G353383


Basic Information

Item Value
gene id G353383
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048568.1
NCBI id CM023222.3
chromosome length 46841314
location 42585668 ~ 42653695 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU400250
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>TU400243
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>TU400246
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>TU400241
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>TU400242
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>TU400244
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>TU400247
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU400250 False 1329 lncRNA 0.41 3 42585668 42653695
TU400243 False 1304 lncRNA 0.40 2 42650772 42652162
TU400246 False 1275 lncRNA 0.40 2 42650772 42652162
TU400241 False 1832 lncRNA 0.39 3 42651712 42653695
TU400242 False 1706 lncRNA 0.39 2 42651712 42653695
TU400244 False 1874 lncRNA 0.39 2 42651712 42653695
TU400247 True 1808 lncRNA 0.39 4 42651712 42653695

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:ch211-278j3.3 LOC106608328 coding upstream 71207 42460358 ~ 42514461 (+)
LOC110522651 LOC106608319 coding upstream 152539 42370820 ~ 42433129 (+)
eif2b4 LOC106608321 coding upstream 221314 42329742 ~ 42364354 (+)
LOC118964483 NA coding upstream 258687 42319401 ~ 42328637 (+)
LOC110522644 ptk2b coding upstream 651088 41884265 ~ 41934580 (+)
sh3bgrl2 LOC106608335 coding downstream 600197 43253892 ~ 43279017 (+)
rps12 rps12 coding downstream 632957 43286652 ~ 43291268 (+)
LOC118964509 NA coding downstream 633487 43287182 ~ 43287259 (+)
tbpl1 tbpl1 coding downstream 1050324 43704019 ~ 43722541 (+)
slc2a12 slc2a12 coding downstream 1086568 43740263 ~ 43768983 (+)
G353375 NA non-coding upstream 13546 42571675 ~ 42572122 (+)
G353355 NA non-coding upstream 64351 42521118 ~ 42521317 (+)
G353308 NA non-coding upstream 81554 42502757 ~ 42504114 (+)
G353303 NA non-coding upstream 90475 42494550 ~ 42495193 (+)
G353348 NA non-coding upstream 98932 42486496 ~ 42486736 (+)
G353412 NA non-coding downstream 24449 42678144 ~ 42681176 (+)
G353438 NA non-coding downstream 86412 42740107 ~ 42740453 (+)
G353441 NA non-coding downstream 94765 42748460 ~ 42749514 (+)
G353752 LOC106608341 non-coding downstream 142920 42796615 ~ 42823273 (+)
G353780 NA non-coding downstream 192716 42846411 ~ 42848874 (+)
G353339 NA other upstream 134259 42451032 ~ 42451409 (+)
G353328 LOC106608329 other upstream 142287 42442755 ~ 42443381 (+)
G353125 NA other upstream 459909 42124676 ~ 42125759 (+)
G352477 NA other upstream 1219061 41366201 ~ 41366607 (+)
G353820 NA other downstream 257191 42910886 ~ 42912213 (+)
G354462 NA other downstream 957267 43610962 ~ 43611562 (+)
G354630 NA other downstream 1336428 43990123 ~ 43990639 (+)
myb myb other downstream 1455384 44084616 ~ 44110268 (+)

Expression


Co-expression Network