LOC110522832 (LOC106567816)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110522832
gene name LOC106567816
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 23623921 ~ 23678038 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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XM_036977085.1 False 4927 mRNA 0.44 16 23623923 23678038
XM_036977088.1 False 4915 mRNA 0.44 16 23623923 23678038
XM_036977089.1 False 4849 mRNA 0.44 15 23623923 23678038
XM_036977087.1 False 4499 mRNA 0.45 17 23623925 23678038
TU432291 False 2736 TUCP 0.45 6 23623964 23637091
TU432292 True 2230 TUCP 0.45 3 23634021 23637091

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110522830 f2rl2 coding upstream 149709 23470988 ~ 23474212 (+)
LOC110522829 LOC106567920 coding upstream 201037 23421643 ~ 23422884 (+)
LOC110523456 crhbp coding upstream 231940 23370966 ~ 23391981 (+)
wdr41 wdr41 coding upstream 372333 23237803 ~ 23251588 (+)
LOC110523452 otp coding upstream 409106 23208733 ~ 23214815 (+)
vatg1 LOC106567829 coding downstream 31805 23709843 ~ 23711877 (+)
LOC110523463 copt1 coding downstream 35042 23713080 ~ 23735468 (+)
LOC118964576 NA coding downstream 60666 23737834 ~ 23747312 (+)
LOC110523468 vamp5 coding downstream 160464 23838502 ~ 23844345 (+)
stard4 stard4 coding downstream 170180 23848218 ~ 23853553 (+)
G380279 NA non-coding upstream 5705 23617626 ~ 23618216 (+)
G380277 NA non-coding upstream 7668 23615857 ~ 23616253 (+)
G380258 NA non-coding upstream 19189 23604518 ~ 23604732 (+)
G379395 NA non-coding upstream 37833 23566477 ~ 23586088 (+)
G379392 NA non-coding upstream 56368 23560022 ~ 23567553 (+)
G380357 NA non-coding downstream 75183 23753221 ~ 23753477 (+)
G380363 NA non-coding downstream 83983 23762021 ~ 23762408 (+)
G380365 NA non-coding downstream 85265 23763303 ~ 23763523 (+)
G380336 NA non-coding downstream 85741 23763779 ~ 23765844 (+)
lhfpl2a lhfpl2 other upstream 616634 22942205 ~ 23007315 (+)
G378868 NA other upstream 994252 22602110 ~ 22629669 (+)
G378832 NA other upstream 1117651 22503752 ~ 22506270 (+)
G378660 NA other upstream 1392001 22172535 ~ 22231920 (+)
LOC110523400 LOC106568542 other upstream 2465002 21108129 ~ 21160149 (+)
G380340 NA other downstream 62396 23740434 ~ 23741459 (+)
G381239 NA other downstream 1009701 24687739 ~ 24776429 (+)
G382186 NA other downstream 1547404 25225442 ~ 25225730 (+)
LOC110523503 NA other downstream 2496907 26174884 ~ 26186710 (+)

Expression



Co-expression Network