LOC110522366 (cd164)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110522366
gene name cd164
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048568.1
NCBI id CM023222.3
chromosome length 46841314
location 26651503 ~ 26667757 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021600709.2
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Function

symbol description
cd164 Acts upstream of or within renal system process. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in cytoplasmic vesicle. Is expressed in several structures, including digestive system; epidermis; notochord; pronephros; and yolk syncytial layer. Human ortholog(s) of this gene implicated in autosomal dominant nonsyndromic deafness 66. Orthologous to human CD164 (CD164 molecule).

NR:

description
sialomucin core protein 24-like isoform X2

GO: NA

KEGG:

id description
K06546 CD164, MGC24; CD164 antigen

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ppil6 ppil6 coding upstream 9285 26624912 ~ 26642218 (+)
ak9 ak9 coding upstream 26834 26603396 ~ 26624669 (+)
LOC110522372 wasf1 coding upstream 185827 26327551 ~ 26465676 (+)
LOC110522374 mettl24 coding upstream 370939 26216401 ~ 26280564 (+)
LOC110522377 LOC106607986 coding upstream 473686 26059992 ~ 26177817 (+)
sesn1 sesn1 coding downstream 18385 26686142 ~ 26756544 (+)
snx3 snx3 coding downstream 268078 26935835 ~ 26961848 (+)
LOC110522356 ostm1 coding downstream 330735 26998492 ~ 27004619 (+)
LOC110522355 plekhg1 coding downstream 386871 27054628 ~ 27185449 (+)
tcp1 tcp1 coding downstream 518708 27186465 ~ 27195351 (+)
G336295 NA non-coding upstream 20040 26596692 ~ 26631463 (+)
G336244 NA non-coding upstream 136956 26513951 ~ 26514547 (+)
G336234 NA non-coding upstream 147942 26503297 ~ 26503561 (+)
G336221 NA non-coding upstream 161349 26489708 ~ 26490154 (+)
G336154 NA non-coding upstream 220199 26339937 ~ 26431304 (+)
G336382 NA non-coding downstream 69766 26737523 ~ 26739412 (+)
G336399 NA non-coding downstream 99661 26767418 ~ 26767994 (+)
G336429 NA non-coding downstream 160557 26828314 ~ 26828550 (+)
G336455 NA non-coding downstream 208016 26875773 ~ 26876169 (+)
G336461 NA non-coding downstream 215605 26883362 ~ 26883618 (+)
LOC110522376 sash1 other upstream 593812 25761890 ~ 26057813 (+)
G334473 armt1 other upstream 2228772 24420114 ~ 24422731 (+)
G334475 NA other upstream 2232557 24417582 ~ 24418946 (+)
si:ch211-51e12.7 NA other upstream 2581827 24063831 ~ 24072963 (+)
G334116 NA other upstream 2817081 23833821 ~ 23837875 (+)
G336464 NA other downstream 225378 26892229 ~ 26894837 (+)
LOC118964415 LOC106608050 other downstream 923095 27537262 ~ 27601564 (+)
G339660 NA other downstream 2190959 28858716 ~ 28859155 (+)
G339693 NA other downstream 2246842 28914599 ~ 28915539 (+)

Expression


Co-expression Network