G281303



Basic Information


Item Value
gene id G281303
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 60287388 ~ 60303967 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU319024
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>TU319025
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>TU319026
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>TU319029
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>TU319031
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>TU319032
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Function


NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU319024 False 2966 lncRNA 0.39 3 60287388 60290510
TU319025 False 1708 lncRNA 0.37 2 60287388 60303967
TU319026 False 2998 lncRNA 0.39 2 60287388 60290510
TU319029 False 3194 lncRNA 0.39 2 60287388 60290613
TU319031 False 3069 lncRNA 0.38 3 60287388 60290613
TU319032 True 3101 lncRNA 0.38 2 60287388 60290613

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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vwc2l LOC106586444 coding downstream 1142552 59115416 ~ 59144836 (-)
LOC110520290 myo1b coding downstream 1355134 58775631 ~ 58932254 (-)
LOC110520289 LOC106586438 coding downstream 1512760 58766427 ~ 58774628 (-)
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G281299 NA non-coding downstream 28364 60258676 ~ 60259024 (-)
G281272 NA non-coding downstream 75303 60211824 ~ 60212085 (-)
G281257 NA non-coding downstream 109284 60177694 ~ 60178104 (-)
G281221 NA non-coding downstream 121483 60164508 ~ 60165905 (-)
G281250 NA non-coding downstream 123853 60163330 ~ 60163535 (-)
map2 LOC106586448 non-coding upstream 29982 60292403 ~ 60416303 (-)
G281359 NA non-coding upstream 47596 60351563 ~ 60352019 (-)
G281375 NA non-coding upstream 74960 60378927 ~ 60379126 (-)
G281376 NA non-coding upstream 77012 60380979 ~ 60381185 (-)
G281390 NA non-coding upstream 101828 60405795 ~ 60406060 (-)
G277749 LOC106586429 other downstream 2698205 57584386 ~ 57589183 (-)
G277673 LOC106586423 other downstream 2883813 57402984 ~ 57403575 (-)
si:dkey-91i10.3 LOC106586420 other downstream 2989626 57270782 ~ 57297762 (-)
G275250 NA other downstream 4875901 55410143 ~ 55411487 (-)
LOC110520227 plekhm3 other downstream 5168176 55068639 ~ 55122013 (-)
G284018 NA other upstream 2410608 62714575 ~ 62715177 (-)
G286522 NA other upstream 4665582 64969549 ~ 64970755 (-)
G286580 marco other upstream 4710292 65014259 ~ 65029736 (-)
G286638 NA other upstream 4750733 65054700 ~ 65075985 (-)
G286953 LOC107579696 other upstream 4931213 65235180 ~ 65235908 (-)

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