G237162


Basic Information

Item Value
gene id G237162
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 23379046 ~ 23386403 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU271032
GTGAGGGGGACGACAAAAGCTCTGGGTGGATGAGCAGGCAGAAATATTAACAGCTTGAAAGAAAGATAATGAAAATGGGTATGTTTAGATAAAATGCTTGTTATTGTTTTTCTCGCAAAATACTGAGAAATATTACGCTATTCATAAATGTATTGCCTTTGGTGCGCGCGCTGACGGAATTTCCCGCGCTCTTCTGATACAACAGGAGCCACCAGTGCTCCAGTATCTTCCCACATCTGTAAGTGATTGTCTGAGGAAGGCAGGAGGAGCAGTGACAAGATGGATGAGGGGTCCAGGATGGCTGAGGGGAAGGCTGCTTTTGTcttcgtcctcctcctcttcatcgccCTGGCCTTGCTCATCGTGCGCTGCTTCCGCATCCTGCTGGACCCATACCGCAGCATGCCCTCCTCCAACTGGACAGACCACACAGAGAAGGACACGTTTGACTACCGCATTGTCTAAGGAGGACCTAAGGAGCTCCCTCGACACTGTTTTTCAGTTGAAGCACTGTCAACTATTGCAATGCTCGAGGAGCAACTTTGTTAATCCATTTTGCCCAAGGACCACATGCTGTATGACTGCCGGTGCCAAACCACCAGGGACCCCTTTGTATTAGATGCAGCCTTTGAGCATGCATCACCTAAAGGCCTTTGTCTGCTCTATTGTAACATGTTATATCAATTCCTTCGCCAATTACTGCAGTCATGAGCAGTAATAGCCAGCCCTTATTACCCTAATGACAACACATACGAGTGATTCCATACGAaaccaggtgggaaaaaggccATAATtttgctgatttaaaaaaaataagatttCATCCATAGAATGGTCCTTTGGAAGAATGATTGTTGACaaatatttgacatttgtatctaaaagcataattgagaaataatttATCAAAGTTGTCATATTTATGACATTTTGGCCTTACTCAGGCCTCCTAAAATACgccataatgtttcatctgtatgGGCTGCAAAGATGAAAATTGGTGTAATATTAATCTTTACCGCTTGCTCTGTAATATGAgtagcatttttattttttattttttatgaatgttgAAAAATAAAGACCTGAATAttgaaaaaacaacattttggaTTTGGCACATTTTTTTTGatattgttgaacataatacTCTACGGCCCTCCCACATAAGGAACTcccttaattgaaaggaaaaaccaaaaacctgcagacactcggccctcggtggaatgagtttgacacaacTGCGCTACGGGCATATCAAAGTTCCAGAGTGGGATCTATGCTACTTTTATAGTTATGATCCAGTTTGTTAACATtactaaaatggattcaaaatggtcggcctctgctggtgatttgcaTGAGGTGCAATGATGCAAGTAAAAGGAGGGCTGGGATTGGTTACATTGTCTGCTGTGCCAATTTCTCTATATAAAATGGGCCATAAAGTTAAACTAGCATTGATCCCACTTTGGAACTTTGATATGCCCCTAGagtatattatgttcaacaatataTTGAAACATTTGCCAAATACATATTTGTTTCTATATTCATGTTTCTATTTTTCAATATTCATAAATGAATGTACAAAAATGTTATTGAAATCATAATACTACTCATATTACAGAGCAAGTGTTAAAGTTACATATGACACCAATTTTTGCTTTTTAGCATCTACAGATGAAAccttatggagtcttaaaggaggcctgggtaTGGCAAAAATGCCATAATATGGCAACTTTGATTCAgtatttctcaattatgcttttagatacaactgtcaaatatatgtcaacaatccttcctccaaagCATCATTCTATGGATGAAATGTTTCAAAAATCCCCAAATCATCGTATTTTGTTTGTTCTGGTTTCGTATAGAATCACTTATAAGGAACATCTTCTACCAAATGGTCTAACACTATAGGCAATCACCTAAGGTACCTGCTGTAACACCTATCAAATCTATCTCCTGAAGACACTCTCCAGGCTACCTTGTTGCCACTACTATTGCATCATTTCACTACCCCATCCCCTTAAcctttcttggtagtcttaaacaaatcgacttagaaaaaaaagtgaaaacctcacacacatggtaatGGGTTTTAAAAAATAAGACACttttaccatgtcagatatagagttgaaatgtattcaattttgagttttcATCTCAATATTACATTTTATAGACATCACAGAGTACTGAAATATAACACAACCGTTTGACATAGCAACGCTGAATTTGTATTAATTATGagaaatatgaataacattccacccatgagaccACTTTTGGTCATtcgactgcaggaaagggctacaggtGCTCTATGCAACAGTTCCTCCTGCAAATAGGCCTACATTTCAATTGTGTACTTAAAGGAATTAAACTCCATGTAAGAACAAGAAAAACATTTGAATGCCGTTTGAAGCTATAAAGTTGCTTGTTTGCTGCAAGGTCCTCAGTATATACACAGTGTATCCTGTGGATTTTTTTTAACTTAAATTGTCTACTTTGGCCAAGGTACAAAATGCACAAACAATCAATCAAGTATCGCTCAAACAAAAATACACTTACACAGAAAAAACAAATGTAGTTACATTTATGCCAACCAGCGCCTTGTGCACTCACAAAGACCCTGACCCTCATTGAGCTGGTTGATATTTTTTGAAATTGGAAGAGAGATATTTCCTTTAACATCAGCCAGCCTATAACATAACATTGATATCCATATCTTTGTCACCCAGGTTCTTTGTTTTCTTGCCATCATGGAAAGAGAGGTAGACAATGTTTCAAAGTATCCTTTAAAGAGACTTCATTGTTTTTTGGGTGGCTTCAATGGGCCTTAGATGTTTGATGTTAGCAATGGGATAAATGTTAACTATTCAATGTCTGCAATCAAAAGAAATTACAAATAGACAACTTTGTCACTTTTTATGGAAAGGATGCAGAGTCATAAATCTGAATGACCAAATGAGGTTTATTGAAATGTTTACTGTGCCGTAACTTGTGCCTAATTATGAACATCTAGATGAGCATTTTAGGGAAATGAGTCAAAAAGATTCATACCAGTAGTTCTGTTGTAGATAGCATCTTGTTATAGTTCTATGTAATATCATTTTCATATCTGAAATAAAATAAAGCATATCACTGCCCACAGATGGCATGTTAGCAGTGTGCTACATCTGAACAGATTATCACACCTTGGACTATCCCTTTATGGACAATGTCTGTGTCTCTTTATTTGGGCAACTCCTTAACTGTACGCCTTATAGAGTAGCATGTTTACAGGTAGTCAATAGCTGACAGAAAAATATGTTATGCACTTCAAGCAGATGTCATACACCTACCAAAAGGTCGAGTGTGCTTTCACACTTTGACATGTGATGTTCTTGTGATAAACTGTGGTCTTTTGCTATCACAATGTATCAGTTTAGTGGTACCTTTCTGTGCACAAGTGTCTTTGCATGTTTTTGCAAAATTTCCCCTCCAAGCATGTTGAGTGCTTTACACATGTTGATGCTGCTGTTATTTATccggtacagtacagtattcacTGTCAACGTTTGAGTCTTCTTTTGAATGTGTATTACGCTTGCCTTGAGCCTCTTTCCTTTCATAATAAAAG
>TU271030
GTGAGGGGGACGACAAAAGCTCTGGGTGGATGAGCAGGCAGAAATATTAACAGCTTGAAAGAAAGATAATGAAAATGGGTATGTTTAGATAAAATGCTTGTTATTGTTTTTCTCGCAAAATACTGAGAAATATTACGCTATTCATAAATGTATTGCCTTTGGTGCGCGCGCTGACGGAATTTCCCGCGCTCTTCTGATACAACAGGAGCCACCAGTGCTCCAGTATCTTCCCACATCTGTAAGTGATTGTCTGAGGAAGGCAGGAGGAGCAGTGACAAGATGGATGAGGGGTCCAGGATGGCTGAGGGGAAGGCTGCTTTTGTcttcgtcctcctcctcttcatcgccCTGGCCTTGCTCATCGTGCGCTGCTTCCGCATCCTGCTGGACCCATACCGCAGCATGCCCTCCTCCAACTGGACAGACCACACAGAGAAGGACACGTTTGACTACCGCATTGTCTAAGGAGGACCTAAGGAGCTCCCTCGACACTGTTTTTCAGTTGAAGCACTGTCAACTATTGCAATGCTCGAGGAGCAACTTTGTTAATCCATTTTGCCCAAGGACCACATGCTGTATGACTGCCGGTGCCAAACCACCAGGGACCCCTTTGTATTAGATGCAGCCTTTGAGCATGCATCACCTAAAGGCCTTTGTCTGCTCTATTGTAACATGTTATATCAATTCCTTCGCCAATTACTGCAGTCATGAGCAGTAATAGCCAGCCCTTATTACCCTAATGACAACACATACGAGTGATTCCATACGAaaccaggtgggaaaaaggccATAATtttgctgatttaaaaaaaataagatttCATCCATAGAATGGTCCTTTGGAAGAATGATTGTTGACaaatatttgacatttgtatctaaaagcataattgagaaataatttATCAAAGTTGTCATATTTATGACATTTTGGCCTTACTCAGGCCTCCTAAAATACgccataatgtttcatctgtatgGGCTGCAAAGATGAAAATTGGTGTAATATTAATCTTTACCGCTTGCTCTGTAATATGAgtagcatttttattttttattttttatgaatgttgAAAAATAAAGACCTGAATAttgaaaaaacaacattttggaTTTGGCACATTTTTTTTGatattgttgaacataatacTCTACGGCCCTCCCACATAAGGAACTcccttaattgaaaggaaaaaccaaaaacctgcagacactcggccctcggtggaatgagtttgacacaacTGCGCTACGGGCATATCAAAGTTCCAGAGTGGGATCTATGCTACTTTTATAGTTATGATCCAGTTTGTTAACATtactaaaatggattcaaaatggtcggcctctgctggtgatttgcaTGAGGTGCAATGATGCAAGTAAAAGGAGGGCTGGGATTGGTTACATTGTCTGCTGTGCCAATTTCTCTATATAAAATGGGCCATAAAGTTAAACTAGCATTGATCCCACTTTGGAACTTTGATATGCCCCTAGagtatattatgttcaacaatataTTGAAACATTTGCCAAATACATATTTGTTTCTATATTCATGTTTCTATTTTTCAATATTCATGTTTATATTTTTCAATATTCATAAATGAATGTACAAAAATGTTATTGAAATCATAATACTACTCATATTACAGAGCAAGTGTTAAAGTTACATATGACACCAATTTTTGCTTTTTAGCATCTACAGATGAAAccttatggagtcttaaaggaggcctgggtaTGGCAAAAATGCCATAATATGGCAACTTTGATTCAgtatttctcaattatgcttttagatacaactgtcaaatatatgtcaacaatccttcctccaaagCATCATTCTATGGATGAAATGTTTCAAAAATCCCCAAATCATCGTATTTTGTTTGTTCTGGTTTCGTATAGAATCACTTATAAGGAACATCTTCTACCAAATGGTCTAACACTATAGGCAATCACCTAAGGTACCTGCTGTAACACCTATCAAATCTATCTCCTGAAGACACTCTCCAGGCTACCTTGTTGCCACTACTATTGCATCATTTCACTACCCCATCCCCTTAAcctttcttggtagtcttaaacaaatcgacttagaaaaaaaagtgaaaacctcacacacatggtaatGGGTTTTAAAAAATAAGACACttttaccatgtcagatatagagttgaaatgtattcaattttgagttttcATCTCAATATTACATTTTATAGACATCACAGAGTACTGAAATATAACACAACCGTTTGACATAGCAACGCTGAATTTGTATTAATTATGagaaatatgaataacattccacccatgagaccACTTTTGGTCATtcgactgcaggaaagggctacaggtGCTCTATGCAACAGTTCCTCCTGCAAATAGGCCTACATTTCAATTGTGTACTTAAAGGAATTAAACTCCATGTAAGAACAAGAAAAACATTTGAATGCCGTTTGAAGCTATAAAGTTGCTTGTTTGCTGCAAGGTCCTCAGTATATACACAGTGTATCCTGTGGATTTTTTTTAACTTAAATTGTCTACTTTGGCCAAGGTACAAAATGCACAAACAATCAATCAAGTATC
>TU271033
