G364257


Basic Information

Item Value
gene id G364257
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 8188808 ~ 8195134 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU414084
tagaggtagatagagggatagaggtagagagaggtagatagaggtagatagaggtagatagagggatagaggtagatagagggatagaggtagagagaggtagagagaggtagatagaggtagatagagggatagaggtagatagagggatagaggtagatagagggatagagggatagaggtagatagagggatagaggtagatagagggatagaggtagagagaggggtagaggtagatagagggatagaggtaaatagagggatagaggtagatagagggatagaggtagatagagagatagaggtaaagagagGTAaggtatagagggatagaggtaagggatagaggtatatagaggtagatagaggtaagggatagagatagatagaggtaagggatagaggtagatagtggcatagaggtagatagagggatagaggtagcaagagggatagaggtagatataggtttagagggatagaggtagatagaggtagataaAGGGATAGAGGTAAAGAGAGGTAAGGTATAGAGGTAGATAGGGGGATAGAggtatagaggtagatagagggatgtagggatagaggtagatagaggtagatagagagatagaaggatagaggtagatagaggtagatagaggtggatagagggatagaggtagagagagggatagaggtagagggatagaggtagatagagggatagaggtagatagaggtggatagagggatagaggtagagagagggatagaggtagatagagggatagaggtagagagaggggtagaggtagatagagggatagaggtaaatagagggatagaggtagatagaggtaaaGAGAGgtaaggtatagagggatagaggtaagggatagaggtatatagaggtagatagaggtaagggatagagatagatagaggtaagggatagaggtagatagtggcatagaggtagatagagggatagaggtagcaagagggatagaggtagatataggtttagagggatagaggtagatagaggtagataaAGGGATAGAGGTAAAGAGAGGTAAGGTATAGAGGTAGAtagggggatagaggtagatagaggtatagaggtagatagagggatgtagggatagaggtagatagagggatagagggatagaggtagatagagggatagaggtagatagagcgatagagggatagaggtagatagaggtagatagagggatagaggtagatagagggatagaggtagatagagggatagaggtagatagagggatagaggtatagaggtagatagagggatagaggtatagaggtagatagagggatagaggtagatagagggata
>TU414086
tagaggtagatagagggatagaggtagagagaggtagatagaggtagatagaggtagatagagggatagaggtagatagagggatagaggtagagagaggtagagagaggtagatagaggtagatagagggatagaggtagatagagggatagaggtagatagagggatagagggatagaggtagatagagggatagaggtagatagagggatagaggtagagagaggggtagaggtagatagagggatagaggtaaatagagggatagaggtagatagagggatagaggtagatagagagatagaggtaaagagagGTAaggtatagagggatagaggtaagggatagaggtatatagaggtagatagaggtaagggatagagatagatagaggtaagggatagaggtagatagtggcatagaggtagatagagggatagaggtagcaagagggatagaggtagatataggtttagagggatagaggtagatagaggtagataaAGGGATAGAGGTAAAGAGAGGTAAGGTATAGAGGTAGATAGGGGGATAGAggtatagaggtagatagagggatgtagggatagaggtagatagaggtagatagagagatagaaggatagaggtagatagaggtagatagaggtggatagagggatagagg

Function

NR:

description
zinc finger CCCH domain-containing protein 13 isoform X3

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU414084 False 1354 lncRNA 0.44 8 8188808 8195134
TU414086 True 665 lncRNA 0.43 5 8191910 8195134

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110523137 pbx3 coding downstream 466681 7593362 ~ 7722127 (-)
mvb12ba mvb12b coding downstream 751889 7394813 ~ 7436919 (-)
LOC110523135 lmx1b coding downstream 821011 7272318 ~ 7367797 (-)
LOC110523134 zbtb43 coding downstream 994374 7187898 ~ 7194434 (-)
LOC118964555 NA coding downstream 1312884 6875316 ~ 6875924 (-)
LOC110523142 LOC106571805 coding upstream 11357 8206491 ~ 8229291 (-)
hint1 hint1 coding upstream 565697 8760831 ~ 8765948 (-)
LOC110524946 LOC106571878 coding upstream 662483 8857617 ~ 8864575 (-)
syk syk coding upstream 950003 9145137 ~ 9199533 (-)
LOC110523157 lyz2 coding upstream 1108510 9303644 ~ 9306869 (-)
G364255 NA non-coding downstream 9318 8179261 ~ 8179490 (-)
G364251 NA non-coding downstream 18449 8170041 ~ 8170359 (-)
G364250 NA non-coding downstream 18877 8169719 ~ 8169931 (-)
G364249 NA non-coding downstream 19586 8169014 ~ 8169222 (-)
G364240 NA non-coding downstream 48537 8139804 ~ 8140271 (-)
G364259 NA non-coding upstream 687 8195821 ~ 8196306 (-)
G364312 NA non-coding upstream 90881 8286015 ~ 8289236 (-)
G364318 NA non-coding upstream 110117 8305251 ~ 8307147 (-)
G364316 NA non-coding upstream 111372 8306506 ~ 8306983 (-)
G364323 NA non-coding upstream 114504 8309638 ~ 8310134 (-)
LOC110524941 LOC106572051 other downstream 1462828 6562531 ~ 6726634 (-)
G363470 LOC106572095 other downstream 1634093 6543675 ~ 6554715 (-)
LOC110523123 LOC106572171 other downstream 2234557 5945164 ~ 5954687 (-)
G361170 NA other downstream 3106940 5080578 ~ 5081868 (-)
G360703 NA other downstream 3449106 4738312 ~ 4739702 (-)
G364322 NA other upstream 108133 8303267 ~ 8304183 (-)
G364754 NA other upstream 852408 9047542 ~ 9099000 (-)
G365752 NA other upstream 994535 9189669 ~ 9190098 (-)
G368612 ctxn3 other upstream 3938918 12134052 ~ 12136790 (-)
G368921 NA other upstream 4510432 12705566 ~ 12706092 (-)

Expression


Co-expression Network