si:ch211-222n4.2 (LOC106566406)


Basic Information

Item Value
gene id si:ch211-222n4.2
gene name LOC106566406
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 28008073 ~ 28016052 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021602300.2
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Function

NR:

description
coiled-coil domain-containing protein 74A-like isoform X3

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021602300.2 False 5323 mRNA 0.40 7 28008073 28016052
XM_021602301.2 False 5320 mRNA 0.40 7 28008073 28016052
XM_021602302.2 True 5311 mRNA 0.40 7 28008073 28016052

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110523528 nsma3 coding upstream 13650 27982645 ~ 27994423 (+)
LOC118964522 NA coding upstream 266984 27735878 ~ 27741089 (+)
LOC110522888 LOC106566402 coding upstream 288908 27675352 ~ 27719165 (+)
LOC110523527 LOC106567169 coding upstream 344039 27659144 ~ 27664034 (+)
LOC110523526 LOC106566370 coding upstream 350767 27585605 ~ 27657306 (+)
LOC110523531 LOC106566436 coding downstream 36569 28052621 ~ 28067973 (+)
LOC110523534 LOC106566461 coding downstream 93770 28109822 ~ 28112779 (+)
ftsj1 LOC106566467 coding downstream 211961 28228013 ~ 28235500 (+)
LOC110523538 NA coding downstream 223063 28239115 ~ 28241670 (+)
LOC110518653 LOC106566474 coding downstream 241915 28257967 ~ 28261576 (+)
G385531 NA non-coding upstream 21917 27985456 ~ 27986156 (+)
G385512 NA non-coding upstream 34290 27973567 ~ 27973783 (+)
G385510 NA non-coding upstream 34770 27972989 ~ 27973303 (+)
G385499 NA non-coding upstream 46858 27961016 ~ 27961215 (+)
G385498 NA non-coding upstream 47491 27960204 ~ 27960582 (+)
G385543 NA non-coding downstream 73619 28089671 ~ 28093373 (+)
G385590 NA non-coding downstream 87176 28103228 ~ 28103605 (+)
G385592 NA non-coding downstream 93113 28109165 ~ 28109383 (+)
G385555 NA non-coding downstream 96782 28112834 ~ 28113437 (+)
G385665 NA non-coding downstream 109742 28125794 ~ 28126313 (+)
G385171 LOC106566130 other upstream 103342 27904467 ~ 27904731 (+)
G385053 NA other upstream 300995 27706714 ~ 27707078 (+)
G383794 LOC106566282 other upstream 1344460 26661838 ~ 26663613 (+)
LOC110522865 LOC106567246 other upstream 1547377 26437517 ~ 26502284 (+)
G385805 NA other downstream 400553 28416605 ~ 28417555 (+)
spag8 LOC106566715 other downstream 910225 28926263 ~ 28931410 (+)
tbx5a LOC106566939 other downstream 1725748 29741800 ~ 29763439 (+)
G387516 NA other downstream 1880934 29896986 ~ 29898134 (+)
G388019 NA other downstream 2270899 30286951 ~ 30287824 (+)

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