G361170


Basic Information

Item Value
gene id G361170
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 5080578 ~ 5081868 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU410361
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>TU410363
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>TU410364
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>TU410365
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>TU410367
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>TU410368
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>TU410370
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Function

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU410361 False 859 lncRNA 0.37 3 5080578 5081868
TU410363 False 736 lncRNA 0.38 4 5080578 5081868
TU410364 False 766 lncRNA 0.38 3 5080578 5081868
TU410365 False 904 TUCP 0.38 2 5080578 5081868
TU410367 False 928 TUCP 0.37 3 5080578 5081868
TU410368 False 841 lncRNA 0.37 3 5080578 5081868
TU410370 True 838 lncRNA 0.37 3 5080578 5081868

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
nars1 sync coding downstream 432626 4639020 ~ 4647952 (-)
fech fech coding downstream 442447 4615001 ~ 4638131 (-)
LOC110513199 dcc coding downstream 663047 3782114 ~ 4417531 (-)
LOC110523109 lppr1 coding downstream 1410705 3644170 ~ 3669873 (-)
LOC110524935 rab27b coding upstream 389161 5471029 ~ 5564365 (-)
LOC110523123 LOC106572171 coding upstream 863296 5945164 ~ 5954687 (-)
LOC110523124 wdr7 coding upstream 1012101 6093969 ~ 6436847 (-)
LOC110524940 LOC106572087 coding upstream 1355398 6437266 ~ 6484290 (-)
LOC110523127 LOC106572117 coding upstream 1423513 6505381 ~ 6510017 (-)
G361100 NA non-coding downstream 73381 5006773 ~ 5007197 (-)
G361111 NA non-coding downstream 107755 4972306 ~ 4972823 (-)
G361103 NA non-coding downstream 115247 4964928 ~ 4965331 (-)
G361098 NA non-coding downstream 122043 4957907 ~ 4958535 (-)
G361048 NA non-coding downstream 199592 4879779 ~ 4880986 (-)
G361179 NA non-coding upstream 17795 5099663 ~ 5100671 (-)
G361191 NA non-coding upstream 47259 5129127 ~ 5129871 (-)
G361208 NA non-coding upstream 74203 5156071 ~ 5158127 (-)
G361222 NA non-coding upstream 111367 5193235 ~ 5193753 (-)
G361245 NA non-coding upstream 168824 5250692 ~ 5251225 (-)
G360703 NA other downstream 340876 4738312 ~ 4739702 (-)
G360610 NA other downstream 529651 4550346 ~ 4550927 (-)
G360532 NA other downstream 780553 4299392 ~ 4300025 (-)
G360345 NA other downstream 1331860 3748236 ~ 3748718 (-)
G363470 LOC106572095 other upstream 1461807 6543675 ~ 6554715 (-)
LOC110524941 LOC106572051 other upstream 1520137 6562531 ~ 6726634 (-)
G364322 NA other upstream 3221399 8303267 ~ 8304183 (-)
G364754 NA other upstream 3965674 9047542 ~ 9099000 (-)

Expression


Co-expression Network