G375319


Basic Information

Item Value
gene id G375319
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 19111174 ~ 19112553 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU426698
ctcacacacacagagccagcaGAATCCAGATGGATGCTTGGCTCCTGACAGTGGAAGTGCCTGGGTTGGATCCAGAGTGAGACTTAATTCTTATGAAAGGTCGGATGTTTTGTACATCTTCTTTAAAAAAAGACATGATTCTATTGGTATTGAGACATGATCCTCTTGGTATTGAGACATGATCCTCTTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTCTTGATATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATCATCCCATTGGTATTGAGACATGATCCTCTTGATATTGAGACATGATCCTCTTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGAATTTAGACATGATTCTATTGGTACTGAGACATGATTCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATCATCCCATTGGTATTGAGACATGATCCTATAGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATTCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGATATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATAGGTATTGAGACATGATCCTATTGGAATTGAGACATGATTCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGAATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGAcatgactctctttctctctctctgaaatggAAAAAAGATTCCCATCCCAGATTTCAATCGTCAAGTCACATTAGCTAATCATTTTAGCCTGTCATGTGAAGGACAAACATACGCTGTTTTGAAATCCTCTGCTGGTTTCATTCTGGT
>TU426703
ctcacacacacagagccagcaGAATCCAGATGGATGCTTGGCTCCTGACAGTGGAAGTGCCTGGGTTGGATCCAGAGTGAGACTTAATTCTTATGAAAGGTCGGATGTTTTGTACATCTTCTTTAAAAAAAGACATGATTCTATTGGTATTGAGACATGATCCTCTTGGTATTGAGACATGATCCTCTTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTCTTGATATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATCATCCCATTGGTATTGAGACATGATCCTCTTGATATTGAGACATGATCCTCTTGGTATTGAGACATCATCCCATTGGTATTGAGACATGATCCTATAGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATTCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGATATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATAGGTATTGAGACATGACCCTATTGGAATTGAGACATGATTATATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATAGGTATTGAGACATGATCCTATTGGAATTGAGACATGATTCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGAATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGACATGATCCTATTGGTATTGAGAcatgactctctttctctctctctgaaatggAAAAAAGATTCCCATCCCAGATTTCAATCGTCAAGTCACATTAGCTAATCATTTTAGCCTGTCATGTGAAGGACAAACATACGCTGTTTTGAAATCCTCTGCTGGTTTCATTCTGGT

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106534789 isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU426698 False 1006 lncRNA 0.38 4 19111174 19112553
TU426703 True 940 lncRNA 0.38 2 19111174 19112553

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110523370 fa69b coding upstream 532946 18558152 ~ 18578228 (+)
egfl7 LOC106568866 coding upstream 605032 18487620 ~ 18506142 (+)
LOC110523366 nsa2 coding upstream 688916 18415774 ~ 18422258 (+)
LOC110523365 LOC106568911 coding upstream 701048 18396328 ~ 18410126 (+)
arhgef28a LOC106568988 coding upstream 934139 18067350 ~ 18177035 (+)
LOC110523377 LOC106568724 coding downstream 245718 19358271 ~ 19364089 (+)
LOC110523383 LOC106568686 coding downstream 387051 19499604 ~ 19512291 (+)
LOC110523391 LOC106568645 coding downstream 938840 20051393 ~ 20381619 (+)
LOC110523393 LOC106568920 coding downstream 1277977 20390530 ~ 20414156 (+)
LOC110522816 LOC106568602 coding downstream 1395521 20508074 ~ 20759255 (+)
G375115 NA non-coding upstream 56082 19054603 ~ 19055092 (+)
G375021 NA non-coding upstream 145718 18883103 ~ 18965456 (+)
G375041 NA non-coding upstream 163006 18896463 ~ 18948168 (+)
G375018 NA non-coding upstream 236099 18871112 ~ 18875075 (+)
G375019 NA non-coding upstream 244793 18864998 ~ 18866381 (+)
G375322 NA non-coding downstream 1018 19113571 ~ 19114533 (+)
G375365 NA non-coding downstream 43364 19155917 ~ 19156182 (+)
G375369 NA non-coding downstream 46762 19159315 ~ 19159534 (+)
G375374 NA non-coding downstream 49699 19162252 ~ 19162581 (+)
G375421 NA non-coding downstream 140374 19252927 ~ 19253244 (+)
G373726 NA other upstream 1403417 17704113 ~ 17707757 (+)
G372618 LOC105030512 other upstream 2228989 16870434 ~ 16882185 (+)
G372373 NA other upstream 2372674 16735642 ~ 16738500 (+)
G372281 LOC106569177 other upstream 2890241 16218328 ~ 16220933 (+)
G376320 NA other downstream 870708 19983261 ~ 19983848 (+)
G377022 NA other downstream 1478927 20591480 ~ 20596863 (+)
LOC110522817 LOC106568462 other downstream 1718705 20831111 ~ 20842676 (+)
LOC110523400 LOC106568542 other downstream 1995616 21108129 ~ 21160149 (+)

Expression


Co-expression Network