XLOC_022245 (dnajc5ab)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_022245
gene name dnajc5ab
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 17472702 ~ 17509656 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00043916
AAAGAGGAGGTGGTTGTTGGTGTGAggggagagagagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgcgcgtgtgtgtgagtaATGGCGGAGCAGCAAAGGCAGCGAGCGCTCTCCACGTCAGGAGAATCGCTATATGTGGTGCTGGGGGTCGAGAAGAACACTGCACAAGAAGACATAAAGAAATCCTACAGAAAACTTGCTCTGAAATTCCACCCGGACAAGAATCCCAACAATCCAGAAGCTGCTGATAAATTTAAAGAAATCAACAACGCTCATGCTATTCTGTCAGACCCCACCAAACGCAATATTTATGACAAATACGGCTCTCTGGGCCTCTACGTGGCAGAACAATTCGGAGAGGAGAATGTTAACACATACTTTGTATTGTCCAGCTGGTGGGCCAAGGCGCTGTTTATATTCTGCGGTGTGGCCACGGGCTGTTATTTCTGCTGCTGTCTGTGCTGCTGTTGTAATTGCTGCTGTGGGAAGTGTAAACCTCATCCTCCTCACTCAGATGATCCTGATTTCTACGTGTCTCCTGAAGACTTGGAAGCTCAGATGCAGTCTGATGAGAGAGACGGCAGCAGCCCTATCATGATGCAGCCGTCCTCTGCCACAGAAAGCACTCAGCTGACCGCAGACTCTCACCACACCAGCTACCGGACAGACGCCAACTATTAAACACGGGACCACCAGTACACACAAGCTCACGGTGGGCAACGAGGGATTAGTTAGTTGCAGATCTTCTGTTGTATTATTGGAAAACCTGAAACGCTCCACTGTACAGGGCCAGAAGCGAGTCTTGATATTTGTTTGCCTTTTACATCTGTTTTCCccaaacctacacacacacacacacacatctacacaacACAGACAAGGACTTTCCTATAGTGTCCGTTCAGTCTTCCTGCTTTTATTCCATGATTCCGCTTTCCAGAGGCTTTTGTTTGTGCGTCTTTCGTTCATGATCACACTTCATTTGTCTGTGTGAAaatcattttattgaatttttatgttttgtcattGTTTTAAACGTAAATAGTTTGGAACAGTAGAAAACTAATCAATGTATGGTTAGATGATGGTACATCTTTACTACCATTGACGTTTGTGGtcagtaagttttttttaattattatgaattattgaatgatgATGTTTTTATCCAGCAAGGactttaaattgatcaaaagtaacATTAATAGCAGCATTTCTAACATAatcaaatacttttatttaaaattctgtTCTTTTTAATGGTTAATTGAAGACCAATTGtaagttttcaacatcaaaaatattatcaaacacaaAATCAGCACATTTCCGAATTATTTCTAAATAATCTtgagacactgaagactggagaaatGTATGGAAGCCCATAATTCTAACCTCTTTCTTACAGTTTTGAGTTTGTGTCTCAAAGTTCTGACTTTTCTCTTGCAATTCTTGAGTTTACATTTCACAAGTAACTTATTTTACATCATAATTGcgagtttatagtttacatttTGAAGTTTATAGTTTCACACATCAAGAGAAATCTTACCAACCTTAAGCATTTTATAAACTGAGTACATTTCTATGCATTTGATTGGCTCTCTCTGGCAAAAACCTCACAATTGCATGATAAATATTGTCTTGGATTGTTTTCTAGATTTTAAACTATGTTGGTCTTTCATTAGAAATGTTCTGCTCACTTTATTTACTAGTATCAAGAGATTTCTTAACAGTTTACAGAGTAGTGTAATATCTGAGGACAAGAAGGGAAACATAACTGTGTCTTGTTTATCTGTGACACCTTTCTTGTTACAACATCTGGTGGGAGTGTATGCCGTATTTTGCTGTGCTCAATTTTAGCGTGTGTGTGCGCTGGGTGTTGTGGTTTGAGGACACAAATTTGTGTAATGGCATTGCTATGACCTAGGTAtcaccaaagtccctttaagaaaAGTCAGTTCAGTATGCGGCCATTTTTGAAACCCCTCTCGGTTAATGTGCTTCGGTATTCTGTTTGCATGGGGatacatcaaattctccaaaattgccggccaagcttacgattacatatTAGTAATCACTAATTTGTGCATTGACATTAGCATGACCTAGGtattaccaaagtccctttaaggcaagtcatttcactctgctGCCATCTTTGAACCTCCTCTCGATTAGTATGCTTGGCGTTCTGTTTGAACGGGGAAACATCAatttctccaaaattgcttgccaagctttcAATTACATATTAGGAATTgctcatttgtgttctgacatTGATATGACCTAGGtattaccaaagtccctttaaggcaagtcattttagtATGTGGCCATCTTTAATACCCATCTCGGTTaatatgcttgggcattctgtttgaataggaatcatcaaattctctaaaattgtttgccaagcttatgattacatatTAGGTATCACTAATAAAATGAACCAACTGTCTTTTTActttaatttctaaacatttgaatcaTGGAAAATCTGCACAAACTCACGTCTGATCTGAGCCTCTCCAATggagaatcgtcagtctatagcgactgatgattggctcctgtagaagaaggcggggcttcattggCTATATTAACCGTTTCACTTTTCCGCATTCAAAACTATGAGTGACTTGTCTTGTGTATCTTATAGTGTTTGGTATTACAATGTTGAGGTGGTTTGAGTACATCTCTTGTGTCCTCGTGCTTCAAAATGCTTCAAATCATACTTAATAAGGTCTTTTGACATTTCAAAATTTCTCATGTTTTTTTGTGAGGATTGGGCTTGGGGTAAAGCCAAAATAAGTAGTCTTTTATGTGTACGTCGATGTAGAGTCCTCATTAACCACAAAAACCAACATGTGTATGTTATTGTAAGAGAGTGATATCGCTAGAACAGTGATTGGGCTTGTTGGATACACACTAAGGCTGAGTAAGGTTATTTATTCTTGAACTTGcggttttttttttgtccatctgtACTTGCGTCTTCTTAAGGCTTCGCTAGGTTGAAGAGTTGTGTTAGAATTAGTGTTTGCATTCCTCATGTTTGTGGTTTTGGATGCGGTAGTCACATGTGAAATGAGCACAGGAGGATTGTGGGTGAACTCATAGTTGCTAGCAAGGGTCATTGGAAAATATGCACTCACCAGAATTTTTGCCCCCTCTCCAAGCGCTAGATTTAATAAACGGCGCTCATAGATTCCACATTTCCAAAAATACCTCACATTTACCTCAAGTTATTTGATTAATAAACTTGATTCTTTTTAGTCTGATTAGTTTTTTTCTTCCCTGTGTTTCTAGACTGTTGCCTAATGATTTCTCGGTTTGCtgttatattttgttttaccTGTAATTGTACCCATAATTTGATCTCACTCCCTAGTGCCACGAGTTAATAAAATCATGTCGACATAATATTTTACTCTAGGGGATGCACATTGGCAGTATTATTACTGTTACTATGCTTGGAAATATAACTCTGGTCCTCAGACTACAATGATTCTGGCTCATTGGTTTTGATCAGATACAAAATTTAGCGTCAAGGCTagtttaaaatggtgttttacctgccatagaaattaataaaaaggtaacactttacagtaaggtttcattagataatgttaatgtatttactaaaataaacaaaataataaagatttattactgtatttgatCCTCTTTGTTAGTTGAAAATAGTCATTCATTGTTTGTCATCATAACCTCCTAGTGCATTAAATacaatgaataaatgctgtacaagtattgttcattcttattacatacatttttacatttacacacattttttttgccCGAAtcagaattttattattttattttatttttaattttttaaaattatttatttaatgaaaataaacgaTAAGTTATTAACATAAATTCAGAAATATATAGTTATGGcaaaactcaaaaataaacatttgcatattttttccagtatcgtgcagccctaatggtAAATCAATCTCCTTTATAATAAAACCCAcaatataaaactaaaacaaatcttATTGTTTCCTcctccttttccttttctttcatCCCTCTGAGTACATGagttttatttttgatatatGTGGGCATAAGCATACAGACTTCAAAGTAGAAATGTTTCAATTCTGTTTTAGGCTGTGTGTGTGGTTGAAATCGAGCTCTGAAATGAATCACTGTACCACcattattgttcttttttttttaaagacatttcttgAAACTGGATTTCAGCTGTGTGTCTGCCTGTGTTTGGGCATGCGTCTCTCCATACATTCATTTTCATGCCTCTCAAATGGGCCATGCAGAAAACGTGTGTAATTTACCCCCAAATGTATACATTTTCGAATAGGTTCACATTGTGGATATTTTAGAGATGTGTagataattgttttgtttgttttgtttttttatttatgtctgAAGCATTAGGCCGATTATTATTAGTGATCATGTTTCTAATCGTTCACAGTGTGTAATGCTTTTTATTGGATAAATTTAATTTCTCAACACGAGCTCTGCTGTAACGTAGCTACTGACCTACTTTTGGTTTGAATTATCCTGTTTATCCTTTATTTGTTGTGTTCATTTATCATTAATAATCAGACACTGAATCTTAAGAATGAACAGAGCATCTTCTGAATTTAACATGTAAACAGAATCATGTTATTAATGAAGGATATAGTGTAAACATGGTGATgagaaacaatattttatttattattttccaatgtttttaaaaaatgacgtAGTCGGATGTAAGCGAATATATGACCGTTGTACAGAATGGCTGATTTCTTGTTTGCGTTCTGGATCAATCAGCTGAAAGTGTTGTAGCATGAATATAAAGTACTGTGTCAGAGAGATGTAATGTGGATTAATGATCGGAATTACAGCTGTTAAATAAATGTGCAGGAAGCTGAAAAAGTATCTGCTGTTTGTGTGGAT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>TCONS_00043917
GATCATAAGACCAGGACGCGTATAATCGAGCACCGTGTGTGTATTTCCCTGTTTCCGAAGGCCATTTAACCATATAGGAAAGCATTTCAGAAGAACCGAAGATCTGCACACGACCTGCGTTTCTCTCTTTGACGAAAGAGGAGGTGGTTGTTGGTGTGAggggagagagagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgcgcgtgtgtgtgagtaATGGCGGAGCAGCAAAGGCAGCGAGCGCTCTCCACGTCAGGAGAATCGCTATATGTGGTGCTGGGGGTCGAGAAGAACACTGCACAAGAAGACATAAAGAAATCCTACAGAAAACTTGCTCTGAAATTCCACCCGGACAAGAATCCCAACAATCCAGAAGCTGCTGATAAATTTAAAGAAATCAACAACGCTCATGCTATTCTGTCAGACCCCACCAAACGCAATATTTATGACAAATACGGCTCTCTGGGCCTCTACGTGGCAGAACAATTCGGAGAGGAGAATGTTAACACATACTTTGTATTGTCCAGCTGGTGGGCCAAGGCGCTGTTTATATTCTGCGGTGTGGCCACGGGCTGTTATTTCTGCTGCTGTCTGTGCTGCTGTTGTAATTGCTGCTGTGGGAAGTGTAAACCTCATCCTCCTCACTCAGATGATCCTGATTTCTACGTGTCTCCTGAAGACTTGGAAGCTCAGATGCAGTCTGATGAGAGAGACGGCAGCAGCCCTATCATGATGCAGCCGTCCTCTGCCACAGAAAGCACTCAGCTGACCGCAGACTCTCACCACACCAGCTACCGGACAGACGCCAACTATTAA