GTGAGGGGGACGACAAAAGCTCTGGGTGGATGAGCAGGCAGAAATATTAACAGCTTGAAAGAAAGATAATGAAAATGGGAGCCACCAGTGCTCCAGTATCTTCCCACATCTGTAAGTGATTGTCTGAGGAAGGCAGGAGGAGCAGTGACAAGATGGATGAGGGGTCCAGGATGGCTGAGGGGAAGGCTGCTTTTGTcttcgtcctcctcctcttcatcgccCTGGCCTTGCTCATCGTGCGCTGCTTCCGCATCCTGCTGGACCCATACCGCAGCATGCCCTCCTCCAACTGGACAGACCACACAGAGAAGGACACGTTTGACTACCGCATTGTCTAAGGAGGACCTAAGGAGCTCCCTCGACACTGTTTTTCAGTTGAAGCACTGTCAACTATTGCAATGCTCGAGGAGCAACTTTGTTAATCCATTTTGCCCAAGGACCACATGCTGTATGACTGCCGGTGCCAAACCACCAGGGACCCCTTTGTATTAGATGCAGCCTTTGAGCATGCATCACCTAAAGGCCTTTGTCTGCTCTATTGTAACATGTTATATCAATTCCTTCGCCAATTACTGCAGTCATGAGCAGTAATAGCCAGCCCTTATTACCCTAATGACAACACATACGAGTGATTCCATACGAaaccaggtgggaaaaaggccATAATtttgctgatttaaaaaaaataagatttCATCCATAGAATGGTCCTTTGGAAGAATGATTGTTGACaaatatttgacatttgtatctaaaagcataattgagaaataatttATCAAAGTTGTCATATTTATGACATTTTGGCCTTACTCAGGCCTCCTAAAATACgccataatgtttcatctgtatgGGCTGCAAAGATGAAAATTGGTGTAATATTAATCTTTACCGCTTGCTCTGTAATATGAgtagcatttttattttttattttttatgaatgttgAAAAATAAAGACCTGAATAttgaaaaaacaacattttggaTTTGGCACATTTTTTTTGatattgttgaacataatacTCTACGGCCCTCCCACATAAGGAACTcccttaattgaaaggaaaaaccaaaaacctgcagacactcggccctcggtggaatgagtttgacacaacTGCGCTACGGGCATATCAAAGTTCCAGAGTGGGATCTATGCTACTTTTATAGTTATGATCCAGTTTGTTAACATtactaaaatggattcaaaatggtcggcctctgctggtgatttgcaTGAGGTGCAATGATGCAAGTAAAAGGAGGGCTGGGATTGGTTACATTGTCTGCTGTGCCAATTTCTCTATATAAAATGGGCCATAAAGTTAAACTAGCATTGATCCCACTTTGGAACTTTGATATGCCCCTAGagtatattatgttcaacaatataTTGAAACATTTGCCAAATACATATTTGTTTCTATATTCATGTTTCTATTTTTCAATATTCATGTTTATATTTTTCAATATTCATAAATGAATGTACAAAAATGTTATTGAAATCATAATACTACTCATATTACAGAGCAAGTGTTAAAGTTACATATGACACCAATTTTTGCTTTTTAGCATCTACAGATGAAAccttatggagtcttaaaggaggcctgggtaTGGCAAAAATGCCATAATATGGCAACTTTGATTCAgtatttctcaattatgcttttagatacaactgtcaaatatatgtcaacaatccttcctccaaagCATCATTCTATGGATGAAATGTTTCAAAAATCCCCAAATCATCGTATTTTGTTTGTTCTGGTTTCGTATAGAATCACTTATAAGGAACATCTTCTACCAAATGGTCTAACACTATAGGCAATCACCTAAGGTACCTGCTGTAACACCTATCAAATCTATCTCCTGAAGACACTCTCCAGGCTACCTTGTTGCCACTACTATTGCATCATTTCACTACCCCATCCCCTTAAcctttcttggtagtcttaaacaaatcgacttagaaaaaaaagtgaaaacctcacacacatggtaatGGGTTTTAAAAAATAAGACACttttaccatgtcagatatagagttgaaatgtattcaattttgagttttcATCTCAATATTACATTTTATAGACATCACAGAGTACTGAAATATAACACAACCGTTTGACATAGCAACGCTGAATTTGTATTAATTATGagaaatatgaataacattccacccatgagaccACTTTTGGTCATtcgactgcaggaaagggctacaggtGCTCTATGCAACAGTTCCTCCTGCAAATAGGCCTACATTTCAATTGTGTACTTAAAGGAATTAAACTCCATGTAAGAACAAGAAAAACATTTGAATGCCGTTTGAAGCTATAAAGTTGCTTGTTTGCTGCAAGGTCCTCAGTATATACACAGTGTATCCTGTGGATTTTTTTTAACTTAAATTGTCTACTTTGGCCAAGGTACAAAATGCACAAACAATCAATCAAGTATC

