G349173


Basic Information

Item Value
gene id G349173
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048568.1
NCBI id CM023222.3
chromosome length 46841314
location 37673532 ~ 37674468 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU395071
ttatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgtattatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgcattatgttgaatagtgttgtgttgctatgcgttgtattatgttgaatagtgttgtgatgtgttgctatgcattgcgttatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgcattatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgcattatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgcattatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgcattatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgcattatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgtattatgttgaatagtgttgtgatgtgttgctatgcattgcgttatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgtgTTATGTTGAatggtgttgtgttgctatgcattatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgtattatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgcattatgttgaatggtgttgtgttgctatgcattatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgtattatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgcattatgttgaatagtgttgtgttgctatgcattgcattatgttgaatagtgttgtgttgctatgcgctgcgttatgttgaatagtgttgtgttgtgtagctatgcattgcattatgttgaatagtgttgatTTTGCTGCACTGTCAAGTGTCAGTGTGCAGCGGTGAGGACGAAGTAAAATAACGTACTTTACTCGAAAAGAAACAACCATAAATTCCACGCAGGGAAAACACACCATGACACAGCAGTCTTACACTCAACAAggaaacaaacacgcacaaaacataatgagaaccagagggttaaat

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106603989

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU395071 True 937 lncRNA 0.36 1 37673532 37674468

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110522574 LOC106608248 coding upstream 149464 37522809 ~ 37524068 (+)
LOC110522576 LOC106608246 coding upstream 171580 37445368 ~ 37501952 (+)
LOC110522568 LOC106571107 coding upstream 271509 37284261 ~ 37402023 (+)
LOC110522567 LOC106608238 coding upstream 390050 37271173 ~ 37283482 (+)
LOC110517371 LOC106571681 coding upstream 447259 37188010 ~ 37226273 (+)
LOC118964471 NA coding downstream 173511 37847979 ~ 37855029 (+)
actc1a LOC105024319 coding downstream 196284 37870752 ~ 37878518 (+)
LOC110521098 LOC106608260 coding downstream 204934 37879402 ~ 37897524 (+)
LOC110522584 LOC106608258 coding downstream 223168 37897636 ~ 37899208 (+)
LOC110521100 LOC106608253 coding downstream 295254 37969722 ~ 38234678 (+)
G348335 NA non-coding upstream 22106 37605933 ~ 37651426 (+)
G348323 NA non-coding upstream 80165 37585429 ~ 37593367 (+)
G348320 NA non-coding upstream 102306 37570841 ~ 37571226 (+)
G348308 NA non-coding upstream 127180 37546146 ~ 37546352 (+)
G348302 NA non-coding upstream 142077 37531162 ~ 37531455 (+)
G349185 NA non-coding downstream 22044 37696512 ~ 37696744 (+)
G349215 NA non-coding downstream 49915 37724383 ~ 37724644 (+)
G349263 NA non-coding downstream 89375 37763843 ~ 37764295 (+)
G349275 NA non-coding downstream 101030 37775498 ~ 37821435 (+)
G349286 NA non-coding downstream 117589 37792057 ~ 37793575 (+)
G348133 NA other upstream 512409 37160094 ~ 37161123 (+)
LOC110522562 LOC105017690 other upstream 1600576 36039096 ~ 36123362 (+)
G347178 NA other upstream 1765081 35908246 ~ 35908451 (+)
G347151 NA other upstream 1839688 35833369 ~ 35833844 (+)
G349855 NA other downstream 730177 38404645 ~ 38405464 (+)
G349877 NA other downstream 757711 38432179 ~ 38434024 (+)
LOC110522591 LOC105024333 other downstream 1215915 38890314 ~ 38897681 (+)
G350211 NA other downstream 1229262 38903730 ~ 38904774 (+)
G350665 NA other downstream 1713673 39388141 ~ 39389474 (+)

Expression


Co-expression Network