zmiz2 (zmiz2)


Basic Information

Item Value
gene id zmiz2
gene name zmiz2
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 16480148 ~ 16516827 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021601927.2
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Function

symbol description
zmiz2 Predicted to enable nuclear receptor coactivator activity. Acts upstream of or within dorsal/ventral pattern formation and mesoderm development. Orthologous to human ZMIZ2 (zinc finger MIZ-type containing 2).

NR:

description
zinc finger MIZ domain-containing protein 2-like isoform X4

GO:

id name namespace
GO:0008270 zinc ion binding molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021601927.2 False 5749 mRNA 0.49 21 16480148 16516474
XM_021601926.2 False 5965 mRNA 0.49 20 16480148 16516738
XM_021601928.2 False 5962 mRNA 0.49 20 16480148 16516738
XM_021601929.2 False 5962 mRNA 0.49 20 16480148 16516738
XM_021601931.2 False 5944 mRNA 0.49 20 16480148 16516738
XM_021601932.2 False 6035 mRNA 0.49 21 16480148 16516738
XM_021601934.2 False 5926 mRNA 0.49 20 16480148 16516738
XM_021601935.2 False 6002 mRNA 0.49 21 16480148 16516738
XM_021601930.2 True 6036 mRNA 0.49 20 16480148 16516827

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ppiab ppia1 coding downstream 570 16474090 ~ 16479578 (-)
LOC118964763 NA coding downstream 3388 16476679 ~ 16476760 (-)
LOC118964765 NA coding downstream 4292 16475777 ~ 16475856 (-)
LOC118964764 NA coding downstream 4870 16475197 ~ 16475278 (-)
LOC110522841 LOC106569125 coding downstream 49368 16427503 ~ 16430780 (-)
ogdhb ogdh coding upstream 42583 16559410 ~ 16602933 (-)
LOC110523332 LOC106569240 coding upstream 97798 16614625 ~ 16678865 (-)
nudcd3 LOC106569287 coding upstream 164057 16680884 ~ 16690718 (-)
gnsb gns coding upstream 175743 16692570 ~ 16711872 (-)
LOC110523337 LOC105007341 coding upstream 218813 16735640 ~ 16738410 (-)
G372816 NA non-coding downstream 42848 16436012 ~ 16437300 (-)
G372773 NA non-coding downstream 115298 16364644 ~ 16364850 (-)
G372772 NA non-coding downstream 116054 16363875 ~ 16364094 (-)
G372761 NA non-coding downstream 136999 16342844 ~ 16343149 (-)
G372760 NA non-coding downstream 138444 16341502 ~ 16341704 (-)
G372876 NA non-coding upstream 62252 16579079 ~ 16579741 (-)
G372892 NA non-coding upstream 107268 16624095 ~ 16624702 (-)
G372901 NA non-coding upstream 128402 16645229 ~ 16646216 (-)
G372909 NA non-coding upstream 146818 16663645 ~ 16664178 (-)
G372929 NA non-coding upstream 180520 16697347 ~ 16700089 (-)
G372123 NA other downstream 498933 15978502 ~ 15981215 (-)
G372122 NA other downstream 504032 15975606 ~ 15976116 (-)
LOC110523302 NA other downstream 781819 15693396 ~ 15707607 (-)
G371294 LOC106569911 other downstream 1355359 15123475 ~ 15124789 (-)
LOC110524957 LOC106569957 other downstream 1484989 14988147 ~ 14995197 (-)
LOC110523341 LOC106569324 other upstream 417408 16909582 ~ 16942359 (-)
G373228 LOC106569424 other upstream 607210 17124037 ~ 17125807 (-)
LOC110523354 LOC106569496 other upstream 972199 17483696 ~ 17521507 (-)
G374189 NA other upstream 1485993 18002820 ~ 18003170 (-)
G374786 NA other upstream 2041313 18558140 ~ 18559167 (-)

Expression


Co-expression Network