G358446


Basic Information

Item Value
gene id G358446
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 1834553 ~ 1893316 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU407032
attatcttatgacagaccagctagatctactgtctatattaaattatgacagaacagctcgatttactgtctctattatattatgacagaccagctagatccactgtctattacattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagcaagatctactgtctctattatattatgacaaaacaGCTGGATCCACAaaatattacattatgacagaccagctatatatacactgtctctattatattatgacagaccagctagatctacggtctctattctattatgacagtgcaactagatctacggtctctattctattatgacagttcagctagatcttctgtctctattatattatgacagaacagctcgatttactgtctctattatattatgacagaccagctagatccactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatcttctgtctctattatattgtgacagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaacaTCTAGATCTGcggtgtctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtatctattatatta
>TU407035
attacattatgacagaccagctttatataatgtccctattatattacgacagaccagctcgatctactctcTATTAACTTTTggccgaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctattatattatgacagaccagctcaatctactgtctctattatattttgactacccagctagatctactgtctattatattatgacagagcagctagatccactgtttctattatattatgacagaccagctagttctactgtctaaattatataatgacaacccagcaatatctactgtctctaacttatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgacaggacatctagatctgctgtatctattatattatgacagaccagctcgatctaatgtctctattatattctgacagtgcagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagcaagatctactgtctctattatattatgacaaaacaGCTGGATCCACAaaatattacattatgacagaccagctatatatacactgtctctattatattatgacagaccagctagatctacggtctctattctattatgacagtgcaactagatctacggtctctattctattatgacagttcagctagatcttctgtctctattatattatgacagaacagctcgatttactgtctctattatattatgacagaccagctagatccactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatcttctgtctctattatattgtgacagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaacaTCTAGATCTGcggtgtctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtatctattatatta
>TU407040
ataTCCACCCACTCTATTACATGACAgaatagctagatctactgtttctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatattacagaccagctagttctactgtctctagtatattatgacaaaccagctagatctactgtctctattataatatgacataccagctagatctactgtctctatgtctctaatatattatgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatggcagaccagctacacatactgtctctatgtctctattatatcatgacagagtgctagatctactgtctatattgtattatgacagaccagctagctctactgtctctattatattatgacagactagctagatctactgtctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctacgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctcgattatatgatgacagaccagctcgatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaggagctagatctactgtctataatatattatgacagaccagctatatccacccaatctattacattatgacagactagctacatctactgtctctattatattatgacagaccagcgaaaTCTActgactatattatattatgacagagcagctagatctactgtctctattatattatgacacacgagctagatctactgtctctgttataatatgacagaccagctagatctactgtctctgttataatatgacagaccagctagttctactgtctctagtatattgtgacaaaccagctagatctacggtctctatcatattatgacagagcagctagatctatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctacggtctctaagtctctattatattgtgacagactagctagatctactgtctctattgtattatgacagaccagctacatatactgtctctatgtctctaatatattatgacagaccagctagatctactgtctctattgtattacgacagactagctagatatactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaccttctctattatattatgacagaggagctagatctactgtctataatatattatgacagacatgctaTATCCACCcaatctattacattatgacagactagctacatctactgtctctattatattatgacagaccagcgaaaTCTactgattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacaaaccagctagatctacggtgtctattatattatgacagagcagctagatctatggctctattgtattattacagaccaactagatctgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctcgattatatgatgacagaccagctcaatctactgtctcgattatatgatgacagaccagctcgatttactgtctctattatattatggcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaacaTCTAGATCTgctctgtctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctatgcatctattataatatgacaaaacagctagatccactgtctattacattatgacagaccagctatatatactgtctattatattatgacagaccagctagatctgctgactctattatattatgaaagtgcagctagatctacggtttatattctattatgacagatcagctagatctactgtctctattctattatgacagaccagctagatctactgtctcttaaattatggcagaccagctagatctattgtctctattatattataacagaccagctagaactaatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctattatattatgagagtggaactagatgtactgtctctattatagtatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagcttcatctactatctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatcatattatgacagaccagctagatctattgtctctgtcatattaagacagaccagctaaatataatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctatagtatattatgacagaccagctagatctattgtctctgtcatattaagacagaccagctaaatataatgtctattatattatgacagaccagctagatccactgtctctatgtttctattatattatgtcagaccagctcgatatactgtctctattatattatgacagaccagctagttctactgtctctatgtctctgttatattatgtcagaccagctcgatatactgtctctagtatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctgttgtcgctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaccagctagatctgctgtctctatgcatctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctaccgtctctattatattatgacagaacagctcgatttactgtctctattatattatgacagaccagctcgatctactctctctattaacttatggcagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattaaaatatgaaagaccagctcgatttactgtctctattatattatgacagacctgctagatctactgtctctagtatattatgacagaccagctagatctattgtctctgtcatattaagacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatatactgtctctattatattatgacagaccagctcgatctactctctctattaacttatggcagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgtcagaccagctagatatactgtctctattaaaatatgacagtaaatcgagctggtctgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctaatataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctgctgtcgctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaccagctagatctactgtctataatatattatgacagacaggctagatctactgtctctattatattatgacagaggagctagatctactgtctataatatattatgacagacaggctaTATCCACCcaatctattacattatgacagactagctatatctactgtctctattatattatgacagaccagcgaaaTCTActgactatattatattatgacagagcagctagatctactgtctctattatattatgacacaccagctagatctactgtctctgttatgacaaaccagctagatctacggtgtctattatattatgacagagcagctagatctatggctctattgtattattacagaccaactagatctactgtctcgattatatgatgacagaccagctcaatctactgtctctattatattatgacagactagctagatctactgtctattatattatgactagccagctatatctactgtctctattatattatgacagaccagctagttctactgtctaaaTGATATAATGACaacccagctatatctactgtctcaattataatatgacagaccagctcgatttactgtctctattatattatggcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaacaTCTAGATCTGctctgtatattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctatgcatctattatattatgacagggcagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgcatctattatattatgatagggcagctagatctactgtctctattatattatggcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaacaTCTAGATCTgctctgtctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctatgcatctattatattatgacagggcagctagatctactgtctctattatattatggcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaacaTCTAGATCTgctctgtctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctatgcatctattatattatgacagggcagctagatctactgtctctagtatattatgacagaccagctagatctattgtctctgtcatattaagacagaccagctaaatacactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatcttctgtctctattatattgtgacagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaacaTCTAGATCTGcggtgtctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtatctattatatta
>TU407045
ctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagtgcagctagatctacggtctctattctATTACGAcggatcagctagatctactgtatctattgtattatgacagaccagctagatctactgtctctattaaattttgacagaccagctagatctgctgtctctattatattatgacagaacagctcgatttactgtctctattatattatgacagaccagctagatctgctgtcgctatcatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatccactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatcttctgtctctattatattgtgacagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaacaTCTAGATCTGcggtgtctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtatctattatatta
>TU407034
