G280315


Basic Information

Item Value
gene id G280315
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 60052716 ~ 60054417 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU317976
TGTATTTAGAACAACTTGGTGGACTTTGTGGTTAAAAACCTCTTGCTCACAGGGTAGAGGTGCCTTTTCCTTATTTTGGGTGTATAtttcagtctcctctcctccccctatagCCATTTTTTGATTTTGTACAGAAACCACCCACCCATTGGAGAGATTGAGGCTCTGTTGCATTACTGATGAATACTTGTCTATCCTGcatctactgtatatctctctctcaccatcattTCGTATCAATTTAACCGGTATTCATAATCAATATGTATTTCATTCCTATCTGTGGTCTGAGGAAGCACTATGGGCCTTGGATAATGCGTACATACTGTACCCACAGACACAATTTAACAAACACATATAGCCTTTGCTCTTCTTGGGCAGCCACATGATGCTAGATTTACTGGTATCCCTCGTATATCCAGTCAGACCCTGACCCCTGCTCTCTGATGGTGGAATTGGGTAAACCAAATAGCTTTTTGCCTGGATTATATTGTAGATTTAAATTGACATATTAGTCTGTTGGTCTATGGTTATTGGTTTGGTTTATTGAATTGGTTCTTCATGATttcattgattggttgattgggaTTTATCTGACTGTAGTCTAGAATGTCTGGTCCTTGTCCTAGACCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCAAGTACTGGTCTTAGTCTTGGTCCTAGTACTAGTCCTGGTCCTGGTTTTAGTCCTGGAGCTGGTCCTATACCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGTTCCTGGCCCTGGTCCAAGTCCTGGTCCTAGTCCTGGTCTTCATCCTGGTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTCGCCCTAGTCCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTGGTCTTAGTCCTGGAGATGGTCCTAGACCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTAGTACTAGTCCTGGTCCTGGTTTTAGTCCTGGAGCTGGTCCTAGACCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGTTCCTGGCCCTGGTCCAAGTCCTGGTCCTAGTCCTGGTCCTGGTCTTCATCCTGGTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTCGCCCTAGTCCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTGGTCTTAGTCCTGGAGATGGTCCTAGACCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTAGTCCTGGTCCTGGTCTTAGTCCTGGAGCTGGTTCTAGACCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTGGAGCTGGTCCTAGACCTGGTCCTAGTTCTGGTCCTAGTCCTGGTCCTGGAGCTGGTCCTAGACCTGTTCCTGGTCCTGGTCCTAGTCCTGGAGCTGGTCCTAGACCTTGTCCTAGTCCTGGTCCTAGTCCTGGTCCTAGTCCTGGAACTGGTCCTAGACCTGTTCCAGGTCCTAGTCCTGGAGCTGGTCCTAGACCTGTTCCTGGTCCTGGTCCTAGTCTTGGGTCAGGCATCAGACAGAGCTGTAGCAGCAGAGCCTCTGATGTGTGGCTGAGGTTCCATGGAGGAGAGCTctactctctttccatccctTTGCTTTACAGGATGTTATTGTCTGAATCTACTTCAGCGCTGCTTCCAACTGAAGGTTTTACCATTCCCAAGGCTATAACATTTAAATACTTTTCCCGCAGTT
>TU317977
TGTATTTAGAACAACTTGGTGGACTTTGTGGTTAAAAACCTCTTGCTCACAGGGTAGAGGTGCCTTTTCCTTATTTTGGGTGTATAtttcagtctcctctcctccccctatagCCATTTTTTGATTTTGTACAGAAACCACCCACCCATTGGAGAGATTGAGGCTCTGTTGCATTACTGATGAATACTTGTCTATCCTGcatctactgtatatctctctctcaccatcattTCGTATCAATTTAACCGGTATTCATAATCAATATGTATTTCATTCCTATCTGTGGTCTGAGGAAGCACTATGGGCCTTGGATAATGCGTACATACTGTACCCACAGACACAATTTAACAAACACATATAGCCTTTGCTCTTCTTGGGCAGCCACATGATGCTAGATTTACTGGTATCCCTCGTATATCCAGTCAGACCCTGACCCCTGCTCTCTGATGGTGGAATTGGGTAAACCAAATAGCTTTTTGCCTGGATTATATTGTAGATTTAAATTGACATATTAGTCTGTTGGTCTATGGTTATTGGTTTGGTTTATTGAATTGGTTCTTCATGATttcattgattggttgattgggaTTTATCTGACTGTAGTCTAGAATGTCTGGTCCTTGTCCTAGACCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCAAGTACTGGTCTTAGTCTTGGTCCTAGTACTAGTCCTGGTCCTGGTTTTAGTCCTGGAGCTGGTCCTATACCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGTTCCTGGCCCTGGTCCAAGTCCTGGTCCTAGTCCTGGTCTTCATCCTGGTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTCGCCCTAGTCCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTGGTCTTAGTCCTGGAGATGGTCCTAGACCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTAGTCCTGGTCCTGGTCTTAGTCCTGGAGCTGGTTCTAGACCTGTTCCTGGCCCTAGTCCTGGTCCTGGAGCTGGTCCTAGACCTGGTCCTAGTTCTGGTCCTAGTCCTGGTCCTGGAGCTGGTCCTAGACCTGTTCCTGGTCCTGGTCCTAGTCCTGGAGCTGGTCCTAGACCTTGTCCTAGTCCTGGTCCTAGTCCTGGTCCTAGTCCTGGAACTGGTCCTAGACCTGTTCCAGGTCCTAGTCCTGGAGCTGGTCCTAGACCTGTTCCTGGTCCTGGAGCTGGTCCTAGACCTGTTCCTGGTCCTGGTCCTAGTCTTGGGTCAGGCATCAGACAGAGCTGTAGCAGCAGAGCCTCTGATGTGTGGCTGAGGTTCCATGGAGGAGAGCTctactctctttccatccctTTGCTTTACAGGATGTTATTGTCTGAATCTACTTCAGCGCTGCTTCCAACTGAAGGTTTTACCATTCCCAAGGCTATAACATTTAAATACTTTTCCCGCAGTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU317976 False 1672 TUCP 0.50 2 60052716 60054417
TU317977 True 1444 TUCP 0.48 2 60052716 60054417