Function

symbol description
dnajc5ab Human ortholog(s) of this gene implicated in neuronal ceroid lipofuscinosis 4B. Orthologous to human DNAJC5 (DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5).

GO:

id name namespace
GO:0005575 cellular_component cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-081021-2 Human ortholog(s) of this gene implicated in neuronal ceroid lipofuscinosis 4B. Orthologous to human DNAJC5 (DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000004836

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00043916 False 5387 mRNA 0.36 4 17472702 17484555
TCONS_00043917 True 823 mRNA 0.49 5 17477400 17509656

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_022244 trim101 coding downstream 2556 17454691 ~ 17470146 (-)
XLOC_022243 tpd52l2b coding downstream 21438 17431345 ~ 17451264 (-)
XLOC_022242 ppdpfb coding downstream 42927 17427838 ~ 17429775 (-)
XLOC_022241 BX649300.1 coding downstream 117000 17354153 ~ 17355702 (-)
XLOC_022240 BX927275.3 coding downstream 296484 17176104 ~ 17176218 (-)
XLOC_022246 bhlhe23 coding upstream 146134 17655790 ~ 17657348 (-)
XLOC_022247 NA coding upstream 148338 17657994 ~ 17839198 (-)
XLOC_022248 CU570795.1 coding upstream 173162 17682818 ~ 17682932 (-)
XLOC_022249 CR381647.5 coding upstream 273316 17782972 ~ 17820755 (-)
XLOC_022250 tfip11 coding upstream 337384 17847040 ~ 17866100 (-)
XLOC_022239 CR318674.1 non-coding downstream 426318 17044294 ~ 17046384 (-)
XLOC_022237 NA non-coding downstream 467919 16961269 ~ 17004783 (-)
XLOC_022235 NA non-coding downstream 619755 16850836 ~ 16852947 (-)
XLOC_022251 NA non-coding upstream 371367 17881023 ~ 17885851 (-)
XLOC_022255 dre-mir-135c-2 non-coding upstream 553517 18063173 ~ 18063299 (-)
XLOC_022256 NA non-coding upstream 564059 18073715 ~ 18074419 (-)

Expression


Co-expression Network