LOC110524043


Basic Information

Item Value
gene id LOC110524043
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 54019945 ~ 54024504 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>XR_002473524.2
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_002473523.2 False 2380 mRNA 0.40 5 54019945 54024157
XR_002473521.2 False 2938 mRNA 0.41 4 54019945 54024159
XR_002473524.2 True 2003 mRNA 0.43 5 54019945 54024504

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118964527 NA coding upstream 1335 54016607 ~ 54018708 (+)
LOC110524041 LOC106613525 coding upstream 14739 53991256 ~ 54005206 (+)
LOC110524039 LOC106613527 coding upstream 43713 53973591 ~ 53976232 (+)
LOC110524040 LOC106613524 coding upstream 58122 53950830 ~ 53961823 (+)
LOC110524036 LOC106573996 coding upstream 79113 53929266 ~ 53940832 (+)
zgc:153738 LOC106613531 coding downstream 24535 54049039 ~ 54057375 (+)
obscna LOC106613530 coding downstream 58851 54083355 ~ 54168958 (+)
mutyh mutyh coding downstream 321977 54346481 ~ 54395448 (+)
LOC110524051 LOC106613536 coding downstream 349700 54374204 ~ 54378738 (+)
dio1 dio1 coding downstream 523009 54547513 ~ 54550162 (+)
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G415467 NA non-coding upstream 11847 54007887 ~ 54008098 (+)
G415144 NA non-coding upstream 70297 53948635 ~ 53949648 (+)
G415189 NA non-coding upstream 192726 53826979 ~ 53827219 (+)
G415543 NA non-coding downstream 53132 54077636 ~ 54077904 (+)
G415547 NA non-coding downstream 54965 54079469 ~ 54079672 (+)
G415550 NA non-coding downstream 57121 54081625 ~ 54081866 (+)
G415552 LOC106613532 non-coding downstream 144613 54169117 ~ 54175086 (+)
G415748 NA non-coding downstream 241559 54266063 ~ 54266343 (+)
G414488 LOC106562530 other upstream 907438 53112183 ~ 53112507 (+)
G414041 NA other upstream 1240466 52778517 ~ 52779479 (+)
G414007 NA other upstream 1258216 52761389 ~ 52761729 (+)
G412859 NA other upstream 2217125 51802250 ~ 51802820 (+)
camsap2a camsap2 other upstream 2881561 51059834 ~ 51153381 (+)
G415582 LOC106584099 other downstream 153425 54177929 ~ 54183430 (+)
G415808 NA other downstream 304691 54329195 ~ 54329780 (+)
G415809 NA other downstream 305576 54330080 ~ 54330480 (+)
G415946 NA other downstream 565570 54590074 ~ 54613142 (+)

Expression


Co-expression Network