G286391



Basic Information


Item Value
gene id G286391
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 64923188 ~ 64924561 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU324669
GCTGTTGACTATAGATATGGTGCACTATGCTGTTAACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCACTGTGCTGTTGACTATAGATATGGTGCACTGTGCTGTTGACTATAGATATGGTGCACTGTGCTGTTGACTATAGATATGGTGCACTGTGCTGTTGACTATAGATATGGTGCCCTGTGCTGTTAACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCACTATGCTGTTAACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCCCTGTGCTGTTAACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCACTATGCTGTTAACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCCCTGTGCTGTTGACTATAGATATGGTGCACTATGCTGTTAACTATAGATATGGTGCCCTGTGCTGTTTACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCCCTGTGCTGTTTACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCTCTGTGCTGTTTACTATAGATATGGTGCCCTGTGCTGTTTACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCACTGTGGTGTTGACTATAGATATGGTGCCCTGTGCTGTTTACTATAGATATGGTGCCCTGTGCTGTTGACTATAGATATGGTGCCCTGTGCTGTTTACTATAGATATGGTGCCCTGTGC

Function


NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106611203

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU324669 True 982 lncRNA 0.42 2 64923188 64924561

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
insig2 LOC104950207 coding upstream 8792 64908646 ~ 64914396 (+)
zgc:152951 glrx coding upstream 61214 64854740 ~ 64861974 (+)
LOC110520382 LOC106586539 coding upstream 540397 64380591 ~ 64382791 (+)
LOC110520383 LOC106586541 coding upstream 948712 63972679 ~ 63974476 (+)
LOC110504443 fbxo47 coding upstream 1022995 63894665 ~ 63900193 (+)
marco marco coding downstream 89730 65014291 ~ 65029795 (+)
steap3 LOC106586584 coding downstream 208708 65133269 ~ 65146515 (+)
LOC110520396 LOC100136409 coding downstream 236781 65161342 ~ 65166580 (+)
tmem37 tmem37 coding downstream 247068 65170904 ~ 65176413 (+)
LOC110520399 LOC106586589 coding downstream 267496 65192057 ~ 65212814 (+)
G286367 LOC107660631 non-coding upstream 38981 64883150 ~ 64884207 (+)
G286358 NA non-coding upstream 51737 64871242 ~ 64871451 (+)
G286357 NA non-coding upstream 52187 64870709 ~ 64871001 (+)
G286356 NA non-coding upstream 52541 64870204 ~ 64870647 (+)
G286398 NA non-coding downstream 5966 64930527 ~ 64931115 (+)
G286508 NA non-coding downstream 36372 64960933 ~ 64961149 (+)
G286532 NA non-coding downstream 51907 64976468 ~ 64976692 (+)
G286535 NA non-coding downstream 55048 64979609 ~ 64980333 (+)
G286546 en1 non-coding downstream 63189 64987750 ~ 64992120 (+)
G285763 NA other upstream 615828 64306512 ~ 64307360 (+)
G285203 NA other upstream 839206 64071432 ~ 64083982 (+)
G285001 NA other upstream 1177695 63743006 ~ 63745493 (+)
G284986 LOC106586530 other upstream 1201124 63706568 ~ 63722064 (+)
G284599 NA other upstream 1531904 63390931 ~ 63391284 (+)
G286679 NA other downstream 184695 65109256 ~ 65109637 (+)
zmym2 LOC106586592 other downstream 335884 65260200 ~ 65311166 (+)
LOC118964312 LOC106586611 other downstream 1109859 66027633 ~ 66036299 (+)
G288252 NA other downstream 1625261 66549822 ~ 66550487 (+)

Expression



Co-expression Network