LOC110524062 (LOC106613542)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110524062
gene name LOC106613542
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 54818613 ~ 54833842 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021603368.2
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>XM_021603369.2
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>XM_021603370.2
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021603368.2 False 2339 mRNA 0.46 5 54818613 54833842
XM_021603369.2 False 2336 mRNA 0.46 5 54818613 54833842
XM_021603370.2 True 2231 mRNA 0.46 4 54818613 54833842

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110524059 LOC106613985 coding upstream 102404 54702112 ~ 54716209 (+)
LOC118964715 NA coding upstream 181676 54623690 ~ 54636937 (+)
fpgt fpgt coding upstream 198276 54617524 ~ 54620337 (+)
LOC110524055 NA coding upstream 205470 54595497 ~ 54613143 (+)
LOC118964620 NA coding upstream 223281 54589958 ~ 54595332 (+)
LOC110524063 LOC106613544 coding downstream 34529 54868248 ~ 54876340 (+)
LOC110522972 LOC106613545 coding downstream 43021 54876863 ~ 54888523 (+)
LOC110524066 LOC106613547 coding downstream 92491 54926333 ~ 54935194 (+)
LOC110522873 LOC106613548 coding downstream 121405 54955247 ~ 54957290 (+)
LOC110524067 LOC106613550 coding downstream 198360 55032202 ~ 55041553 (+)
G416005 NA non-coding upstream 129731 54688582 ~ 54688882 (+)
G415946 NA non-coding upstream 205471 54590074 ~ 54613142 (+)
G415914 NA non-coding upstream 262277 54555076 ~ 54556336 (+)
G415887 NA non-coding upstream 305064 54503035 ~ 54513549 (+)
G415886 NA non-coding upstream 322224 54458230 ~ 54496389 (+)
G416362 NA non-coding downstream 1771 54835613 ~ 54837792 (+)
G416367 NA non-coding downstream 5520 54839362 ~ 54839580 (+)
G416377 NA non-coding downstream 25188 54859030 ~ 54859350 (+)
G416378 NA non-coding downstream 25599 54859441 ~ 54859821 (+)
G416382 NA non-coding downstream 26305 54860147 ~ 54860415 (+)
mutyh mutyh other upstream 467998 54346481 ~ 54395448 (+)
G415809 NA other upstream 488133 54330080 ~ 54330480 (+)
G415808 NA other upstream 488833 54329195 ~ 54329780 (+)
G415582 LOC106584099 other upstream 635183 54177929 ~ 54183430 (+)
G416857 NA other downstream 490803 55324645 ~ 55325271 (+)
G418077 LOC106613582 other downstream 1784048 56617890 ~ 56628617 (+)
G418119 LOC106613588 other downstream 1892343 56726185 ~ 56729821 (+)
G418251 rtca other downstream 2090082 56923924 ~ 56925176 (+)
LOC100135807 LOC106613594 other downstream 2109996 56943838 ~ 56958165 (+)

Expression


Co-expression Network