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
erbb4b LOC106586446 coding upstream 422 59870559 ~ 60052294 (+)
ikzf2 LOC106586445 coding upstream 470760 59556678 ~ 59581956 (+)
LOC110505376 NA coding upstream 537655 59513445 ~ 59515061 (+)
LOC118944557 NA coding upstream 958511 59093144 ~ 59094205 (+)
abca12 abca12 coding upstream 987924 58961640 ~ 59064792 (+)
LOC110505381 NA coding downstream 213225 60267642 ~ 60269899 (+)
myl1 LOC100135947 coding downstream 222828 60277245 ~ 60286080 (+)
LOC118964303 NA coding downstream 328257 60382674 ~ 60383352 (+)
tgfbr2l LOC106586454 coding downstream 580122 60634539 ~ 60654313 (+)
LOC110520315 ube2e3 coding downstream 1276942 61331359 ~ 61370875 (+)
G280331 NA non-coding upstream 361526 59607537 ~ 59691190 (+)
G280324 NA non-coding upstream 459316 59593130 ~ 59593400 (+)
G280240 NA non-coding upstream 575728 59474706 ~ 59476988 (+)
G280168 NA non-coding upstream 642636 59409672 ~ 59410080 (+)
G280143 NA non-coding upstream 664496 59387974 ~ 59388220 (+)
G280950 NA non-coding downstream 6549 60060966 ~ 60061230 (+)
G280977 NA non-coding downstream 33747 60088164 ~ 60088370 (+)
G280994 NA non-coding downstream 45779 60100196 ~ 60100412 (+)
G280995 NA non-coding downstream 46359 60100776 ~ 60101155 (+)
G281024 NA non-coding downstream 72384 60126801 ~ 60127026 (+)
G277973 NA other upstream 2262384 57789734 ~ 57790332 (+)
G277296 NA other upstream 2787824 57264567 ~ 57264892 (+)
G275553 LOC107595854 other upstream 4136583 55915329 ~ 55916133 (+)
G275542 LOC106586374 other upstream 4151973 55900194 ~ 55900743 (+)
LOC110520231 dbr1 other upstream 4677190 55371759 ~ 55375526 (+)
G281141 NA other downstream 232971 60287388 ~ 60303967 (+)
G281591 LOC106586456 other downstream 685822 60740239 ~ 60757350 (+)
G281714 NA other downstream 837107 60891524 ~ 60893778 (+)
G281996 NA other downstream 979349 61033766 ~ 61037105 (+)
G282707 il-1rii other downstream 1902971 61957388 ~ 61964066 (+)

Expression


Co-expression Network