LOC110524394 (LOC106613862)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110524394
gene name LOC106613862
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 66792622 ~ 66800072 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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Function


NR:

description
inhibitor of growth protein 5-like isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0008270 zinc ion binding molecular_function

KEGG:

id description
K11345 ING5; inhibitor of growth protein 5

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021603991.2 False 2641 mRNA 0.38 8 66794042 66800072
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XM_036978149.1 True 2507 mRNA 0.37 8 66794684 66800072

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110524391 LOC106613857 coding upstream 15904 66769014 ~ 66776718 (+)
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LOC110524384 LOC106613851 coding upstream 158350 66519837 ~ 66634272 (+)
LOC110524383 LOC106613850 coding upstream 302549 66482562 ~ 66490073 (+)
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G429001 NA non-coding upstream 84844 66707547 ~ 66707778 (+)
G428992 NA non-coding upstream 94623 66671245 ~ 66697999 (+)
G428857 NA non-coding upstream 134593 66656735 ~ 66658029 (+)
rpp21 rp21 non-coding downstream 40625 66840697 ~ 66884634 (+)
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G429103 NA non-coding downstream 87588 66887660 ~ 66887884 (+)
G429767 NA non-coding downstream 271719 67071791 ~ 67072079 (+)
G429771 NA non-coding downstream 273603 67073675 ~ 67073875 (+)
G428696 NA other upstream 650017 66142079 ~ 66142605 (+)
G427747 NA other upstream 1271242 65453856 ~ 65521380 (+)
LOC110524338 LOC106584398 other upstream 1763920 65024444 ~ 65028828 (+)
G427476 NA other upstream 1795484 64992101 ~ 64997138 (+)
LOC110522985 NA other upstream 2548093 64243153 ~ 64244790 (+)
G429156 NA other downstream 181877 66981949 ~ 67048164 (+)
LOC110524407 LOC106613876 other downstream 660657 67458540 ~ 67464323 (+)
G430796 LOC106613888 other downstream 1303107 68103179 ~ 68103534 (+)
LOC110524423 LOC106613476 other downstream 1412644 68212224 ~ 68214236 (+)
G434653 NA other downstream 4159538 70959610 ~ 70959932 (+)

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