G263516


Basic Information

Item Value
gene id G263516
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 45825683 ~ 45830272 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU299640
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>TU299641
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU299640 False 4453 lncRNA 0.39 2 45825683 45830272
TU299641 True 4430 lncRNA 0.39 3 45825683 45830272

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
asic4a LOC106586149 coding upstream 2382 45726237 ~ 45823301 (+)
LOC110520030 gmpaa coding upstream 245680 45571650 ~ 45580003 (+)
pnkd pnkd coding upstream 264301 45549912 ~ 45561382 (+)
dars1 sydc coding upstream 286385 45509465 ~ 45539298 (+)
LOC110520024 cxcr4 coding upstream 323544 45500138 ~ 45502139 (+)
LOC110504149 wnt6 coding downstream 21910 45852182 ~ 45884194 (+)
LOC110520033 LOC106586153 coding downstream 73393 45903665 ~ 45933022 (+)
LOC110520034 LOC106586154 coding downstream 177927 46008199 ~ 46010647 (+)
LOC118957146 NA coding downstream 202493 46032765 ~ 46043845 (+)
LOC110520040 LOC106586160 coding downstream 511576 46341848 ~ 46441801 (+)
G263453 NA non-coding upstream 135825 45689470 ~ 45689858 (+)
G263399 NA non-coding upstream 181289 45644193 ~ 45644394 (+)
G263376 NA non-coding upstream 201190 45624277 ~ 45624493 (+)
G263372 NA non-coding upstream 202377 45622998 ~ 45623306 (+)
G263362 NA non-coding upstream 208334 45617138 ~ 45617349 (+)
G263549 NA non-coding downstream 3363 45833635 ~ 45833881 (+)
G263548 NA non-coding downstream 4005 45834277 ~ 45836050 (+)
G263550 NA non-coding downstream 10262 45840534 ~ 45840763 (+)
G263552 NA non-coding downstream 11931 45842203 ~ 45842458 (+)
G263553 NA non-coding downstream 12582 45842854 ~ 45843067 (+)
G262037 NA other upstream 1300275 44520419 ~ 44525408 (+)
G261749 NA other upstream 1573132 44252069 ~ 44252551 (+)
LOC110519969 LOC106586020 other upstream 5373503 40440040 ~ 40452542 (+)
LOC110519960 LOC106586058 other upstream 6157595 39658753 ~ 39668297 (+)
G254816 NA other upstream 6981127 38843510 ~ 38844556 (+)
G263547 LOC106586150 other downstream 8649 45838921 ~ 45839480 (+)
G263710 NA other downstream 103847 45934119 ~ 45934418 (+)
G263733 LOC106586158 other downstream 245212 46075484 ~ 46079425 (+)
G263859 LOC107588258 other downstream 353862 46184134 ~ 46184804 (+)
LOC110520046 LOC106586167 other downstream 1000736 46801058 ~ 46832288 (+)

Expression


Co-expression Network