gtctgctaactgcttgctatCCCGGCCTGCTATCTGCTagcttgccccggtctactaactgctagctgcCGGCcctggcctgctaactgctagcttaccTGCCCGGTCTGTACTGCTAGCCCATGCTAGCccatgctaactgcttgcttgctaaccaggcctgctaactgctagctactAGCTTGCTTTActcccggcctactaactgttagcatcggcctgctaactgtctgaatcgccgtgtccccagccagcccatccactcactggacccatatgttcacttggctatgcatgcctctctctaatatcaatatgcctcttccattactgtcctggttagtgattaccgtcttatttcactgtagatcctctagccctgctcaaagtgccttaaccaaccatgttgttccacctcctacatatgcgatgacatcaccttgTTTAAatatctctagagactatatctctctcttcattactcaatgcctaggtttacctccaatgtgcTCActtcctaccttacctttgtctgtgcactatgccttgaatctatgctattgtGCCCAGatacctgctccttttactctctgttctgaacatgctagacggccagttcgtgtagtctttagccgtacccctatcctacttctcctctgttcctctggtgatgtggaggttaatgtagtagagacagtagactagctggtctgccataatatgattgagacagtaaatatagctggtctgtcataatatattagagactgtagatgtagctggtctttcataataaagaagagacagtagatctagattgtctgtcatgatataattgagacagtagatctagctgtagtataatatagacagacagtaggtctagctggtctgtcataatctaattgagacagtagatctaactggtctgtcgtAAAATATTAGAGACAATAGACATAGCTCGTCCGTCATAACAACATttatacagtagatctagatggtctgtcatattataatagagacagcagatccagctggtctgtcataatataatagagacagtagttctagctggcgtgtcataatataataaagacagtagaagTAGCTGGTCGGTCAATATAAATGTGACAGTAtatctatcataatatattagagacttagagacagtagatctagctcgtctgtcaaaatatactagagacagtaaatctagctggtctatcataatataatagagattgtagatcaagctggtctgtcataacaacATTGAGAGAGCAGATCTTGCTGGTCTGCGATAATTTAATAGAGACCGTAgctttagctggtctgtcataatagaaaagagacagtagatcttgctggtctgccataatatatttgagacagatctagctggtatttaaaaaaatatctgagatagtagatctagttggtctgtcatattataatacagacaggAAATCTAGCTGGTATGccgtaatataaaagagacagtagatcatgCTCGTCTGCCATAATATTTTTGAGACAGAAGATCttgctggtatgtcatagtatattagagacagtcgatctagctggtctgtcataacataatcgagatagtagatcttgctggtctgtcataaaatagtgaagacagtagatctagctggtctgtcataatatagtagagacagtagatctagctagtctgccataatatagtagaggaagtagatctaactggtctgtcataaaatattaGAGAcaatagacatagctggtctgtcatagtataataaatacagtagatgtagcttgtctgtcataatataatagagacaatagatctagctggtctgtcataatataatagagacagtagatctagctggtctgtcataatataataaatacagtagatgtagctggtctgtcataatttaatagagataatagatctagatggtctgtcataatagagttgagacaatagatctagctggtctgtcataatatgagacagtaaatctagctggtctttcgtagtataattgagagagtagatctagctcattatgacagaccagatcgatatactgtctctattgtattatgacagacaagctagatctactgtctcttttatattatgacagaccagctagatctactttcgcTTTGTCTAtgttatattatgatagaccagctattTCCACCcactctattacattatgacagaatagctagatctactgtttctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattaatatatgacagaccagctagttctactgtctttAGTATATTATGaaaaaaccagctagatctactgtctctattataatatgacaatccagctcgatctactatctctatgtctctattatattacgacagagttctagatctgctgtctctattttataatgacagaccagctggatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctaatatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattgtattatggcagaccagctacacataatgtctctatgtctctattatatcatgacagagtgctagatctactgtctatattgtattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagactagctagatctactgtctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctacgtctctattatattatgacagaccagctagatcaatggtctctattgttttatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctgatatattatgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatggcagaccagctacacatactgtctctatgtctctattatatcatgacagagtgctagatctactgtctctattatattgtgacagactagctagatctactgtctctattgtattatgacagaccagctacatatactgtctctatgtctctaatatattatgacagaccagctagatctactgtctctattgtattacgacagactagctagatatactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaccttctctattatattatgacagaggagctagatctactgtctataatatattatgacagacatgctaTATCCACCcaatctattacattatgacagactagctacatctactgtctctattatattatgacagaccagcgaaaTCTactgattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacaaaccagctagatctacggtgtctattatattatgacagagcagctagatctatggctctattgtattattacagaccaactagatctgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctcgattatatgatgacagaccagctcaatctactgtctcgattatatgatgacagaccagctcgatttactgtctctattatattatggcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaacaTCTAGATCTgctctgtctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctatgcatctattataatatgacaaaacagctagatccactgtctattacattatgacagaccagctcgatttactgtctctattatattatgacaaccCAGCTCGATCTACTCTATTAACTTATGGccgaccagctaaatctactgtctctattatattatgacagaccagcttgatctaatgtctattatattatgacagtgcagctatatctactgtctctgttatattatgacagaccagctagatattttgtctctattaaattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtatctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctgctgtctctgttatattatgacagaccagctagatctactgtttctattatattatgtcagaccagcgatatctactgtctctattatattatgacaaaacagctagatccactgtctattacattatgacagaccagctagatcttctgtctctattatattgtgtcagaccaggtagatctgtctctattatattatgacagaccagctgtctctatgtatctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctattatattatgacagtgcagctatatctactgtctctattatgttatgacagaccagctagatctactgtctcttatattatgacagaccagctagatctaatgtctattatattatgacagtgcagctatatctactgtctctattatattatgacagaccagctcgatctactctctctattaacttatggcagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatcaaatgtctattatattatgacagaccagcgaagatctactgtctctattatattatgacaaaacagctagatccactgtctctattacattatgacagaccagctagatctactgtctctattacattgtgtcagaccaggtagatctactgtctctattatattatgacagaccagctgtctctat
>TU407038
atgacagaacagctcgatttactgtctattatattatgacagagcagctagatccactgtttctattatattatgacagaccagctagttctactgtctaaattatataatgacaacccagctatatctactgtctctattataatatgacagaccagctcgatttactgtctctattatattatgacagaccagctcgatctactctctctattaactTATGGCCGACCagatggatctactgtctctattatattatgacagaccagctagttctactgtctaaattatataatgacaacccagctatatctactgtctctatatgacagaccagctcgatttactgtctctattatattatgacagaccagctcgatctactctaTTAACTTATGGccgaccagctaaatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctctattttattatgacagaccagctagatctgctgtcggtattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgtcagaccagctaaatctactgtctctattatattatgacaaactagctagatctactgtctctattatattatgactacccagttagatctactgtctctattatattatgacagagcagctagatccactgtttctattatattatgacagaccagcgagatctactgtctctattatattatgacaagccagctagatctactttctctattataatatgacagaccagctcgatttactgtctctattttatgacagaccagctcgatctactctctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtatctattatattatgacagaccggctagatctactctctattatattatgacaagccagctagatccactgtctctattacattatgacagaccagctatatatacactgtctcttttatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctgctgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgaaggtgcagctagatctacggtctctattctattatgacggatcagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctatagtgtctactattttatgacagaccagctcgattcactttctctattatatgacagaccagctcgatttactgtctctattatataatgacagaccagctcgatctactctctctattaactTATGGCAGACcggctatatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctgtgtatctattatattatgacagaccagctagatctatagtctctatgtatctattatattatgacaggccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctatatatactgtctctattatattatgacagaccagctagctctaatgtctctataatattatgacagtgcagctatatctactgtctctattatattatgacagac
>TU407043
gctctattgtattattacagacaaactagatttactgtctctattatattatgaaagaccggctagatctactgtctataatataatatgacaaaccagctagatctactgtctcgattatatgatgacagaccagctcaatctactgtctctattatattatgacagactagctagatctactgtctctattatattatgactacccagctatatctactgtctctattatattatgacagaccagctagttctactgtctaaaTGATATAATGACaacccagctatatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaccagctagatctactgtctctatgtatctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaacagctcgatttactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgtcataccagctagatctactgtctctattatataatgacagaccagctagatctactgtctctatgtatctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaacagctcgatctactctctctattaacttatggcagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctatatctacggtctctattatattatgacagaccagcgagatctactgtctctattatattatgacaaaacagctagatccactgtctctattacattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagtgcagctagatctacggtcgcTATTCTATTATGTCAGACCaactagatcttctgtctcaattatattatgtcagaccagctcgatctactgtctcaattatattatgtcagaccagctcgatctactgtctctattatactatgacagaacagctagatctactgtctctattatattatgacaaaacagctagatccactgtctctaatacattatgacagaccagctatatatacactgtctatattatattatgacagtgcagctagatctacggtctctattctattatgacggatcagctagatctactgtctcttatattatgacagaccagcgagatctactgtgtctattatattatgacaaaacagctagatccactgtttctattatattatgacagaccagctagttctactgtctaaaTTATATAATGACAAcgcagctat
