LOC110523578 (LOC106566868)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110523578
gene name LOC106566868
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 29254638 ~ 29262641 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_021602390.2
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>XM_036977228.1
GCTCGCTAGCAACTCCAACTTTGCGTGACGTCAGTTTGACCACATCGTGTGTTTTCTTGAAATATTTACACAATGTTTATAGCTTGAAATACTTATACGATATTATCCGAAATCTTACCATCTACCAATTTAACTGCAGCGCAACATCTTTCAAGACTAGCTGATAAACTAGCCACAGCGAAGTATCTCGTTAGCCAACGTTAACGCTTTCAAACATTTGCAGACAATACGGCGACATATTTTGTTATACAGGAAAGGAATTCTGTTTTGGAGTGAACAATGAGCAATACCGGTGTGAGATGGGCTACTGCTGCGGGGAGACCGAGTGCTGCACTTACTACTATGAGCTGTGGTGGTTCTGGCTGGTGTGGACCCTCATCATAATGCTGAGTTGCTGCTGTGCCTACCGTCACCGTCGGGTCAAGATGCGgctgcagcaggagcagcgccaGCGCGAAATCAGCCTTATGGCCTATCAGGGAGCTTCTAGTTCTTtcatctcccctccacccctcaacTTGAGGTTCTGGACAGACTGCAAGCTTCCTGACTATGAAGAGGTGGTGGGTCATCCCCCGACTCCACCTCCGCCTTACTCCGAGATACCCCCAGAGACCACCCCTCCCATCCTACTGCCCCCCATCCAATCAGAAGCTGCTGTGGTGCTGGAGCCCCCAACAGAGGACACTCCAAGAGAGGAGCAGGCTGCTAGTTCCTCAGCAGACCAGGAATCCACATCTGCTCCCAGCAAATCAGAACGACCGGTGGAAGAGGAACTGGTGACCCGGCGCAGGCATGTGACTGGCGACTCGGGgatcgaggtgtgtgtgtgccaactGGATGAGAGCTCTGGGCCGGAAGAGGACGAGGAGCAGGTGTGTCAGGGGGCCAGGGGGGACTGCTGCTCTGCCTCGGAGCACCACCACATCAGACACAAAGAGAGAACCCCAGGGCCTCAGCCCAAGGGCCAGCACCGGAGACCGCCTGATCTGAGCTCCACCACCAACCACccagaggctgctgctgctgccggaTCTGCGCTTTAGGGAGGGAGTGCCCTTGTCATCATAACAATAACCCAGACACCACCAGCAAATGAAATGTCCCACAACGACTCACCAAATGAACCAGGTTGTCCTGCTCTTTGACATGCTTGTCAGTTATGATCCATAAAATGACGCCAATGATGACAAAAAAAGTTTTTTTCGAAGATGCTTAGTTTGGCTAACGGTTTAATTCTTTAATACCCATGGATGGTCCCTCGTCTGCTTTGTTTAGTTCTTGCAATGGTGATGATGAAAATGCCAACTTCTAGAGATCTACCAAGTGGCAAGAAGAGGTGCTGATGCTGGTACAGAATTGACTACATCTACCCACCCACTTGTCCCACCCAACTGTTTAGCCTGGACATTTTTCCTTTGGTCCTTCTAACATTTCACCTCTGTGGGGACAGGGCAGGATGGCATACCACCATGGCCACCAATCCCTAGGCCCCAGCACGTAGGGGCCAAAACATAAGATCATGCTACCAGACACAGTCCTGACCAGGGGATACAAACGGTTACGGATAGAACTTGTTTTTgcaggggtttgtgtgtgtgtactgtgtaatcTAGGACACAGCTGCAAAGTGATGTCACCCCTGAGGTAATCTTGGCCTGCATCTGGTTTCCTTGTGGAGTGACAGCAGGGCTATTTGCATCCAGAGAAAAGGCTGGGAAGTGAAGATGTGCCTGTCTCTTATAGCGTCTTTCTGAACTGTGTCCCAATAACATCAGACTCCACCCTTCCTACACCCATCCCTCATGTCTCCACCAGTACTCCGGTCAACACTTGGCCAGACTGAAAGGTATTGAATGGACTGGAACGGATGTTTTGATGTGTGATTATCTGGTCTGACTGGCCAAGTGAACTGAAGACGTGACAATATCCCATCGCTGTGCCTGCAACTTGGTATCTATAAAAAGCATTGTGGTGGTCGACCGTGTATGTGTTTTCACAGACCGGCGGTGAAATAACGTGGCGTGTGTGTGGTGGGGTCAGCAGCATTTTGCAGGACTGACAGTCTCACCGAGTGGTAAGGGGTATGTTGTTGGGAATAAAAGTACAAACCAGAGGGTGGGAAGACTGAAGTTTCAGCAGTGTAGTACTTTGTCCTGTATCATTTTCTTGTCTTTTTATTACTTCTCTAAAAACCTGCTTTAGCTGAGGCCACTATAACCCACATCAATGGCAAAGAATCTCTTATCCAAGGGATGCTGTGAGTGTGGAGTAGTGTAGTCTTATTTAGTGTATCCTCAGTGTCCTGGCCCCTGGTGTAAGTTAGTGCACTCAACTCACTAGGCTTTAGACCactttttttctttaaaaaaaaatgcactgGGTTTTTGTTTAGAGGGCATGAGTAATtaatttgtgtgtctgtgtaggtaGATGTGTGTTCTGATTCGTCCTGTCAGCAACAGTGTGTTTTCAGGCCCGTGTTTCATATAGTCTACTACTCCCAGGCCATTGGCCCCGAGCTGACAATGATGAATCGCTGCTGTTTTTACCCAGCAGCAGCGGGAGTCTGATAGTGTCACTCCCTTTCTGCCACGAGTCCCCTGGCCGTGTGGGACTCGGACAGAGTGAACCAAGGTTTAAGTATAGACACCATGTATCTAGTTTCATCATGTTATGACTTTGCACTGGGCCTGCAATGTGCTGTTGCATACGCCCTTGGCTTGCAGTGGTGTGAACATTGTAGAAGCAATGTGACAGATTTGTGTTGGTATTTTCCATTCAGTGGGATGGGGTTGGCTTTGCTGTTAGTGCAGCTGCACACTGTTATGATAAACCAGTGAAGTACGTTGCTTGCCCAGCATGTGTCGAAGCACAGCCGTAGAATCGGGAGTGTGTTTTTATTCTGCCGTTCCACCTAAAAATAAGCACAAAAGTCCAGCTGCCTTGGGTGTGTTTCAAATGGCAGTGAAGATATGATAGTTTTATTATTTAGGGTATTGATTTGCTTTCATGCAGCACTTATTGATCAAGTAGGTTATGGACTGATGCACTGTTTATTATTTCACTGCTAATGAAAAAGGACAGACCAAGACATTAATTTCAACTATCAATCAAtaagttgtctgtctgtcttcaagtGTTAAGTCTTGACACTATAAAAGTCAGAGGATAGTCATGCACTCACAAAGACTCACCCGCTCACATTAGGACACTAACATGTTTTTGATAAGACACCATAAGTTGCCTTGGTAGGTTGCTAGGGAACAGACATGAGGCTCAAGGTGCACCACAACAGAGGGGTATCCTACGAAGCAGGTTTGATGAGTTGGCGAGATACCATTGGTGAACCCTGAGTTCAACTCGGGATAACCAGTCATACGAAAGTGGCTCACATAGTATTCTAATTCCTGATTCTATGGTGGCTCAACTTTGagccaggtacatttctatggcaacgaATCCTTCAGCACTTACCTGCTCTGGGGTCGGCTAACTCCACTTATCATGAATGAAATGACTGGGCTGTGAGTTGAGGACTAtgaaatcagattccctcccACTTGCAAAGATTGTGTCATCACCCCCTTTATTTGAGGGAGATGACTGATTTTAAATATTATCCATGGTCGTAGTACAGAGGAAGCCTGTGCTgtaatgtgaagctaactgaagctggttagctttagaaaaccctgagtagatctagcttgctttGTAGGATACCCCTCAGAAGGCATATGAACACTCATTTTAAGTGCTCCTTCTGAGGCATAAGAAAATAAATGCCTTACTGTGGCACGGTGGTAAAATGTAGTTAGGGACAGGTAGACTAAATGTGTTTTGGCATCTGTGTTTGAAGAGTAGGCGATTATATTCCAGACTTGTGCTTTGGAAGAAACCTAAAATGTTTTAGCCCCCCTCTCCCATGTTTGAAGCATGGTGTGCATAGTTTCTTCTAGTAGTCCAGAGGAGTCCTTTTTTTATACAGATGGAGTCCGAAGTGTAAAATGATCTGTCTGATGTATCGATTGGCTCAACTTATTCTAGACTGTGGTTATGAGTTGCAGGAAATGTATCTGAGTGAAACCACAAGACGAGATCATATGTTGTAAAAGCTGGCATGTAGAATAGGTAACATTTGTTTAGTCAACGCTTGTGTATGACGTTTTAAAATGCCATCTGCTTCTCCCTGGTTATCTGTGGTTATTTGATCACTTTTTTTTCCTTCCCCTCACCCATTTTTCTTTAGTTatgattgtatttttatttcaagGATATGATCTAGATAAGTTTGATATTTGAACTGACCTGAAAGGATGTTGAATTACTACCAAACAAAATGATGTTAAGAAATCCTGTTTTAGTTTTTCTTGTGCTCATATGAGATGTTTTTTGAATGGTTGGGGGGGAATGACAAATGTAGATGCTAAAGTGCATTTATTTTTATGCAATATAGATAAATTAAGATTATGACGTTGAGGGTGTTTCATGTTTCTGAAAAAAGAAAATGGGAACCCATAGTTTCAGTCCCATTGCTCACTACTTACTGGGCAAACTCTTGTTTGGCTTTCACATGTTTACCTAGATAAAGGGCTATCAGTCAGTCATGGACAAACACCCATCCATTTCATTCATCTGCTCTGTAATTTTCCTCTTACCTACAGTTGCAGACACCGGCGATATGTGAACGTAATTCTTTGGACTTTTGTAGTACTCGTGTGAATAATGGGCGATTTGTATATTTTCAAGCATCTTTTGCCTTTTTGTTCCCTGTTCGCTTTTGTTTCAATGTTCACAGAGGCGCGTGAAGCTCTTATCCCTCGCTCGGTCTCTTCTTTCTCTCAAACCCCACCCAGTCCCCTATGGCCTCTCACCATATACCAGCACAGAGGGCACAAGCTAGGATCAGTGTCAAGTTGGGTATGTGGCCCCTGATGAGGTAACTAGCCCCAGGTGTGATAGTGATGGGGGCTTTAGCCATGGCTCATTGCATCCCT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Function


NR:

description
WW domain-binding protein 1-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036977228.1 True 6533 mRNA 0.44 4 29255030 29262641

Neighbor


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LOC110523574 LOC106566787 coding upstream 88128 29140833 ~ 29166510 (+)
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tbx5a LOC106566939 coding downstream 479222 29741800 ~ 29763439 (+)
LOC110523590 rab14 coding downstream 596968 29859609 ~ 29902923 (+)
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G385171 LOC106566130 other upstream 1349907 27904467 ~ 27904731 (+)
G385053 NA other upstream 1547560 27706714 ~ 27707078 (+)
LOC110522888 LOC106566402 other upstream 1571245 27675352 ~ 27719165 (+)
G387516 NA other downstream 634345 29896986 ~ 29898134 (+)
G388019 NA other downstream 1024310 30286951 ~ 30287824 (+)
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G390393 NA other downstream 2957540 32220181 ~ 32220533 (+)

Expression



Co-expression Network