Function

NR:

description
PREDICTED: cortexin-3-like

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU271032 False 3649 lncRNA 0.38 3 23379046 23386403
TU271030 False 2598 lncRNA 0.46 2 23380119 23386403
TU271033 True 2471 lncRNA 0.40 2 23380119 23386403

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110503934 LOC106581009 coding downstream 10155 23342123 ~ 23368891 (-)
LOC110514368 LOC106581124 coding downstream 182703 23172610 ~ 23196343 (-)
LOC110514348 LOC106581121 coding downstream 214662 23144516 ~ 23164384 (-)
LOC118944658 LOC100136303 coding downstream 236080 23140834 ~ 23142966 (-)
LOC110514382 NA coding downstream 238158 23138636 ~ 23140888 (-)
LOC110514498 LOC106580978 coding upstream 19850 23406253 ~ 23563491 (-)
LOC110514548 LOC106580919 coding upstream 323601 23710004 ~ 23713322 (-)
LOC110514538 tmod4 coding upstream 332986 23719389 ~ 23729898 (-)
LOC110514588 LOC106580904 coding upstream 381696 23768099 ~ 23770876 (-)
LOC110514600 ensa coding upstream 385108 23771511 ~ 23780158 (-)
G237114 NA non-coding downstream 84723 23294120 ~ 23294323 (-)
G237086 NA non-coding downstream 88064 23289532 ~ 23290982 (-)
G237108 NA non-coding downstream 98856 23266069 ~ 23280190 (-)
G237092 NA non-coding downstream 143104 23235738 ~ 23235942 (-)
G237080 NA non-coding downstream 171066 23207750 ~ 23207980 (-)
G237366 LOC106580947 non-coding upstream 298751 23685154 ~ 23686730 (-)
G237396 NA non-coding upstream 363151 23749554 ~ 23749821 (-)
G237457 NA non-coding upstream 480869 23867272 ~ 23867534 (-)
G237462 NA non-coding upstream 485267 23871670 ~ 23871871 (-)
G237463 NA non-coding upstream 485858 23872261 ~ 23872770 (-)
G237047 NA other downstream 190015 23157109 ~ 23189031 (-)
G235881 NA other downstream 804057 22573833 ~ 22574989 (-)
LOC118946878 NA other downstream 1623545 21744425 ~ 21755710 (-)
G235092 LOC100194668 other downstream 1635635 21738845 ~ 21743411 (-)
G234621 NA other downstream 1880214 21498408 ~ 21498832 (-)
G237657 LOC106605316 other upstream 794153 24180556 ~ 24183964 (-)
G237832 NA other upstream 1134816 24521219 ~ 24521544 (-)
LOC110515154 LOC106605289 other upstream 1383159 24767049 ~ 24799511 (-)
LOC110515208 LOC106581894 other upstream 1550113 24936516 ~ 25052970 (-)

Expression


Co-expression Network