>TU407041
gtctgctaactgcttgctatCCCGGCCTGCTATCTGCTagcttgccccggtctactaactgctagctgcCGGCcctggcctgctaactgctagcttaccTGCCCGGTCTGTACTGCTAGCCCATGCTAGCccatgctaactgcttgcttgctaaccaggcctgctaactgctagctactAGCTTGCTTTActcccggcctactaactgttagcatcggcctgctaactgtctgaatcgccgtgtccccagccagcccatccactcactggacccatatgttcacttggctatgcatgcctctctctaatatcaatatgcctcttccattactgtcctggttagtgattaccgtcttatttcactgtagatcctctagccctgctcaaagtgccttaaccaaccatgttgttccacctcctacatatgcgatgacatcaccttgTTTAAatatctctagagactatatctctctcttcattactcaatgcctaggtttacctccaatgtgcTCActtcctaccttacctttgtctgtgcactatgccttgaatctatgctattgtGCCCAGatacctgctccttttactctctgttctgaacatgctagacggccagttcgtgtagtctttagccgtacccctatcctacttctcctctgttcctctggtgatgtggaggttaatgtagtagagacagtagactagctggtctgccataatatgattgagacagtaaatatagctggtctgtcataatatattagagactgtagatgtagctggtctttcataataaagaagagacagtagatctagattgtctgtcatgatataattgagacagtagatctagctgtagtataatatagacagacagtaggtctagctggtctgtcataatctaattgagacagtagatctaactggtctgtcgtAAAATATTAGAGACAATAGACATAGCTCGTCCGTCATAACAACATttatacagtagatctagatggtctgtcatattataatagagacagcagatccagctggtctgtcataatataatagagacagtagttctagctggcgtgtcataatataataaagacagtagaagTAGCTGGTCGGTCAATATAAATGTGACAGTAtatctatcataatatattagagacttagagacagtagatctagctcgtctgtcaaaatatactagagacagtaaatctagctggtctatcataatataatagagattgtagatcaagctggtctgtcataacaacATTGAGAGAGCAGATCTTGCTGGTCTGCGATAATTTAATAGAGACCGTAgctttagctggtctgtcataatagaaaagagacagtagatcttgctggtctgccataatatatttgagacagatctagctggtatttaaaaaaatatctgagatagtagatctagttggtctgtcatattataatacagacaggAAATCTAGCTGGTATGccgtaatataaaagagacagtagatcatgCTCGTCTGCCATAATATTTTTGAGACAGAAGATCttgctggtatgtcatagtatattagagacagtcgatctagctggtctgtcataacataatcgagatagtagatcttgctggtctgtcataaaatagtgaagacagtagatctagctggtctgtcataatatagtagagacagtagatctagctagtctgccataatatagtagaggaagtagatctaactggtctgtcataaaatattaGAGAcaatagacatagctggtctgtcatagtataataaatacagtagatgtagcttgtctgtcataatataatagagacaatagatctagctggtctgtcataatataatagagacagtagatctagctggtctgtcataatataataaatacagtagatgtagctggtctgtcataatttaatagagataatagatctagatggtctgtcataatagagttgagacaatagatctagctggtctgtcataatatgagacagtaaatctagctggtctttcgtagtataattgagagagtagatctagctcattatgacagaccagatcgatatactgtctctattgtattatgacagacaagctagatctactgtctcttttatattatgacagaccagctagatctactttcgcTTTGTCTAtgttatattatgatagaccagctattTCCACCcactctattacattatgacagaatagctagatctactgtttctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattaatatatgacagaccagctagttctactgtctttAGTATATTATGaaaaaaccagctagatctactgtctctattataatatgacaatccagctcgatctactatctctatgtctctattatattacgacagagttctagatctgctgtctctattttataatgacagaccagctggatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctattataatatgacataccagctagatctactgtctctatgtctctaatatattatgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatggcagaccagctacacatactgtctctatgtctctattatatcatgacagagtgctagatctactgtctatattgtattatgacagaccagctagctctactgtctctattatattatgacagactagctagatctactgtctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctacgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctcgattatatgatgacagaccagctcgatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaggagctagatctactgtctataatatattatgacagaccagctatatccacccaatctattacattatgacagactagctacatctactgtctctattatattatgacagaccagcgaaaTCTActgactatattatattatgacagagcagctagatctactgtctctattatattatgacacacgagctagatctactgtctctgttataatatgacagaccagctagatctactgtctctgttataatatgacagaccagctagttctactgtctctagtatattgtgacaaaccagctagatctacggtctctatcatattatgacagagcagctagatctatggctctattgtattatgacagaccatctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctattaaattatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgacaggccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagcgagatctactgtctctattatattatgacaagccagctagatccactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattataacagaccagcaagatctactgtctctatgtctctattatattttgtcagaccagctagatcttctgtctcaattatattatgtcagaccagctagatctactgtctcttatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctacggtcgcTATTCTATTATGTCAGACCaactagatcttctgtctcaattatattatgtcagaccagctcgatctactgtctcaattatattatgtcagaccagctcgatctactgtctctattatactatgacagaacagctagatctactgtctctcttatattatgacagaccagcaagatctactgtgtctattatattatgacaaaacagctagatccactgtctctaatac
