G361683


Basic Information

Item Value
gene id G361683
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 5855193 ~ 5858759 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU411046
tacttttagaatgggtagttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatggatactgttagaatggacactgttagaatggatactgttagaatgggtagttagaatggtactgttagaatggatactgttagaatggatacggttagaatgggtagttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatgggtactgttagatggatactgttaggatggatactgttagaatgggtacttttagaatgggtagttagaatggatactgttagaatggatacttttagaatggatactggatactgttagaatggattctggatactgttagaatggatactgttagaatggacactgttagaatgggtactgttagaatggatactggatactgttagaatgtatactggatactgttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatacttatagaatgggtagttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatacttttagaatgggtagttagaatggatactgttaggatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatggatactgttagaatggctacttttagaatgggtagttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaattggtagttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatgggtagttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatgggtactgttagatggatactgttaggatgggtactgttagaatggatacttttagaatgaatactgg
>TU411047
gaatggatactgttagaatggatacttttagaatgggtagttagaatggatactgttaggatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatgggtagttagattgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatgggtagttagaatgggtactgtttgaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatgggtactgttagatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatatttactggatactgttagaatggatactgttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatacttatagaatgggtagttagaatggatactgttagaatggatacttttagaatggatactggatactgttagaatgtatactggatactgttagaatggatactgttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaaggGATACttatagaatgggtagttagaaatgatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatacttatagaatgggtagttagaaaggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatacttttagaatgggtagttagaatggatactgttaggatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatgggtagttagattgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatgggtagttagaatgggtactgtttgaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatgggtactgttagatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatatttactggatactgttagaatggatactgttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatacttatagaatgggtagttagaatggatactgttagaatggatacttttagaatggatactggatactgttagaatggattctggatactgttagaatggatactgttagaatggacactgttagaatgggtactgttagaatggatactggatactgttagaatgtatactggatactgttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatacttatagaatgggtagttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatacttttagaatgggtagttagaatggatactgttaggatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatggatactgttagaatggctacttttagaatgggtagttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaattggtagttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatgggtagttagaatgggtactgttagaatggatactgttagaatggatactgttagaatggatactggatactgttagaatgggtactgttagatggatactgttaggatgggtactgttagaatggatacttttagaatgaatactgg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU411046 False 1218 lncRNA 0.35 2 5855193 5858759
TU411047 True 2019 lncRNA 0.35 2 5855964 5858759

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110522836 LOC105008486 coding upstream 94245 5672649 ~ 5760948 (+)
LOC110524936 NA coding upstream 277253 5577014 ~ 5577940 (+)
LOC110524934 LOC106572350 coding upstream 396328 5417468 ~ 5458865 (+)
tcf4 tcf4 coding upstream 515854 4908459 ~ 5339341 (+)
LOC110523121 LOC106572199 coding upstream 1184608 4654146 ~ 4670585 (+)
LOC110523126 LOC106572095 coding downstream 629643 6488402 ~ 6555494 (+)
LOC118964554 angptl2 coding downstream 1143693 7002452 ~ 7031982 (+)
LOC118964556 NA coding downstream 1872225 7730984 ~ 7741925 (+)
mapkap1 mapkap1 coding downstream 1883488 7742247 ~ 7868565 (+)
slc27a6 slc27a6 coding downstream 2391400 8250159 ~ 8289257 (+)
G361681 NA non-coding upstream 2702 5845276 ~ 5852491 (+)
G361680 NA non-coding upstream 6139 5841624 ~ 5849054 (+)
G361665 NA non-coding upstream 54375 5800531 ~ 5800818 (+)
G361652 NA non-coding upstream 69899 5784959 ~ 5785294 (+)
G361639 NA non-coding upstream 81061 5773530 ~ 5774132 (+)
G361677 NA non-coding downstream 6113 5864872 ~ 5897405 (+)
G361707 NA non-coding downstream 97232 5955991 ~ 5956201 (+)
G361709 NA non-coding downstream 98382 5957141 ~ 5957366 (+)
G361712 NA non-coding downstream 102015 5960774 ~ 5961024 (+)
G361713 NA non-coding downstream 102715 5961474 ~ 5961812 (+)
G360985 NA other upstream 555790 5296870 ~ 5299403 (+)
G360276 sync other upstream 1207193 4639016 ~ 4648000 (+)
G360287 NA other upstream 1307337 4547035 ~ 4547856 (+)
G360261 NA other upstream 1435124 4419741 ~ 4420069 (+)
G360234 NA other upstream 1509676 4344082 ~ 4345517 (+)
G362297 zbtb43 other downstream 1327167 7185926 ~ 7189819 (+)
G362554 NA other downstream 1831681 7690440 ~ 7692514 (+)
G362662 NA other downstream 2060163 7918922 ~ 7919565 (+)
cdc42se2 cdc42se2 other downstream 2916573 8775134 ~ 8849107 (+)
G364850 NA other downstream 3370079 9228838 ~ 9229231 (+)

Expression


Co-expression Network