LOC110522568 (LOC106571107)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110522568
gene name LOC106571107
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048568.1
NCBI id CM023222.3
chromosome length 46841314
location 37284261 ~ 37402023 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_021601026.2
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>XM_021601025.2
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Function


NR:

description
coiled-coil domain-containing protein 85C-A-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021601025.2 True 8248 mRNA 0.44 6 37284262 37402023

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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G348293 NA non-coding downstream 113808 37515831 ~ 37516214 (+)
G348133 NA other upstream 123138 37160094 ~ 37161123 (+)
LOC110522562 LOC105017690 other upstream 1211305 36039096 ~ 36123362 (+)
G347178 NA other upstream 1375810 35908246 ~ 35908451 (+)
G347151 NA other upstream 1450417 35833369 ~ 35833844 (+)
G346334 NA other upstream 2209923 35073939 ~ 35074338 (+)
G349855 NA other downstream 1002622 38404645 ~ 38405464 (+)
G349877 NA other downstream 1030156 38432179 ~ 38434024 (+)
LOC110522591 LOC105024333 other downstream 1488360 38890314 ~ 38897681 (+)
G350211 NA other downstream 1501707 38903730 ~ 38904774 (+)

Expression



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