LOC118964670


Basic Information

Item Value
gene id LOC118964670
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 80781794 ~ 80787795 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005051872.1
TGTGTGGTTGTCTGGGGGGTCAGAGGGGTGAAAGGGGCAGAAGTGGCTATGGCCAAGGGGATGGGTGGTAGGGGGTGCAGTAAATCAGTATTTCTAAAGTCTCACAGGAAGTCCTGTGGAACAGTGTCTGACATCCCTTCCTGTTGCGACAGACACAGTTGATTGGCAGTGCTGCGGTGATCCCCTCTAAAACCTGTCCTGGATCAGCCACCGCCGtccaaaataacaaaataacttTATCGACATCAGTTGGTTGGTGACAACAGTGCAGACAGATAAACGGGGCTTCATGGCAGTGTGAATGTAGCTCTAGGCTTGGAGCTGATAGGTGGACTGACGCCTCATTTGAGAACTCACATGGAATCAGGAAGGGGGAAGCAGACGTGATTGGTTTGTATTGGGAGAGAGGCGGGGACTGGGGAGTGGACAGCACCAAAACATGTCGGACAGTGATAGCCGTTTGGGTGGGTAGGGAGtcaaacagctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgcgacaTTGGGTGTATTTATGACAATAGTAGGCTGAGTATATCTCAATAATGATATAGGTTGATCCCATCGATCTTGTACTGTATTGGTCAGCCATTTGTCACTCTAAGCATTGTCATTGTGTATATGGATGTGTACTATAGAagtgagagtatgtgtgtgtgtgtcagtaaatGTACATGTGAGAGTATGtctaggtgagtgtgtgtgtaaccctGTACATTAATGTCTGTGCGATGCAAGTCCCTGTGTGTAGAGTGGCGGTAGAGGGGTCAGGCTCAGACTGGGATGAGACTCCGCCTGGGAGATAGGGGTCATGCTGGTTTGGGGGCcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttgggaAGTTATAGCTGGATTTAGTGGGCAGTAGTTAAAGTTGGGAGGTTATAGCTGGGTTTAGTgggcagtagttgaagttgggaagttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgagcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagcgggcagtagttgaagttgggaAGTTATAGCTGGGTTTAGTGGGTAAtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttggaagGTTACAGCTGGGATTAATTTTcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttgggaggttATAGCTGGGTTTAGTGGGCAGTAGTTGACGTTGGGAGGTTATATCTGGGTTTAGCgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttgggaggttACAGCTGGGTTTAATgggcagtagttgaagttgggaggttATAGCTGGGTTTAATGGGCAGTAGTTGACGTTGGGAGGTTATAGCTGGGTTTAGTGGGCAGTAGTTGACGTTGGGAGGTTATATCTGGGTTTAGCgggcagtagttgaagttgggaggttACAGCTGGGTTTAGTgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagcgggcagtagttgaagttgggaAGTTATAGCTGGGTTTAGTGGGTAAtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagcggtcagtagttgaagttgggaggttATAGCTGGGTTTAGTGGGCAGTAGTTGACGTTGGGAGGTTATATCTGGGTTTAGCgggcagtagttgaagttgggaggttACAGCTGGGTTTAGTGGGCGgtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttgggaAGTTATAGCTGGGTTTAGTGGGTAAtagttgaagttgggaggttATATCTGGGTTTAGCgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagcgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagagggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagcgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagcgggcagtagttgaagttgggaggttCTAGCTGGGTTTAGCgggcagtagttgaagttgggagATTACAGCTGGGTTTAATgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttgggagATTATAGCTGGGTTTAGCgggcagtagttgaagttgggaggttACAGCTGGGTTTAATGGGCAGTAGTTGAAGTTGAGAGGTTACAGCTGGGTTTAATggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagcgggcagtagttgaagttgggaggttCTAGCTGGGTTTAATgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttgggagATTATAACTGGGTTTAATGGGCAGTAGTTGAAGTTGAGAGGTTACAGCTGGGTTTAATgggcagtagttgaagttgggagGTTATAGCTGGGTTTAATGGGCAGTAGTTGACGTTGGGAGGTTATATCTGGGTTTAGCgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggtagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttgggaggttATATCTGGGTTTAGCgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagcgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagcgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagcgggcagtagttgaagttgggaggttCTAGCTGGGTTTAGCgggcagtagttgaagttgggaggttatagctgggtttagtgggcagtagttgaagttggga
>XR_005051873.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005051872.1 False 3100 mRNA 0.48 3 80781794 80787795
XR_005051873.1 True 2780 mRNA 0.48 3 80781794 80787795

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
mcm3l LOC106560381 coding downstream 191674 80573427 ~ 80590120 (-)
LOC118964669 LOC106581256 coding downstream 236121 80543930 ~ 80545673 (-)
LOC118964661 LOC106581256 coding downstream 256394 80518405 ~ 80525400 (-)
LOC110524644 NA coding downstream 275806 80504295 ~ 80505988 (-)
LOC118964662 LOC106581256 coding downstream 279573 80499708 ~ 80502221 (-)
bmb LOC106560378 coding upstream 21567 80809362 ~ 80818373 (-)
serpinb1 ileu coding upstream 52103 80839898 ~ 80861365 (-)
LOC110524659 LOC106560369 coding upstream 450187 81237982 ~ 81240184 (-)
LOC110524660 LOC106560371 coding upstream 477662 81265457 ~ 81271056 (-)
LOC110524661 LOC106560372 coding upstream 489471 81277266 ~ 81279193 (-)
G445518 NA non-coding downstream 120537 80657593 ~ 80661257 (-)
LOC118964666 NA non-coding downstream 343978 80421087 ~ 80438415 (-)
G445267 NA non-coding downstream 351422 80430144 ~ 80430372 (-)
G445265 NA non-coding downstream 355393 80426026 ~ 80426401 (-)
G445248 NA non-coding downstream 386463 80394926 ~ 80395331 (-)
G445596 NA non-coding upstream 16518 80804313 ~ 80806686 (-)
G445610 NA non-coding upstream 39374 80827169 ~ 80827490 (-)
G445613 NA non-coding upstream 46606 80834401 ~ 80834710 (-)
G445616 NA non-coding upstream 48866 80836661 ~ 80839422 (-)
G445622 NA non-coding upstream 74807 80862602 ~ 80862843 (-)
G445220 NA other downstream 520289 80245943 ~ 80261505 (-)
LOC118964653 LOC106581256 other downstream 555593 80223240 ~ 80233361 (-)
G445197 NA other downstream 604714 80176762 ~ 80177080 (-)
G445115 NA other downstream 794090 79982461 ~ 79987704 (-)
G444691 LOC106605670 other downstream 1050258 79730987 ~ 79731536 (-)
G446775 NA other upstream 1155490 81943285 ~ 81943611 (-)
G447220 NA other upstream 1602860 82390655 ~ 82391224 (-)
G447993 NA other upstream 2529718 83315161 ~ 83319715 (-)
G448079 NA other upstream 2722558 83510353 ~ 83520273 (-)
G448411 NA other upstream 3083807 83871602 ~ 83873308 (-)

Expression


Co-expression Network