G289116


Basic Information

Item Value
gene id G289116
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 67474973 ~ 67478929 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU327792
ggtttctgctgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtggtttctgctgcgtgtgtggtttctgctgtgtgtggtttgtgctgtgtgtgtggtttgtgctgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttgtttctgctttgtatgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgggggttctgctgtgtgtgtgtgtgggttctgctgtgtgtgtgtgggggttctgctgtgtgtgtgtgtctgtttgtgtggtttctgctgtgtgtggtttcttctgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgttttgtttctgctgtgtgtgtgtgtttgtttgtttggtttcTGCTGTGTGTCTGGTTTCTTCTGCGTGTGTTGtttctgctgtgtgtctgtgtgtgtggtttcttctgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtttgtgctgtgtgtggtttgtgctgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgggttctgctgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtttggttagtgtgtgtgtgtttggttagtgtgtgtgtttggtttatgctgtgtgtgtgtgtgtgtgggttctgctgtgtgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtggtttctgctgtgttttgtttctgctgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgggttctgctgtgtgtgtgtgtgtgggttctgctgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttgtttctgctttgtatgtgtgtgtggtttctgctgtgtatgtgtgttttgtttctgctgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtggtttctgctttgtgtgtgtggtttctgttGTGTGTTTTTCGTGTGTGGTTTCTTCTGCGTGTGTGttgtttctgctgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtggtttcttatgtgtgtttgttgtttctgttgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtgtgggggttctgctgtgtgtatgtgtgttttgtttctgctttgtatgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtttctgctgtgtgtgtggtttcttctgtgtgtttgttgtttctgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgggttctgctgtgtgtgtgtgtgtgggttctgctgtgtgtgtgggttctgctgtgtgtgtgtgtgttttgtttctgctttgtatgtgtgtgtggtttctgctgtgtgtgtgtgtgtgttttgtttctgctgtgtgtgtgtg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU327792 True 1682 TUCP 0.48 2 67474973 67478929

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110520449 LOC106586635 coding upstream 46601 67418016 ~ 67428372 (+)
LOC110520448 LOC106586634 coding upstream 65327 67397151 ~ 67409646 (+)
LOC110520447 LOC106586633 coding upstream 80642 67370922 ~ 67394331 (+)
LOC110520446 LOC106586632 coding upstream 111997 67309297 ~ 67362976 (+)
LOC110520445 LOC106586631 coding upstream 165871 67303373 ~ 67309102 (+)
LOC110505416 LOC106586647 coding downstream 40441 67519326 ~ 67520162 (+)
LOC118964316 NA coding downstream 42629 67521551 ~ 67522717 (+)
LOC110504522 LOC106586570 coding downstream 120972 67599901 ~ 67603232 (+)
LOC118936465 LOC106586642 coding downstream 247964 67726893 ~ 67734046 (+)
LOC110520459 LOC106586086 coding downstream 402487 67881416 ~ 67887339 (+)
G289111 NA non-coding upstream 20406 67454278 ~ 67454567 (+)
G289106 NA non-coding upstream 38372 67436309 ~ 67436601 (+)
G289104 NA non-coding upstream 38956 67434519 ~ 67436017 (+)
G289043 NA non-coding upstream 45470 67411665 ~ 67429503 (+)
G289094 NA non-coding upstream 70360 67404387 ~ 67404613 (+)
G289130 NA non-coding downstream 31834 67510763 ~ 67510991 (+)
G289134 NA non-coding downstream 39577 67518506 ~ 67518799 (+)
G289136 NA non-coding downstream 41955 67520884 ~ 67521229 (+)
G289138 NA non-coding downstream 43174 67522103 ~ 67526207 (+)
G288674 NA other upstream 480842 66993171 ~ 66994131 (+)
LOC110505407 LOC106586622 other upstream 690187 66783373 ~ 66787442 (+)
G288430 NA other upstream 741176 66731286 ~ 66733797 (+)
G288252 NA other upstream 924486 66549822 ~ 66550487 (+)
G289455 NA other downstream 146424 67625353 ~ 67632210 (+)
G289486 NA other downstream 199933 67678862 ~ 67682122 (+)
G289517 NA other downstream 282808 67761737 ~ 67762423 (+)
G289883 NA other downstream 744796 68223725 ~ 68225306 (+)

Expression


Co-expression Network