>TU407042
atgacagaacagctcgatttactgtctattatattatgacagagcagctagatccactgtttctattatattatgacagaccagctagttctactgtctaaattatataatgacaacccagctatatctactgtctctattataatatgacagaccagctcgatttactgtctctattatattatgacagaccagctcgatctactctctctattaactTATGGCCGACCagatggatctactgtctctattatattatgacagaccagctagttctactgtctaaattatataatgacaacccagctatatctactgtctctatatgacagaccagctcgatttactgtctctattatattatgacagaccagctcgatctactctaTTAACTTATGGccgaccagctaaatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctctattttattatgacagaccagctagatctgctgtcggtattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgtcagaccagctaaatctactgtctctattatattatgacaaactagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactctctctattatattatgacaagccagctagatccactgtctctattacattatgacagaccagctatatatacactgtctcttttatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctgctgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgaagatgcagctagatctacggtctctattctattatgacggatcagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctatagtgtctattattttatgacagaccagctcgattcactttc
>TU407031
gtctgctaactgcttgctatCCCGGCCTGCTATCTGCTagcttgccccggtctactaactgctagctgcCGGCcctggcctgctaactgctagcttaccTGCCCGGTCTGTACTGCTAGCCCATGCTAGCccatgctaactgcttgcttgctaaccaggcctgctaactgctagctactAGCTTGCTTTActcccggcctactaactgttagcatcggcctgctaactgtctgaatcgccgtgtccccagccagcccatccactcactggacccatatgttcacttggctatgcatgcctctctctaatatcaatatgcctcttccattactgtcctggttagtgattaccgtcttatttcactgtagatcctctagccctgctcaaagtgccttaaccaaccatgttgttccacctcctacatatgcgatgacatcaccttgTTTAAatatctctagagactatatctctctcttcattactcaatgcctaggtttacctccaatgtgcTCActtcctaccttacctttgtctgtgcactatgccttgaatctatgctattgtGCCCAGatacctgctccttttactctctgttctgaacatgctagacggccagttcgtgtagtctttagccgtacccctatcctacttctcctctgttcctctggtgatgtggaggttaatgtagtagagacagtagactagctggtctgccataatatgattgagacagtaaatatagctggtctgtcataatatattagagactgtagatgtagctggtctttcataataaagaagagacagtagatctagattgtctgtcatgatataattgagacagtagatctagctgtagtataatatagacagacagtaggtctagctggtctgtcataatctaattgagacagtagatctaactggtctgtcgtAAAATATTAGAGACAATAGACATAGCTCGTCCGTCATAACAACATttatacagtagatctagatggtctgtcatattataatagagacagcagatccagctggtctgtcataatataatagagacagtagttctagctggcgtgtcataatataataaagacagtagaagTAGCTGGTCGGTCAATATAAATGTGACAGTAtatctatcataatatattagagacttagagacagtagatctagctcgtctgtcaaaatatactagagacagtaaatctagctggtctatcataatataatagagattgtagatcaagctggtctgtcataacaacATTGAGAGAGCAGATCTTGCTGGTCTGCGATAATTTAATAGAGACCGTAgctttagctggtctgtcataatagaaaagagacagtagatcttgctggtctgccataatatatttgagacagatctagctggtatttaaaaaaatatctgagatagtagatctagttggtctgtcatattataatacagacaggAAATCTAGCTGGTATGccgtaatataaaagagacagtagatcatgCTCGTCTGCCATAATATTTTTGAGACAGAAGATCttgctggtatgtcatagtatattagagacagtcgatctagctggtctgtcataacataatcgagatagtagatcttgctggtctgtcataaaatagtgaagacagtagatctagctggtctgtcataatatagtagagacagtagatctagctagtctgccataatatagtagaggaagtagatctaactggtctgtcataaaatattaGAGAcaatagacatagctggtctgtcatagtataataaatacagtagatgtagcttgtctgtcataatataatagagacaatagatctagctggtctgtcataatataatagagacagtagatctagctggtctgtcataatataataaatacagtagatgtagctggtctgtcataatttaatagagataatagatctagatggtctgtcataatagagttgagacaatagatctagctggtctgtcataatatgagacagtaaatctagctggtctttcgtagtataattgagagagtagatctagctcattatgacagaccagatcgatatactgtctctattgtattatgacagacaagctagatctactgtctcttttatattatgacagaccagctagatctactttcgcTTTGTCTAtgttatattatgatagaccagctattTCCACCcactctattacattatgacagaatagctagatctactgtttctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattaatatatgacagaccagctagttctactgtctttAGTATATTATGaaaaaaccagctagatctactgtctctattataatatgacaatccagctcgatctactatctctatgtctctattatattacgacagagttctagatctgctgtctctattttataatgacagaccagctggatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctattataatatgacataccagctagatctactgtctctatgtctctaatatattatgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatggcagaccagctacacatactgtctctatgtctctattatatcatgacagagtgctagatctactgtctatattgtattatgacagaccagctagctctactgtctctattatattatgacagactagctagatctactgtctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctacgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctcgattatatgatgacagaccagctcgatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaggagctagatctactgtctataatatattatgacagaccagctatatccacccaatctattacattatgacagactagctacatctactgtctctattatattatgacagaccagcgaaaTCTActgactatattatattatgacagagcagctagatctactgtctctattatattatgacacacgagctagatctactgtctctgttataatatgacagaccagctagatctactgtctctgttatattatgacagacaagctagatctactgtctcgattatattatgacagaccagctagatctactgtctcgattatatgatgacagaccagctcgatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaggagctagatctactgtctataatatattatgacagaccagctatatccacccaatctattacattatgacagactagctacatctactgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctacggtctctaagtctctattatattgtgacagactagctagatctactgtctctattgtattatgacagaccagctacatatactgtctctatgtctctaatatattatgacagaccagctagatctactgtctctattgtattacgacagactagctagatatactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaccttctctattatattatgacagaggagctagatctactgtctataatatattatgacagacatgctaTATCCACCcaatctattacattatgacagactagctacatctactgtctctattatattatgacagaccagcgaaaTCTactgattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacaaaccagctagatctacggtgtctattatattatgacagagcagctagatctatggctctattgtattattacagaccaactagatctgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgatattatgacagaccagctagatctactgtctcgattatatgatgacagaccagctcaatctactgtctcgattatatgatgacagaccagctcgatttactgtctctattatattatggcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaacaTCTAGATCTgctctgtctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctatgcatctattataatatgacaaaacagctagatccactgtctattacattatgacagaccagctatatatactgtctattatattatgacagaccagctagatctgctgactctattatattatgaaagtgcagctagatctacggtttatattctattatgacagatcagctagatctactgtctctattctattatgacagaccagctagatctactgtctcttaaattatggcagaccagctagatctattgtctctattatattataacagaccagctagaactaatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctattatattatgagagtggaactagatgtactgtctctattatagtatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagcttcatctactatctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatcatattatgacagaccagctagatctattgtctctgtcatattaagacagaccagctaaatataatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctatagtatattatgacagaccagctagatctattgtctctgtcatattaagacagaccagctaaatataatgtctattatattatgacagaccagctagatccactgtctctatgtttctattatattatgtcagaccagctcgatatactgtctctattatattatgacagaccagctagttctactgtctctatgtctctgttatattatgtcagaccagctcgatatactgtctctagtatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctgttgtcgctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaccagctagatctgctgtctctatgcatctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctaccgtctctattatattatgacagaacagctcgatttactgtctctattatattatgacagaccagctcgatctactctctctattaacttatggcagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattaaaatatgaaagaccagctcgatttactgtctctattatattatgacagacctgctagatctactgtctctagtatattatgacagaccagctagatctattgtctctgtcatattaagacagaccagctaaatataatgtctattatattatgacagaccagctagatccactgtctctatgtctctattatattatgtcagaccagctcgatatactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctgctgtcgctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaccagctagatctactgtctctatgtatctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaacagctcgatttactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaccagctagatctactgtctctaagtatctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatatactgtctctattatattatgacagaccagctcgatctactctctctattaacttatggcagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgtcagaccagctagatatactgtctctattaaaatatgacagtaaatcgagctggtctgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctaatataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctgctgtcgctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctctattatattatgtcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaccagctagatctactgtctataatatattatgacagacaggctagatctactgtctctattatattatgacagaggagctagatctactgtctataatatattatgacagacaggctaTATCCACCcaatctattacattatgacagactagctatatctactgtctctattatattatgacagaccagcgaaaTCTActgactatattatattatgacagagcagctagatctactgtctctattatattatgacacaccagctagatctactgtctctgttatgacaaaccagctagatctacggtgtctattatattatgacagagcagctagatctatggctctattgtattattacagaccaactagatctactgtctcgattatatgatgacagaccagctcaatctactgtctctattatattatgacagactagctagatctactgtctctattatattatgactacccagctatatctactgtctctattatattatgacagaccagctagttctactgtctaaaTGATATAATGACaacccagctatatctactgtctcaattataatatgacagaccagctcgatttactgtctctattatattatggcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaacaTCTAGATCTgctctgtctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctatgcatctattatattatgacagggcagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgcatctattatattatgacagggcagctagatctactgtctctattatattatggcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaacaTCTAGATCTgctctgtctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctatgcatctattatattatgacagggcagctagatctactgtctctattatattatggcagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaacaTCTAGATCTgctctgtctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctatgcatctattatattatgacagggcagctagatctactgtctctagtatattatgacagaccagctagatctattgtctctatgtctctattatattgtgtcagaccagctagatctactgtctctattatat

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU407032 False 644 lncRNA 0.35 3 1834553 1862787
TU407035 False 1007 lncRNA 0.35 3 1834553 1835997
TU407040 False 5187 lncRNA 0.35 7 1834553 1887053
TU407045 False 597 lncRNA 0.36 4 1834553 1858749
TU407034 False 4999 lncRNA 0.37 7 1836039 1893316
TU407038 False 1749 lncRNA 0.36 3 1837406 1847704
TU407043 False 1459 lncRNA 0.35 2 1838408 1875775
TU407041 False 4222 TUCP 0.38 6 1844824 1893316
TU407042 False 1023 lncRNA 0.36 2 1846341 1847704
TU407031 True 8176 lncRNA 0.36 6 1877307 1893316

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110517810 trabd2a coding downstream 358853 1335667 ~ 1475700 (-)
LOC110523084 rnf170 coding downstream 612859 1214832 ~ 1221694 (-)
LOC118964538 NA coding downstream 706935 1090907 ~ 1127618 (-)
LOC110523115 LOC106572830 coding downstream 783475 1036859 ~ 1051078 (-)
LOC110523114 thap1 coding downstream 819179 1012745 ~ 1015374 (-)
LOC110523086 LOC106572646 coding upstream 15633 1908949 ~ 1910347 (-)
LOC118964539 NA coding upstream 115818 2009134 ~ 2060858 (-)
rassf6 LOC106572546 coding upstream 1263367 3154684 ~ 3185209 (-)
lpar1 LOC106572527 coding upstream 1498851 3392167 ~ 3453780 (-)
LOC118964540 NA coding upstream 1604034 3497350 ~ 3498234 (-)
G358289 NA non-coding downstream 132384 1701862 ~ 1702169 (-)
G358285 NA non-coding downstream 135471 1698834 ~ 1699082 (-)
G358280 NA non-coding downstream 137698 1696116 ~ 1696855 (-)
G358269 NA non-coding downstream 154089 1673076 ~ 1680464 (-)
G358265 NA non-coding downstream 168789 1665508 ~ 1665764 (-)
G358467 NA non-coding upstream 8558 1901874 ~ 1904899 (-)
G358476 NA non-coding upstream 21027 1914343 ~ 1914620 (-)
G358483 NA non-coding upstream 32031 1925347 ~ 1925573 (-)
G358503 NA non-coding upstream 51959 1945275 ~ 1945493 (-)
G358508 NA non-coding upstream 65052 1958368 ~ 1958572 (-)
G358126 NA other downstream 535902 1295528 ~ 1298651 (-)
G357797 NA other downstream 1015806 817154 ~ 818747 (-)
ythdc1 ythdc1 other downstream 1097985 724581 ~ 759382 (-)
G357751 NA other downstream 1142855 690811 ~ 691698 (-)
G357278 NA other downstream 1589529 244749 ~ 245024 (-)
G359712 NA other upstream 1181229 3074545 ~ 3080338 (-)
G359752 NA other upstream 1299197 3192513 ~ 3193105 (-)
G359989 NA other upstream 1732032 3625348 ~ 3625776 (-)
G360015 NA other upstream 1820916 3714232 ~ 3715552 (-)
G360345 NA other upstream 1854920 3748236 ~ 3748718 (-)

Expression


Co-expression Network