G293991


Basic Information

Item Value
gene id G293991
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 72115497 ~ 72118615 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU333427
tgcTGGGAAaatgatcagaattgggctggTGTTTTGATGTTTTTGTCATTACAAAAGGCTGTTCTAAATACAGTGTAGCTGGGACAAAAAAAATTCAGACTGCTGCTAATGGGGAGAGTTTTCACTGTTTGTGTTACTGTGTCAAATCATTGGATGGGAGGTCAAATCATGTCACATTATTATGATTCTGATTCTGATTATTGTTATCTTATCAATTTGATTGAAAATACACATTATTTTTGTTGATTTTTCTTTTGCTAGTGTTTGATCCAGGGGAGAAGACTTTATTTCAACTCTTATGTATTTATCATTTTGCTTTTGGTTTTTGTAACAACCCAAATGAAAAGGTATTTCCACAGAATAAACCCTCTGAAGACGTTAAGATGATAGTGACTCCCACTTTCTGCTACTGTAAGTGACCTGATTTTCATGAGTAGACTAGTCACCCAcagagattatatttctatgtagtcacccacagagattatatttctatgtagtcacccacagaggttatatttctatgtagtcacccacagagattatatttctatgtagtcacccacagagattatatttctatgtagtCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCAcagagattatatttctatgtagtcacccacagagattatatttatatgtagtCACTCAcagagattatatttctatgtagtcacccacagagattatatttctatgtagtCACCCACAGAGATTATGTTTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATATTTGTATGTAGTCACCCAcagagattatatttctatgtagtcacccacagagattatatttctatgtagtCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCAcagagattatatttctatgtagtcacccacagagattatatttctatgtagtcacccacagagattatatttctatgtagtcacccacagagattatatttctatgtagtcacccacagagattatatttatatgtagtcacccacagagattatatttatatgtagtCACTCAcagagattatatttctatgtagtcacccacagagattatatttctatgtagtCACTCAcagagattatatttctatgtagtcacccacagagattatatttctatgtagtTACCCACAGAGATTATATTTCTATCTAGTCACCCACAGAGATTATATTTCTATCTAGTCACCCACAGAGATTATATTTCTATCTAGTCACCCAcagagattatatttctatgtagtcacccacagaggttatatttctatgtagtcacccacagagattatatttctatgtagtcacccacagagattatatttctatgtagtCACCCACAGAGGTTATATTTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACTCAcagagattatatttctatgtagtCACCCACAGAGGTTATATTTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCATAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAgagattatatttatatgtagtCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATGATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAgagattatatttatatgtagtCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCAcagagattatatttctatgtagtCACCCACAGAGATTCAAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAgagattatatttatatgtagtCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCACAGAGATTATAATTCTATGTAGTCACCCATCACTCGTCTCATAAAATATTTTGtgttacatttttgttttcaagATCACAGTGAGAGAGTAAGTGACCAAATACTTGATTAGTCAATGAATATTGAAAATGAATATATTATTAGTCAATgaataatgtctctgtctctcattggTTAAACACACCAGCCCTGTGACTGTCGCTGACCAGAATGTCCACTTCTTTTATAAACACTTTATCAGCACAGCTCCAAGTGCTCTCACCATACTGCTCCTGAACTTGTGATACTCTCACAAATTAATTGTAACGTCAACTACTATACTGTGCTCTCTAAAGGTAAACAGTATGCTGTATCACATAGAAACCTACAGTACTGTTTGTATTCATGAGCCGTTTTCAAGGTTGTTTTTCTACAAAGATTTTAAAATATGTTCATCTGTTGACATTTTGCCTGCCTATCTGTAGCGAATGAGGGAAAagctctgtgatgtcattctgctTGTAATAAAGAAATTATAAAACTCA

Function

NR:

description
mucin-2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU333427 True 2771 lncRNA 0.34 2 72115497 72118615

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110520523 LOC106582019 coding downstream 984 72010695 ~ 72114513 (-)
LOC110520527 LOC106586729 coding downstream 109708 71997354 ~ 72005789 (-)
LOC110520524 NA coding downstream 118613 71986320 ~ 71996884 (-)
LOC110505427 LOC106586716 coding downstream 136183 71977813 ~ 71979314 (-)
trim13 LOC106586719 coding downstream 178464 71932421 ~ 71937033 (-)
LOC110504660 LOC106582021 coding upstream 3359 72121974 ~ 72206818 (-)
LOC110520529 LOC106586732 coding upstream 145763 72264378 ~ 72266650 (-)
LOC110520531 LOC106582025 coding upstream 372233 72490848 ~ 72542128 (-)
LOC110504707 NA coding upstream 658101 72776716 ~ 72782874 (-)
LOC110504714 LOC106586779 coding upstream 672689 72791304 ~ 72838453 (-)
G294045 NA non-coding downstream 96875 72017075 ~ 72018622 (-)
G294042 NA non-coding downstream 135391 71979801 ~ 71980106 (-)
G294015 NA non-coding downstream 170054 71945190 ~ 71945443 (-)
G293990 NA non-coding downstream 170965 71926065 ~ 71944532 (-)
G294012 NA non-coding downstream 190207 71925077 ~ 71925290 (-)
G294093 NA non-coding upstream 40360 72158975 ~ 72159261 (-)
G294095 NA non-coding upstream 45696 72164311 ~ 72165605 (-)
G294096 NA non-coding upstream 47491 72166106 ~ 72166337 (-)
G294097 NA non-coding upstream 51087 72169702 ~ 72170033 (-)
G294099 NA non-coding upstream 53464 72172079 ~ 72172482 (-)
G293984 NA other downstream 211589 71903314 ~ 71903908 (-)
G292919 NA other downstream 1075345 71027619 ~ 71040152 (-)
G292753 NA other downstream 1394906 70720036 ~ 70720591 (-)
G291977 NA other downstream 2007547 70107540 ~ 70107950 (-)
G291901 LOC106586687 other downstream 2118892 69980346 ~ 69996605 (-)
G294451 NA other upstream 452634 72571249 ~ 72575432 (-)
G294697 NA other upstream 656792 72775407 ~ 72776607 (-)
LOC110520539 mfsd9 other upstream 757724 72870852 ~ 72881264 (-)
G296011 NA other upstream 1453677 73572292 ~ 73572911 (-)

Expression


Co-expression Network