G304008


Basic Information

Item Value
gene id G304008
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 82520977 ~ 82521878 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU345091
gatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatgatgatgatggtacttTACCTTacactaggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatgatggtacttTACCTTacactaggtgatgatgatgatggtacttTACCTTacactaggtgatgatgatgatggtacttTACCTTACActaggtgatgatgatgatgatgatgatggtacttTACCTTACACCAGGTGATGATGAATATTCCTGTAATTGTGCATCACTGTCCTTAGGACGAGGTAGTCGTACCTCTACTGGTGTTGTGTGTACAGTCTAACCGGCCCAGGCATTATGCCAGTTAACAGGCTCCTTATGTCTCCTTATGCTGATCATCTGGTACAACAGACAATCTGCCTCCAGGATGTTGATCTGTTCATAGGCTAAACATCTGTTGGAATCTGGCtgtatcaaaaataaaataaagtttcATGTTCTAGTGTGATTGTCTCATTTACGTTAGCAACTTCATCG
>TU345092
gatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatgatgatgatggtacttTACCTTacactaggtgatgatgatgatggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatgatggtacttTACCTTacactaggtgatgatgatgatgatgatggtacttTACCTTACACCAGGTGATGATGAATATTCCTGTAATTGTGCATCACTGTCCTTAGGACGAGGTAGTCGTACCTCTACTGGTGTTGTGTGTACAGTCTAACCGGCCCAGGCATTATGCCAGTTAACAGGCTCCTTATGTCTCCTTATGCTGATCATCTGGTACAACAGACAATCTGCCTCCAGGATGTTGATCTGTTCATAGGCTAAACATCTGTTGGAATCTGGCtgtatcaaaaataaaataaagtttcATGTTCTAGTGTGATTGTCTCATTTACGTTAGCAACTTCATCG
>TU345089
gatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatgatgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatgatggtacttTACCTTacactaggtgatgatgatgatggtacttTACCTTacactaggtgatgatgatgatggtacttTACCTTACActaggtggtgatgatgatgatgatgatgatggtacttTACCTTACActaagtgatgatgatgatgatgatggtacttTACCTTACActaagtgatgatgatg
>TU345090
gatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatggtactTTACCTTacactaggtgatgatgatgatgatggtacttTACCTTacactaggtgatgatgatgatggtacttTACCTTacactaggtgatgatgatgatggtacttTACCTTACActaggtggtgatgatgatgatgatgatgatggtacttTACCTTACActaagtgatgatgatgatgatgatggtacttTACCTTACActaagtgatgatgatg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU345091 False 615 lncRNA 0.40 3 82520977 82521878
TU345092 False 559 lncRNA 0.40 3 82520977 82521878
TU345089 False 362 lncRNA 0.38 2 82521300 82521878
TU345090 True 322 lncRNA 0.38 3 82521300 82521878

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110520662 des coding downstream 377896 82105898 ~ 82143081 (-)
LOC110510426 bin1 coding downstream 480278 81994051 ~ 82040699 (-)
LOC118964333 NA coding downstream 497254 82023279 ~ 82023723 (-)
LOC118964332 NA coding downstream 497797 82022835 ~ 82023180 (-)
slc23a3 LOC106586913 coding downstream 541455 81967130 ~ 81979522 (-)
LOC110505453 LOC106586926 coding upstream 222976 82744854 ~ 82747738 (-)
LOC110504940 LOC106586933 coding upstream 383608 82905486 ~ 83193706 (-)
ttll4 ttll4 coding upstream 961575 83483453 ~ 83539355 (-)
abcb6b LOC106586936 coding upstream 1025044 83546922 ~ 83612879 (-)
LOC110520669 LOC106586940 coding upstream 1104691 83626569 ~ 83629281 (-)
G304000 NA non-coding downstream 21710 82498327 ~ 82499267 (-)
G303995 NA non-coding downstream 28436 82478513 ~ 82492541 (-)
G303998 NA non-coding downstream 30000 82483557 ~ 82490977 (-)
G303990 NA non-coding downstream 58210 82462353 ~ 82462767 (-)
G303975 NA non-coding downstream 114378 82405441 ~ 82406599 (-)
G304010 NA non-coding upstream 1378 82523256 ~ 82523661 (-)
G304038 NA non-coding upstream 72734 82594612 ~ 82595707 (-)
G304044 NA non-coding upstream 101100 82622978 ~ 82627649 (-)
G304068 NA non-coding upstream 149617 82671495 ~ 82671743 (-)
G304072 NA non-coding upstream 153171 82675049 ~ 82675377 (-)
pard3bb LOC106601765 other downstream 206896 82297732 ~ 82586082 (-)
G303665 NA other downstream 497526 82022829 ~ 82023451 (-)
G303663 NA other downstream 498712 82021388 ~ 82022265 (-)
G302725 NA other downstream 1798354 80721738 ~ 80722623 (-)
G302724 NA other downstream 1799296 80720717 ~ 80721681 (-)
G304204 LOC107714908 other upstream 309492 82831370 ~ 82851751 (-)
G304264 NA other upstream 428191 82950069 ~ 82951356 (-)
abi2a LOC106574254 other upstream 1433866 83915872 ~ 83986617 (-)
LOC110504983 LOC106586944 other upstream 1558143 84072966 ~ 84220262 (-)

Expression


Co-expression Network