LOC110523100


Basic Information

Item Value
gene id LOC110523100
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 936345 ~ 939419 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>TU406314
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU406314 True 426 lncRNA 0.38 2 936443 936972

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110523076 LOC106572700 coding downstream 19224 911435 ~ 917121 (-)
LOC110523091 fsd1l coding downstream 25899 821355 ~ 910446 (-)
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LOC110523080 LOC106572757 coding downstream 219926 703311 ~ 716419 (-)
LOC110523113 mob3b coding upstream 780 940199 ~ 1004906 (-)
LOC110523114 thap1 coding upstream 73326 1012745 ~ 1015374 (-)
LOC110523115 LOC106572830 coding upstream 97440 1036859 ~ 1051078 (-)
LOC118964538 NA coding upstream 151488 1090907 ~ 1127618 (-)
LOC110523084 rnf170 coding upstream 275413 1214832 ~ 1221694 (-)
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G357851 NA non-coding downstream 74477 858945 ~ 861868 (-)
G357850 NA non-coding downstream 80886 855041 ~ 855459 (-)
G357847 NA non-coding downstream 90943 844918 ~ 845402 (-)
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G357886 NA non-coding upstream 35022 974441 ~ 975951 (-)
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G357912 NA non-coding upstream 80142 1019561 ~ 1022726 (-)
G357797 NA other downstream 117598 817154 ~ 818747 (-)
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G358126 NA other upstream 356109 1295528 ~ 1298651 (-)
G358446 NA other upstream 905405 1834553 ~ 1893316 (-)
G359712 NA other upstream 2135126 3074545 ~ 3080338 (-)
G359752 NA other upstream 2253094 3192513 ~ 3193105 (-)
G359989 NA other upstream 2685929 3625348 ~ 3625776 (-)

Expression

LOC110523100 Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 8.
End of interactive chart.

LOC110523100 Expression in each Bioproject

Bar chart with 21 bars.
LOC110523100 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 300.
End of interactive chart.

Co-expression Network