~ 8414030 (-)
G221922 NA non-coding upstream 38508 8609137 ~ 8611384 (-)
G221880 NA non-coding upstream 58054 8628683 ~ 8630117 (-)
G221952 NA non-coding upstream 110883 8681512 ~ 8682295 (-)
G221960 NA non-coding upstream 122745 8693374 ~ 8693897 (-)
G221961 NA non-coding upstream 123362 8693991 ~ 8694374 (-)
G221807 adar other downstream 44464 8503184 ~ 8523208 (-)
G221806 NA other downstream 156863 8394361 ~ 8410809 (-)
G221788 LOC106574877 other downstream 217383 8345683 ~ 8350289 (-)
LOC110508494 LOC106575071 other downstream 994200 7554786 ~ 7573519 (-)
LOC110508472 LOC106573847 other downstream 1037355 7528026 ~ 7530317 (-)
G221986 NA other upstream 192490 8763119 ~ 8763884 (-)
G222023 LOC100136250 other upstream 283188 8853817 ~ 8949187 (-)
G222465 NA other upstream 522551 9093180 ~ 9095216 (-)
LOC110501040 LOC106605812 other upstream 540344 9101425 ~ 9118437 (-)

Expression


Co-expression Network