G357139


Basic Information

Item Value
gene id G357139
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 209882 ~ 216811 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU405302
cactactctactactacactactctactactacactactctactactacactacaatactctactactacactactctactactacactacactactctactactacactactctaccactacactactctactactacactactctactactacactactctaccactacactactctactaaaccACTACACTACTcgactactacactactactaaactactctaccactactctaacactacactactcaaccactacactacactactctaccactactctactactacaatactctacccctactctcctctaccactacactactctaccaccacactacactactactactacactactactacacaactactacacaacactactgctactacactactctgctactacactactctgctactacactactctaccactacactacactactctactacaacactactctacaattacactactactatactactctactactacactacaatactactacactactctactacTACACTTCCACGACACTACAcaactctactactacactactctactactacactacactactactacactactctaccactacactacactactctactacaacactacactacactactctaccactactctactactacaatactctaccactacactactctaccactacactacactacacttctctactacaacactactctacaattacactactactacactactctactactacgctacactactactacactactctactactacactactctaccactacactacactactaaactactctaccactacactacaccactctactactatactactctaccactacactacactaatactacactactctaccgctacactacactactctactactctaccgCTACACTTCCACGACACTACACatctctactactacactactctaccactacactacaccactctactactacaccactctaccaatacactacactactaatacactactctaccactacactacactactctactacaacactactctactactacactactctaccactacgcTTCCACTATACTACACttccactatactacactactcgactactacactactctactattacactacattactactacactcctctactactacactaccctaCCACTACActttcactacactacacaactctactactacactgctctaccactactctaccactactataccactacactacactactctactactacactactctaccactagtctaccactactctaccactacactacaatacgctactactacactactataccactactctactactacactactctaccactacacaactactacactactctactacgacacacctctactactacactactctactactactctactctaccactactctactacactaccactacactactccactactactctaatactacactactctactactactctaccactacacttctctactactacactactactacactactctattATCACACTACTCTCCCACTACattactctaccactacactactctactaacacattactctaccactacactactctactaacacactactctaccactacaccactctaccagtacactactctaccattacacgactctaccactacactaccactagtcaaccactacactaccactactctaaaACTACACTACTcaaccactacactactgtaccaTTACACgactctaccactacactaccactaatctaccactacactactcaaccactacactactctacactacactattaccacaaTACTCtcccactacactactctacgcTACAACTACACTACTCAACTACTACACTACTCAACTACTACACCACTCTACcagtacactactctaccattacactactctaccactacactactcaACTACTACACTACTTAACTACTACACCACTCTACcagtacactactctaccattacacgactctaccactacactaccactagtcaaccactacactaccactactctaaaACTACACTACTcaaccactacactactctaccactacactactctaccactactctaccactacactactcaaccactacactactcaaccactacactactcaaccactacactactctactactacactactctaccactacactgttctactactacactactcaaCCACTACGCTACTcaaccactactctaccactacactgttctactactaccactactctaccactactctaccactactcaACCACTacgctactctaccactacactactctaccactacactattctaccactacactgttctactactacactacactactctactactacactacaatactctactactacactactctaccactacactgttctactactacactactcaaCCACTACGCTACTCTACCACTACTcaactactacactactctactactacactactctaccactacactgttctactactacactactctaccactacactactctaccactacactattctactactacactactcaactactacactactctactactacactactctaccactacactgttctactactacactactcaaCCACTACgctactctaccactactctactactacactactcaaCCACTACgctactctaccactactctactactacactactctaccactacactgttctactactacactactcaaCCACTACgctactctaccactactctactactacactactcaaCCACTACgctactctaccactactctactactacactactctaccactacactattctactactacactactcaactactacactactctactactacactacactactctactactacactacaatactctactactacactacaatactctaCCACTACGCTACTCTACCACTACTCAACCACTACgctactctaccactactctaccactactctactactacactactctaccactacactgttctactactacactactcaaCCACTACgctactctaccactactctactactacactactctaccactactctaccactacactactctaccactactctaccactacactgttctactactacactactcaaCCACTACgctactctaccactactctaccactacactactctaccactactctaccactactctaccactacactactctaccactactctaccactaagctactctctactactctctgcCTTCTGGGTCCAATGCATCTCTACTATATCACCAAGCCATAACAACTAACTCCATAAACAGTGTAAATCCAAAATGGCATCttaatccctatatagtgaccAGGTCAGTAGTTTCACTGCtctaatagggtgccatttggaaagcaGCAACAGTCTGAAACCTTCCAGTACCACAACTATTGTAACTAACATCCCAACCACTTCCGGTTTCATATACTTCCTGTTTCATCTACTGATGCAACTACCAAGctcaacacagagagaggtcaacacagagagaggtaaacacagctcaacacaaagagaggtcaacacagctcaacacagagagaggtcaacacagctcaacacaaagagaggtcaacacagagagaggtcaaCACAGCTCAACACAAAGAGAGGTCAACACAGCGCAACACAAAGAGAGGTCAACACAGCTCAACACAAAGAGAGGTCAACACAGCTCAATACGAAGAGAGATCAACACAGAGAGCTCAACACAAAGAGAGGTCAACACAGCTCAACACAAAAAGAGGTCAACACAGTGCAACACAAAGAGAGGTCAACACAGC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU405302 True 4004 lncRNA 0.42 4 209882 216811

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
palm2akap2 LOC106568584 coding upstream 23543 89048 ~ 186339 (+)
LOC110523064 LOC106572881 coding downstream 8198 224811 ~ 285133 (+)
LOC110524922 LOC106572882 coding downstream 79815 296626 ~ 312598 (+)
LOC110523070 inip coding downstream 193950 410761 ~ 416534 (+)
LOC110524924 ptbp3 coding downstream 265614 482425 ~ 599279 (+)
LOC110523098 NA coding downstream 516200 733011 ~ 737553 (+)
G357137 NA non-coding upstream 539 206569 ~ 209343 (+)
G357138 NA non-coding upstream 6580 202595 ~ 203302 (+)
G357135 NA non-coding upstream 11269 198324 ~ 198613 (+)
G357131 NA non-coding upstream 30530 179049 ~ 179352 (+)
G357130 NA non-coding upstream 30962 178663 ~ 178920 (+)
G357140 NA non-coding downstream 388 217199 ~ 217477 (+)
G357143 NA non-coding downstream 2954 219765 ~ 220018 (+)
G357146 NA non-coding downstream 7511 224322 ~ 224532 (+)
G357150 NA non-coding downstream 11222 228033 ~ 228234 (+)
G357136 NA other upstream 8240 200717 ~ 201642 (+)
G357564 NA other downstream 722257 939068 ~ 939873 (+)
G357565 NA other downstream 723424 940235 ~ 940741 (+)
G358042 NA other downstream 1171584 1388395 ~ 1390468 (+)
G358076 NA other downstream 1257984 1474795 ~ 1475734 (+)

Expression


Co-expression Network