G305565


Basic Information

Item Value
gene id G305565
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 84806936 ~ 84816172 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU347074
gtctctatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtttctatgtctctaatatattatgacagtccagctagatctactgtttctgatatattatgacagtccagctagatcgactgtctctgatatattatgacagagcagctagatctactgtttctattatattatgacagaccagctagatctactgttgctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctaatataatatgacagactagctagacttactgtctctatgtctctattatattatgacagaccagctagatgtactgtttctatgtctctaatatattatgacagtccagctagatctactgtctctgatatattatgacagagcagctagatctactgtctttattatattatgacagagcagctaaatctattgtctttaatatattatgacagaccagctagatctactgtctttatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccaggtagatctactgtctctattatattattgaagaccagctagatctactttctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattgtgacaaaccagctagatctactgtgtctattatattgtgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatgacagaccagctagatctactgtctcttatgtattatgaaagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagtccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagacctgctgtccctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattgtgacaaaccagctagatctactgtgtctattatattgtgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatgacagaccagctagatctactgtctcttatgtattatgaaagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagtccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagacctgctgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtttctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctaatataatatgacagaccagctagacttactgtctctatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctttattatattatgacagaccagatagatctactgtttctatgtctctgatATATTATG

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU347074 True 1471 lncRNA 0.35 2 84806936 84816172

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110516739 LOC100708085 coding downstream 182667 84312715 ~ 84624269 (-)
LOC110520676 LOC106562996 coding downstream 498496 84305303 ~ 84308440 (-)
si:dkey-230p4.1 LOC106591428 coding downstream 505579 84232727 ~ 84301357 (-)
LOC110504983 LOC106586944 coding downstream 586674 84072966 ~ 84220262 (-)
abi2a LOC106574254 coding downstream 820319 83915872 ~ 83986617 (-)
xrcc5 LOC106586961 coding upstream 20703 84836875 ~ 84868307 (-)
LOC118964339 NA coding upstream 88166 84904338 ~ 84907876 (-)
LOC110520668 LOC106586955 coding upstream 96380 84912552 ~ 85062818 (-)
G305589 NA non-coding downstream 32063 84770769 ~ 84774873 (-)
G305570 NA non-coding downstream 75847 84729605 ~ 84731089 (-)
G305534 NA non-coding downstream 100994 84676464 ~ 84705942 (-)
G305552 NA non-coding downstream 103977 84702426 ~ 84702959 (-)
G305431 NA non-coding downstream 202039 84604681 ~ 84604897 (-)
G305593 NA non-coding upstream 11167 84827339 ~ 84827604 (-)
G305716 NA non-coding upstream 18250 84834422 ~ 84835104 (-)
G305734 NA non-coding upstream 31992 84848164 ~ 84848685 (-)
G305736 NA non-coding upstream 37870 84854042 ~ 84854459 (-)
G305744 NA non-coding upstream 60533 84876705 ~ 84877033 (-)
G305585 NA other downstream 48161 84757942 ~ 84758775 (-)

Expression


Co-expression Network