LOC110524162 (LOC106613646)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110524162
gene name LOC106613646
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 58726531 ~ 58735992 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

NR:

description
amyloid beta A4 precursor protein-binding family A member 3-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036977967.1 True 5167 mRNA 0.45 11 58726531 58735992

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110524157 LOC106613644 coding upstream 26639 58674258 ~ 58699892 (+)
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LOC110524166 LOC100194687 coding downstream 106457 58842449 ~ 58849428 (+)
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G420610 NA non-coding downstream 69087 58805079 ~ 58805298 (+)
G420621 NA non-coding downstream 95396 58831388 ~ 58831587 (+)
G420622 NA non-coding downstream 96399 58832391 ~ 58832640 (+)
G420117 LOC100846954 other upstream 309755 58411240 ~ 58418268 (+)
G419452 NA other upstream 826883 57884380 ~ 57899648 (+)
LOC110524119 LOC106613607 other upstream 1359194 57352343 ~ 57367627 (+)
LOC100135807 LOC106613594 other upstream 1768366 56943838 ~ 56958165 (+)
G418251 rtca other upstream 1801355 56923924 ~ 56925176 (+)
G420634 NA other downstream 206736 58942728 ~ 58944217 (+)
LOC110524226 LOC106573564 other downstream 1958265 60694220 ~ 60695905 (+)
G423922 NA other downstream 2985545 61721537 ~ 61722024 (+)
G424079 NA other downstream 3369531 62105523 ~ 62105872 (+)
LOC110524265 LOC106613745 other downstream 3547160 62283054 ~ 62327772 (+)

Expression


Co-expression Network